bitscore colors: <40, 40-50 , 50-80, 80-200, >200

BLASTP 2.2.24+
Reference: Stephen F. Altschul, Thomas L. Madden, Alejandro A.
Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J.
Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of
protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Reference for composition-based statistics: Alejandro A. Schaffer,
L. Aravind, Thomas L. Madden, Sergei Shavirin, John L. Spouge, Yuri
I. Wolf, Eugene V. Koonin, and Stephen F. Altschul (2001),
"Improving the accuracy of PSI-BLAST protein database searches with
composition-based statistics and other refinements", Nucleic Acids
Res. 29:2994-3005.
Database: egene_temp_file_orthology_annotation_similarity_blast_database_866
164,496 sequences; 82,071,388 total letters
Query= Eten_7101_orf5
Length=116
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
mmu:12843 Col1a2, AA960264, AI325291, Col1a-2, Cola-2, Cola2, ... 60.5 1e-09
mmu:71355 Col24a1, 5430404K19Rik, MGC107332; collagen, type XX... 57.8 8e-09
mmu:12832 Col5a2, 1110014L14Rik, D230017N05; collagen, type V,... 57.8 8e-09
dre:100004431 si:dkey-61l1.4 57.8 9e-09
hsa:1290 COL5A2, MGC105115; collagen, type V, alpha 2; K06236 ... 57.4 1e-08
dre:100330523 col5a3a; collagen type V alpha-3a 57.0 1e-08
hsa:1278 COL1A2, OI4; collagen, type I, alpha 2; K06236 collag... 56.2 2e-08
mmu:239126 C1qtnf9, 9130217G22Rik, CTRP9, Ciqtnf9; C1q and tum... 56.2 2e-08
mmu:12815 Col11a2; collagen, type XI, alpha 2; K06236 collagen... 55.8 3e-08
dre:336471 col1a2, alpha2(I), hm:zehn2357, wu:fa98d05, wu:fa99... 55.1 6e-08
dre:100006366 procollagen, type V, alpha 2-like 54.7 7e-08
dre:554269 col4a1, col4a5, fj65e07, im:7157877, si:ch211-174g1... 53.1 2e-07
pfa:PFD0260c sequestrin 52.4 4e-07
hsa:255631 COL24A1, MGC142214; collagen, type XXIV, alpha 1 52.0
mmu:12840 Col9a2, AI427499, Col9a-2; collagen, type IX, alpha ... 51.6 6e-07
mmu:229389 Otol1, Gm414; otolin 1 homolog (zebrafish) 51.2 8e-07
hsa:50509 COL5A3; collagen, type V, alpha 3; K06236 collagen, ... 50.8 1e-06
xla:380419 col1a2, MGC52958; collagen, type 1, alpha 2; K06236... 50.1 2e-06
hsa:1284 COL4A2, DKFZp686I14213, FLJ22259; collagen, type IV, ... 49.7 2e-06
hsa:84570 COL25A1, CLAC, CLACP; collagen, type XXV, alpha 1 49.7
tpv:TP01_0933 hypothetical protein 48.9 4e-06
mmu:12827 Col4a2, Col4a-2, MGC7371; collagen, type IV, alpha 2... 48.5 5e-06
mmu:12839 Col9a1, Col9a-1; collagen, type IX, alpha 1; K08131 ... 48.5 5e-06
mmu:53867 Col5a3; collagen, type V, alpha 3; K06236 collagen, ... 48.1 6e-06
mmu:68553 Col6a4, 1110001D15Rik, AI413310, AU023415, Dvwa, EG2... 47.4 1e-05
dre:555428 col28a1, col28a1c, si:ch211-174d12.1, si:ch211-174d... 47.0 2e-05
hsa:1282 COL4A1, arresten; collagen, type IV, alpha 1; K06237 ... 45.4 4e-05
pfa:PFE0970w cytochrome c oxidase assembly protein (heme A: fa... 45.4 4e-05
dre:564099 novel collagen protein-like 44.7 7e-05
pfa:PF10_0026 Tryptophan-rich antigen 3, putative 44.7 8e-05
hsa:1308 COL17A1, BA16H23.2, BP180, BPAG2, FLJ60881, KIAA0204,... 43.9 1e-04
cel:K03H9.2 col-75; COLlagen family member (col-75) 42.4 4e-04
hsa:78989 COLEC11, CL-K1-I, CL-K1-II, CL-K1-IIa, CL-K1-IIb, CL... 42.0 5e-04
dre:567110 col9a3, cb367, sb:cb367, si:ch73-162j3.1, wu:fa04f0... 41.6 7e-04
hsa:1297 COL9A1, DJ149L1.1.2, EDM6, FLJ40263, MED; collagen, t... 41.2 8e-04
tpv:TP01_0407 hypothetical protein 40.4 0.001
hsa:1310 COL19A1, COL9A1L, D6S228E; collagen, type XIX, alpha 1 40.4
dre:799425 c1qtnf9, zgc:175268; C1q and tumor necrosis factor ... 40.4 0.001
hsa:1298 COL9A2, DJ39G22.4, EDM2, MED; collagen, type IX, alph... 40.0 0.002
xla:380029 colec11, MGC69012; collectin sub-family member 11; ... 39.7 0.002
mmu:245026 Col6a6, E330019B14, E330026B02Rik; collagen, type V... 39.3 0.003
dre:541546 zgc:113232 39.3 0.003
dre:100330457 collagen alpha-1(V) chain-like 38.9 0.004
mmu:12842 Col1a1, Col1a-1, Cola-1, Cola1, Mov-13, Mov13; colla... 38.1 0.007
dre:553354 col4a3, zTumstatin; collagen, type IV, alpha 3 37.7
mmu:12823 Col19a1; collagen, type XIX, alpha 1 37.4
mmu:12814 Col11a1, C530001D20Rik, cho; collagen, type XI, alph... 36.6 0.022
tpv:TP02_0420 hypothetical protein 36.6 0.023
dre:792513 collagen, type XXI, alpha 1-like 36.2 0.024
dre:564005 col6a6, im:7152043, si:dkey-202m9.3; collagen, type... 35.4 0.044
> mmu:12843 Col1a2, AA960264, AI325291, Col1a-2, Cola-2, Cola2,
oim; collagen, type I, alpha 2; K06236 collagen, type I/II/III/V/XI,
alpha
Length=1372
