bitscore colors: <40, 40-50 , 50-80, 80-200, >200
BLASTP 2.2.24+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for composition-based statistics: Alejandro A. Schaffer,
L. Aravind, Thomas L. Madden, Sergei Shavirin, John L. Spouge, Yuri
I. Wolf, Eugene V. Koonin, and Stephen F. Altschul (2001),
"Improving the accuracy of PSI-BLAST protein database searches with
composition-based statistics and other refinements", Nucleic Acids
Res. 29:2994-3005.
Database: kyva
112,920 sequences; 47,500,486 total letters
Query= Eten_3837_orf4
Length=106
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Hs22041576 34.7 0.039
> Hs22041576
Length=414
Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.039, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/63 (46%), Positives = 36/63 (57%), Gaps = 0/63 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAVAAA 62
AV+ AV AV AV AV+ A A + AV+P AVSP AVSP AV+P AV+
Sbjct 72 AVSPRAVTPRAVTPRAVIPRAVSPRAVTPRAVSPRAVTPRAVSPRAVSPRAVTPTAVSPR 131
Query 63 AAL 65
A +
Sbjct 132 AVI 134
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.063, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/63 (46%), Positives = 36/63 (57%), Gaps = 0/63 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAVAAA 62
AV+ AV AV+ AV+ AV A + A AVSP AV+P AVSP AV P AV+
Sbjct 102 AVSPRAVTPRAVSPRAVSPRAVTPTAVSPRAVIPRAVSPRAVTPTAVSPRAVIPRAVSPR 161
Query 63 AAL 65
A +
Sbjct 162 AVI 164
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.072, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/61 (47%), Positives = 33/61 (54%), Gaps = 0/61 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAVAAA 62
+V AV+ AV AV AV A + A AVSP AV+P AVSP AVSP AV
Sbjct 67 SVTPRAVSPRAVTPRAVTPRAVIPRAVSPRAVTPRAVSPRAVTPRAVSPRAVSPRAVTPT 126
Query 63 A 63
A
Sbjct 127 A 127
Score = 32.7 bits (73), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/63 (42%), Positives = 34/63 (53%), Gaps = 0/63 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAVAAA 62
AV+ AV AV AV+ AV A A + AV+P AV+P AVSP AV+P V
Sbjct 317 AVSPRAVTPRAVRPRAVSPRAVTPRAVIPRAVSPRAVTPRAVTPRAVSPRAVTPRDVTPR 376
Query 63 AAL 65
A +
Sbjct 377 AVI 379
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/63 (46%), Positives = 32/63 (50%), Gaps = 0/63 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAVAAA 62
AV AV AV AV AV+ A A AVSP AV+P AV P AVSP AV
Sbjct 282 AVTPRAVIPRAVTPRAVIPRAVSPRAVTPRAVIPRAVSPRAVTPRAVRPRAVSPRAVTPR 341
Query 63 AAL 65
A +
Sbjct 342 AVI 344
Score = 30.8 bits (68), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/54 (48%), Positives = 29/54 (53%), Gaps = 0/54 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSP 56
AV+ AV AV AV+ AV A AVSP AVSP AV+P AVSP
Sbjct 347 AVSPRAVTPRAVTPRAVSPRAVTPRDVTPRAVIPRAVSPRAVSPRAVTPRAVSP 400
Score = 30.0 bits (66), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/61 (45%), Positives = 33/61 (54%), Gaps = 0/61 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAVAAA 62
AV+ AV+ AV AV AV A A + AV+P AV P AVSP AV+P AV
Sbjct 272 AVSPRAVSPRAVTPRAVIPRAVTPRAVIPRAVSPRAVTPRAVIPRAVSPRAVTPRAVRPR 331
Query 63 A 63
A
Sbjct 332 A 332
Score = 28.1 bits (61), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 26/57 (45%), Positives = 30/57 (52%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 2 AAVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAA 58
AV+ AV AV+ AV AV+ A A AVSP AV P AVSP V+P A
Sbjct 146 TAVSPRAVIPRAVSPRAVIPRAVSPRAVTPRAVTPTAVSPRAVIPRAVSPRDVTPRA 202
Score = 28.1 bits (61), Expect = 3.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/63 (39%), Positives = 32/63 (50%), Gaps = 0/63 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAVAAA 62
V+ AV AV+ +V V+ + A AVSP AVSP AV+P AV P AV
Sbjct 237 TVSPRAVIPRAVSPRSVTPRTVSPKSVIPRAMIPRAVSPRAVSPRAVTPRAVIPRAVTPR 296
Query 63 AAL 65
A +
Sbjct 297 AVI 299
Score = 26.9 bits (58), Expect = 9.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/57 (42%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 3 AVAAAAVAAAAVAAAAVAAAAVAAVAAAAVAAAAAAVSPVAVSPVAVSPAAVSPAAV 59
AV AV+ V A + AV A A+SP AVSP AV+P VSP AV
Sbjct 187 AVIPRAVSPRDVTPRAESPRAVTPRDVTPRAVIPRAMSPRAVSPRAVTPRTVSPRAV 243
Lambda K H
0.311 0.112 0.296
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Effective search space used: 1167556980
Database: kyva
Posted date: Jul 3, 2009 9:03 AM
Number of letters in database: 47,500,486
Number of sequences in database: 112,920
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Neighboring words threshold: 11
Window for multiple hits: 40