Score = 60.5 bits (145), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/91 (43%), Positives = 47/91 (51%), Gaps = 0/91 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VGS G G+ G G G+ GS G G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG
Sbjct 918 VGSPGVNGAPGEAGRDGNPGSDGPPGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGP 977
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G G+ G G GSVG VG+VG S Q
Sbjct 978 AGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQ 1008
Score = 60.5 bits (145), Expect = 1e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/90 (42%), Positives = 45/90 (50%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G+ GS G G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG G G+
Sbjct 925 GAPGEAGRDGNPGSDGPPGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPAGKHGNR 984
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G GSVG VG+VG G G G D
Sbjct 985 GEPGPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDK 1014
Score = 59.7 bits (143), Expect = 2e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/90 (42%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ GS G G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG G G+ G G
Sbjct 931 GRDGNPGSDGPPGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPAGKHGNRGEPGPA 990
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GSVG VG+VG G G G G G D
Sbjct 991 GSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDK 1020
Score = 59.3 bits (142), Expect = 3e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/86 (44%), Positives = 45/86 (52%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G+ G G G+ GS G G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG
Sbjct 919 GSPGVNGAPGEAGRDGNPGSDGPPGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPA 978
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G G GSVG VG+VG G
Sbjct 979 GKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPRGP 1004
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/86 (43%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG G G+ G G GSVG V
Sbjct 937 GSDGPPGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPAGKHGNRGEPGPAGSVGPV 996
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+VG G G G G G G G
Sbjct 997 GAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGH 1022
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/85 (42%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG G G+ G G GSVG VG+V
Sbjct 940 GPPGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPAGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAV 999
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G G G
Sbjct 1000 GPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGHRG 1024
Score = 55.5 bits (132), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/93 (41%), Positives = 44/93 (47%), Gaps = 0/93 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG G G+ G G GSVG VG+VG
Sbjct 943 GRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPAGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPR 1002
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G G G G G G G G G S LQ
Sbjct 1003 GPSGPQGIRGDKGEPGDKGHRGLPGLKGYSGLQ 1035
Score = 48.5 bits (114), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/97 (38%), Positives = 46/97 (47%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G+ G G+ G G+ G G G VG+ G G+ GS GSVG VG G +
Sbjct 196 GQPGAQGVKGEPGAPGENGTPGQAGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPI 255
Query 61 GSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G +G VG+ G G G G VG
Sbjct 256 GSAGPPGFPGAPGPKGELGPVGNPGPAGPAGPRGEVG 292
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/90 (41%), Positives = 42/90 (46%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS+G G+ G+ G GSVG G G+ G G GSVG VG+VG G G G G G
Sbjct 958 GSIGPTGAAGAPGPHGSVGPAGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEP 1017
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G D
Sbjct 1018 GDKGHRGLPGLKGYSGLQGLPGLAGLHGDQ 1047
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/87 (42%), Positives = 46/87 (52%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G+ G G+ G G G VG+ G G+ GS GSVG VG G +GS G G
Sbjct 205 GEPGAPGENGTPGQAGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPIGSAGPPGFP 264
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G +G VG+ G G G G V
Sbjct 265 GAPGPKGELGPVGNPGPAGPAGPRGEV 291
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/87 (36%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G+ G VG G G G G G G G G+ G G+
Sbjct 547 GGKGEQGPAGPPGFQGLPGPSGTTGEVGKPGERGLPGEFGLPGPAGPRGERGTPGESGAA 606
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 607 GPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAV 633
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/107 (34%), Positives = 42/107 (39%), Gaps = 21/107 (19%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G+ G GSVG G G+ G G GSVG VG+VG G G G G G G G
Sbjct 964 GAAGAPGPHGSVGPAGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGHR 1023
Query 61 ---------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G VG G G G G VG
Sbjct 1024 GLPGLKGYSGLQGLPGLAGLHGDQGAPGPVGPAGPRGPAGPSGPVGK 1070
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G G G V
Sbjct 172 GFPGTPGLPGFKGVKGHSGMDGLKGQPGAQGVKGEPGAPGENGTPGQAGARGLPGERGRV 231
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G+ GS GSVG VG G +GS
Sbjct 232 GAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPIGSA 258
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/108 (35%), Positives = 41/108 (37%), Gaps = 21/108 (19%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------- 51
GSVG G G+ G G GSVG VG+VG G G G G G G G
Sbjct 973 GSVGPAGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGHRGLPGLKGYS 1032
Query 52 ------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G VG G G G G VG G G G V
Sbjct 1033 GLQGLPGLAGLHGDQGAPGPVGPAGPRGPAGPSGPVGKDGRSGQPGPV 1080
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/98 (36%), Positives = 45/98 (45%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
GS G G G G++G G +G +VGS G G+ G G G+ GS G
Sbjct 883 GSRGERGLPGIAGALGEPGPLGISGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGSDGPP 942
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG G
Sbjct 943 GRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPAGK 980
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/87 (41%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GSVG G G+ G G GSVG VG+VG G G G G G G G G G
Sbjct 970 GPHGSVGPAGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGHRGLPGLK 1029
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G+ G VG
Sbjct 1030 GYSGLQGLPGLAGLHGDQGAPGPVGPA 1056
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G G
Sbjct 169 GARGFPGTPGLPGFKGVKGHSGMDGLKGQPGAQGVKGEPGAPGENGTPGQAGARGLPGER 228
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VG+ G G+ GS GSVG VG G +
Sbjct 229 GRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPI 255
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/101 (35%), Positives = 45/101 (44%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G G G VG+ G G+ GS GSV
Sbjct 187 GHSGMDGLKGQPGAQGVKGEPGAPGENGTPGQAGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSV 246
Query 61 GSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG G +GS +G VG+ G G G
Sbjct 247 GPVGPAGPIGSAGPPGFPGAPGPKGELGPVGNPGPAGPAGP 287
Score = 43.1 bits (100), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/108 (33%), Positives = 39/108 (36%), Gaps = 21/108 (19%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------ 48
G G G+ G G GSVG VG+VG G G G G G G G
Sbjct 976 GPAGKHGNRGEPGPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGHRGLPGLKGYSGLQ 1035
Query 49 ---------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G VG G G G G VG G G G VG
Sbjct 1036 GLPGLAGLHGDQGAPGPVGPAGPRGPAGPSGPVGKDGRSGQPGPVGPA 1083
Score = 43.1 bits (100), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/97 (36%), Positives = 44/97 (45%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 50
GS G G G G++G G +G +VGS G G+ G G G+ GS G
Sbjct 882 PGSRGERGLPGIAGALGEPGPLGISGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGSDGP 941
Query 51 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G GS+G G+ G+ G GSVG
Sbjct 942 PGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSVGPA 978
Score = 42.7 bits (99), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G
Sbjct 166 GPQGARGFPGTPGLPGFKGVKGHSGMDGLKGQPGAQGVKGEPGAPGENGTPGQAGARGLP 225
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G VG+ G G+ GS GSVG VG
Sbjct 226 GERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPA 252
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/104 (36%), Positives = 40/104 (38%), Gaps = 18/104 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSV 42
G GSVG VG+VG G G G G G G G G G
Sbjct 988 GPAGSVGPVGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGDKGHRGLPGLKGYSGLQGLPGLAGLHGDQ 1047
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G VG G G G G VG G G G VG G GS GS
Sbjct 1048 GAPGPVGPAGPRGPAGPSGPVGKDGRSGQPGPVGPAGVRGSQGS 1091
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VG G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G
Sbjct 165 VGPQGARGFPGTPGLPGFKGVKGHSGMDGLKGQPGAQGVKGEPGAPGENGTPGQAGARGL 224
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G VG+ G G+ GS GSVG V
Sbjct 225 PGERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPV 249
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/97 (36%), Positives = 45/97 (46%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 50
+G GS G G G G++G G +G +VGS G G+ G G G+ GS
Sbjct 879 LGLPGSRGERGLPGIAGALGEPGPLGISGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGS 938
Query 51 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G GS+G G+ G+ G GSV
Sbjct 939 DGPPGRDGQPGHKGERGYPGSIGPTGAAGAPGPHGSV 975
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VG G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G
Sbjct 160 GERGVVGPQGARGFPGTPGLPGFKGVKGHSGMDGLKGQPGAQGVKGEPGAPGENGTPGQA 219
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G G VG+ G G+ GS GSV
Sbjct 220 GARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSV 246
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/123 (27%), Positives = 45/123 (36%), Gaps = 36/123 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------------------ 30
G+ G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 604 GAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGASGPGGLPGERGAAGIPGGKGEK 663
Query 31 ------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G G+ G G G GS G G V
Sbjct 664 GETGLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEV 723
Query 85 GSV 87
G
Sbjct 724 GPA 726
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/85 (34%), Positives = 35/85 (41%), Gaps = 15/85 (17%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS--------------- 47
G+VG+ G G+ G G G+ G G G GS G G VG G
Sbjct 684 PGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEVGPAGPNGFAGPAGAAGQPGA 743
Query 48 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
G G+ G G G VG GSVG+
Sbjct 744 KGEKGTKGPKGENGIVGPTGSVGAA 768
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/122 (27%), Positives = 44/122 (36%), Gaps = 36/122 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------------------------------- 27
G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 607 GPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGASGPGGLPGERGAAGIPGGKGEKGET 666
Query 28 ---GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G G+ G G G GS G G VG
Sbjct 667 GLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEVGPA 726
Query 85 GS 86
G
Sbjct 727 GP 728
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/123 (27%), Positives = 45/123 (36%), Gaps = 36/123 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------------------------- 33
G G+ G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 601 GESGAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGASGPGGLPGERGAAGIPGGK 660
Query 34 ---------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G G+ G G G GS G
Sbjct 661 GEKGETGLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGER 720
Query 85 GSV 87
G V
Sbjct 721 GEV 723
Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.069, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/122 (27%), Positives = 45/122 (36%), Gaps = 36/122 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------------ 36
G+ G G+ G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 598 GTPGESGAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGASGPGGLPGERGAAGIP 657
Query 37 ------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G G+ G G G GS
Sbjct 658 GGKGEKGETGLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPAGPRGSP 717
Query 85 GS 86
G
Sbjct 718 GE 719
Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.071, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 46/125 (36%), Gaps = 36/125 (28%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------------------- 39
G G+ G G+ G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 595 GERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGASGPGGLPGERGAA 654
Query 40 ---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G G+ G G G
Sbjct 655 GIPGGKGEKGETGLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPAGPR 714
Query 85 GSVSD 89
GS +
Sbjct 715 GSPGE 719
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/84 (33%), Positives = 34/84 (40%), Gaps = 18/84 (21%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----------------- 43
G+VG+ G G+ G G G+ G G G GS G G VG G
Sbjct 685 GAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEVGPAGPNGFAGPAGAAGQPGAK 744
Query 44 -SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G+ G G G VG GSVG+
Sbjct 745 GEKGTKGPKGENGIVGPTGSVGAA 768
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/123 (26%), Positives = 44/123 (35%), Gaps = 36/123 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------------- 45
G G G G+ G G+ G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 589 GPAGPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGASGPGGLP 648
Query 46 ---------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G G+ G
Sbjct 649 GERGAAGIPGGKGEKGETGLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPS 708
Query 85 GSV 87
G
Sbjct 709 GPA 711
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/126 (26%), Positives = 45/126 (35%), Gaps = 36/126 (28%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------- 51
G G G G G G+ G G+ G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 583 GEFGLPGPAGPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGAS 642
Query 52 ---------------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G
Sbjct 643 GPGGLPGERGAAGIPGGKGEKGETGLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEA 702
Query 85 GSVSDS 90
G+ S
Sbjct 703 GAAGPS 708
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.18, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/122 (26%), Positives = 44/122 (36%), Gaps = 36/122 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------ 42
G G G+ G G+ G G +GS G G+ G G+ G G+V
Sbjct 592 GPRGERGTPGESGAAGPSGPIGSRGPSGAPGPDGNKGEAGAVGAPGSAGASGPGGLPGER 651
Query 43 ------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G+ G G+ G G+VG+ G G+ G G G+ G G
Sbjct 652 GAAGIPGGKGEKGETGLRGDTGNTGRDGARGIPGAVGAPGPAGASGDRGEAGAAGPSGPA 711
Query 85 GS 86
G
Sbjct 712 GP 713
Score = 29.3 bits (64), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/102 (35%), Positives = 40/102 (39%), Gaps = 15/102 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGSV 45
G G+ G G G GS G G VG G G G+ G G G V
Sbjct 700 GEAGAAGPSGPAGPRGSPGERGEVGPAGPNGFAGPAGAAGQPGAKGEKGTKGPKGENGIV 759
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GSVG+ G G G G VGS G G G G G+ G
Sbjct 760 GPTGSVGAAGPSGPNGPPGPVGSRGDGGPPGMTGFPGAAGRT 801
Score = 28.9 bits (63), Expect = 4.2, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 40/138 (28%), Positives = 49/138 (35%), Gaps = 48/138 (34%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----------- 34
GSVG VG G +GS +G VG+ G G G G VG
Sbjct 244 GSVGPVGPAGPIGSAGPPGFPGAPGPKGELGPVGNPGPAGPAGPRGEVGLPGLSGPVGPP 303
Query 35 ----SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSVGSVGSV 72
+ G G+ G+ G G G+ G G VG G GS G
Sbjct 304 GNPGTNGLTGAKGATGLPGVAGAPGLPGPRGIPGPAGAAGATGARGLVGEPGPAGSKGES 363
Query 73 GSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G+ G GSVG+ G S
Sbjct 364 GNKGEPGSVGAQGPPGPS 381
Score = 28.5 bits (62), Expect = 6.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/139 (28%), Positives = 48/139 (34%), Gaps = 43/139 (30%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------ 42
G+ G G G VG GSVG+ GS G G G G G+ G
Sbjct 748 GTKGPKGENGIVGPTGSVGAAGPSGPNGPPGPVGSRGDGGPPGMTGFPGAAGRTGPPGPS 807
Query 43 ------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G G VG G G+ G G VG G G G+ G+ G+
Sbjct 808 GIAGPPGPPGAAGKEGIRGPRGDQGPVGRTGETGASGPPGFVGEKGPSGEPGTAGAPGTA 867
Query 85 GSVSDSLLQNGLLLSASVL 103
G GLL + +L
Sbjct 868 GP-------QGLLGAPGIL 879
> mmu:71355 Col24a1, 5430404K19Rik, MGC107332; collagen, type
XXIV, alpha 1
Length=1733
Score = 57.8 bits (138), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/85 (42%), Positives = 45/85 (52%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G+ G VG G +G G G VG+ G G +G G G VG G GS
Sbjct 1093 GEDGDKGEMGLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSR 1152
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G GSVG G G+ G+ G+VG +G
Sbjct 1153 GPPGSVGENGPKGARGTRGAVGPLG 1177
Score = 57.8 bits (138), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/86 (41%), Positives = 46/86 (53%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G+ G VG G +G G G VG+ G G +G G G VG G GS G
Sbjct 1096 GDKGEMGLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPP 1155
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GSVG G G+ G+ G+VG +G +G
Sbjct 1156 GSVGENGPKGARGTRGAVGPLGLMGP 1181
Score = 57.8 bits (138), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/86 (41%), Positives = 46/86 (53%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G+ G VG G +G G G VG+ G G +G G G VG G GS G GSV
Sbjct 1099 GEMGLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSV 1158
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G+ G+ G+VG +G +G G
Sbjct 1159 GENGPKGARGTRGAVGPLGLMGPEGE 1184
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/85 (42%), Positives = 45/85 (52%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G VG G +G G G VG+ G G +G G G VG G GS G GSVG
Sbjct 1102 GLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGEN 1161
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G+ G+ G+VG +G +G G G
Sbjct 1162 GPKGARGTRGAVGPLGLMGPEGEPG 1186
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/87 (41%), Positives = 45/87 (51%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G G+ G VG G +G G G VG+ G G +G G G VG G
Sbjct 1090 GLPGEDGDKGEMGLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEA 1149
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
GS G GSVG G G+ G+ G+VG +
Sbjct 1150 GSRGPPGSVGENGPKGARGTRGAVGPL 1176
Score = 55.5 bits (132), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/86 (41%), Positives = 44/86 (51%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VG G +G G G VG+ G G +G G G VG G GS G GSVG G G+
Sbjct 1108 GPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGAR 1167
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G+VG +G +G G G G G
Sbjct 1168 GTRGAVGPLGLMGPEGEPGIPGYRGH 1193
Score = 53.9 bits (128), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/86 (40%), Positives = 43/86 (50%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G G VG+ G G +G G G VG G GS G GSVG G G+ G+
Sbjct 1111 GRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGARGTR 1170
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+VG +G +G G G G G G
Sbjct 1171 GAVGPLGLMGPEGEPGIPGYRGHQGQ 1196
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/86 (40%), Positives = 43/86 (50%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G G +G G+ G VG G +G G G VG+ G G +G G G V
Sbjct 1084 GAPGGSGLPGEDGDKGEMGLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQV 1143
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G GS G GSVG G G+ G+
Sbjct 1144 GPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGARGT 1169
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/88 (39%), Positives = 41/88 (46%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G G VG G GS G GSVG G G+ G+ G+VG +G +G G G
Sbjct 1129 GQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGARGTRGAVGPLGLMGPEGEPGIP 1188
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVS 88
G G G G G G G G G S
Sbjct 1189 GYRGHQGQPGPSGLPGPKGEKGYPGEDS 1216
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/84 (40%), Positives = 41/84 (48%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VG+ G G +G G G VG G GS G GSVG G G+ G+ G+VG +G +G G
Sbjct 1125 VGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGARGTRGAVGPLGLMGPEGE 1184
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G
Sbjct 1185 PGIPGYRGHQGQPGPSGLPGPKGE 1208
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G +G G G VG G GS G GSVG G G+ G+ G+VG +G +G G
Sbjct 1126 GTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGARGTRGAVGPLGLMGPEGEP 1185
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G G G
Sbjct 1186 GIPGYRGHQGQPGPSGLPGPKGEKG 1210
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 43/90 (47%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VG+ G G +G G G VG G GS G GSVG G G+ G+ G+VG +G +
Sbjct 1120 GPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGARGTRGAVGPLGLM 1179
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G +
Sbjct 1180 GPEGEPGIPGYRGHQGQPGPSGLPGPKGEK 1209
Score = 52.0 bits (123), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/85 (41%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G VG+ G G +G G G VG G GS G GSVG G G+ G+ G+VG +
Sbjct 1117 GLPGPEGIVGTPGQRGRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGPKGARGTRGAVGPL 1176
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G +G G G G G G G G
Sbjct 1177 GLMGPEGEPGIPGYRGHQGQPGPSG 1201
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/86 (40%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G G G G G +G G+ G VG G +G G G VG+ G G +G
Sbjct 1078 GKDGLKGAPGGSGLPGEDGDKGEMGLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQRGRLGKK 1137
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G VG G GS G GSVG G
Sbjct 1138 GDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGENGP 1163
Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 43/90 (47%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G+ G G G G G +G G+ G VG G +G G G VG+ G
Sbjct 1072 GEEGLQGKDGLKGAPGGSGLPGEDGDKGEMGLPGTAGPVGRPGQMGLPGPEGIVGTPGQR 1131
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G +G G G VG G GS G GSV ++
Sbjct 1132 GRLGKKGDKGQVGPTGEAGSRGPPGSVGEN 1161
Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G++GS G G G G G+ GS G G +GS G VG +G G G+ G G
Sbjct 604 GLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGSKGVRGFIGSPGEVGQLGPEGERGTPGVRGKK 663
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G GS G V
Sbjct 664 GPKGRQGFPGDFGDRGPAGLDGSPGLV 690
Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G++GS G G G G G+ GS G G +GS G VG +G G G+ G
Sbjct 601 GEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGSKGVRGFIGSPGEVGQLGPEGERGTPGVR 660
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G GS
Sbjct 661 GKKGPKGRQGFPGDFGDRGPAGLDGS 686
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G G G G G G++GS G G G G G+ GS G G +GS G VG +G
Sbjct 592 GHPGLPGLRGEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGSKGVRGFIGSPGEVGQLGPE 651
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G G G G G D
Sbjct 652 GERGTPGVRGKKGPKGRQGFPGDFGDR 678
Score = 44.7 bits (104), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/81 (38%), Positives = 37/81 (45%), Gaps = 0/81 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G G++GS G G G G G+ GS G G +GS G VG +G G G+ G
Sbjct 601 GEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGSKGVRGFIGSPGEVGQLGPEGERGTPGVR 660
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G
Sbjct 661 GKKGPKGRQGFPGDFGDRGPA 681
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/89 (38%), Positives = 41/89 (46%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G G G G G++GS G G G G G+ GS G G +GS G V
Sbjct 586 GAKGLKGHPGLPGLRGEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGSKGVRGFIGSPGEV 645
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G +G G G+ G G G G G D
Sbjct 646 GQLGPEGERGTPGVRGKKGPKGRQGFPGD 674
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G VG G G+ G G G G G G G G++GS G G G G
Sbjct 568 GEKGDPGLLGLVGPPGLQGAKGLKGHPGLPGLRGEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPE 627
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ GS G G +GS G VG +G G
Sbjct 628 GNPGSKGVRGFIGSPGEVGQLGPEGE 653
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G VG G G+ G G G G G G G G++GS G G G G G+
Sbjct 571 GDPGLLGLVGPPGLQGAKGLKGHPGLPGLRGEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNP 630
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G G +GS G VG +G G G+
Sbjct 631 GSKGVRGFIGSPGEVGQLGPEGERGT 656
Score = 43.1 bits (100), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G VG G G+ G G G G G G G G++GS G G G G G+ GS
Sbjct 574 GLLGLVGPPGLQGAKGLKGHPGLPGLRGEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGSK 633
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G +GS G VG +G G G+ G
Sbjct 634 GVRGFIGSPGEVGQLGPEGERGTPG 658
Score = 42.0 bits (97), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G G G G G G G G++GS G G G G G+ GS G G +
Sbjct 580 GPPGLQGAKGLKGHPGLPGLRGEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGSKGVRGFI 639
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G VG +G G G+ G G G
Sbjct 640 GSPGEVGQLGPEGERGTPGVRGKKGP 665
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/104 (33%), Positives = 43/104 (41%), Gaps = 18/104 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------------- 45
G +G G G VG G VG GS+G G GS G +G G G +
Sbjct 865 GDIGKTGETGPVGLPGEVGITGSIGEKGERGSPGPLGPQGEKGVMGYPGPPGAPGPMGPL 924
Query 46 ---GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG+ G+ GS G G G G G G G G+ G G+
Sbjct 925 GLPGLVGARGAPGSPGPKGQRGPRGPDGLAGDQGGHGAKGEKGN 968
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/81 (39%), Positives = 39/81 (48%), Gaps = 0/81 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G +G VG G G+ G G G G G G G G++GS G G G G
Sbjct 568 GEKGDPGLLGLVGPPGLQGAKGLKGHPGLPGLRGEHGLPGLAGNIGSPGYPGRQGLAGPE 627
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ GS G G +GS G VG +
Sbjct 628 GNPGSKGVRGFIGSPGEVGQL 648
> mmu:12832 Col5a2, 1110014L14Rik, D230017N05; collagen, type
V, alpha 2; K06236 collagen, type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1497
Score = 57.8 bits (138), Expect = 8e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 42/90 (46%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G
Sbjct 1042 GEPGPEGPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEP 1101
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GS G VG G G G G G G D+
Sbjct 1102 GSRGPVGPPGRAGKRGLPGPQGPRGDKGDN 1131
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/88 (39%), Positives = 41/88 (46%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VG G G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G
Sbjct 1041 VGEPGPEGPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGE 1100
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GS G VG G G G G G D
Sbjct 1101 PGSRGPVGPPGRAGKRGLPGPQGPRGDK 1128
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G V
Sbjct 1048 GPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEPGSRGPV 1107
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G D
Sbjct 1108 GPPGRAGKRGLPGPQGPRGDKGDNGDRGDR 1137
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS
Sbjct 1045 GPEGPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEPGSR 1104
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G VG G G G G G G G D
Sbjct 1105 GPVGPPGRAGKRGLPGPQGPRGDKGDNGDR 1134
Score = 54.3 bits (129), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G VG G
Sbjct 1054 GTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEPGSRGPVGPPGRA 1113
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G
Sbjct 1114 GKRGLPGPQGPRGDKGDNGDRGDRGQ 1139
Score = 54.3 bits (129), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 38/85 (44%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G VG G G G
Sbjct 1060 GAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEPGSRGPVGPPGRAGKRGLP 1119
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G G G
Sbjct 1120 GPQGPRGDKGDNGDRGDRGQKGHRG 1144
Score = 53.9 bits (128), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G VG G G
Sbjct 1057 GRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEPGSRGPVGPPGRAGKR 1116
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G
Sbjct 1117 GLPGPQGPRGDKGDNGDRGDRGQKGH 1142
Score = 52.0 bits (123), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/92 (36%), Positives = 41/92 (44%), Gaps = 0/92 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G +G G G G G G+VG G +G G+ G+ G GS G
Sbjct 475 GEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGSDGLP 534
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLL 92
G G+ G G VGS G G G G + L
Sbjct 535 GPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGL 566
Score = 51.2 bits (121), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/88 (37%), Positives = 39/88 (44%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G G G G G G +G G G G G G+VG G +G G+ G+ G GS
Sbjct 471 PGFKGEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGS 530
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G+ G G VGS G G D
Sbjct 531 DGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDP 558
Score = 50.8 bits (120), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G G G G G+VG G +G G+ G+ G GS G G G+ G G VGS
Sbjct 490 GPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSS 549
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G+ G G+
Sbjct 550 GPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNP 576
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/89 (39%), Positives = 43/89 (48%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G VGS G G G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G
Sbjct 535 GPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGED 594
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G GS+G G GS+G G GS D
Sbjct 595 GRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGD 623
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VGS G G G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+
Sbjct 544 GPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSI 603
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G GS+G G GS G +G G ++
Sbjct 604 GIRGQPGSMGLPGPKGSSGDLGKPGEAGNA 633
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G G +G G G G G G+VG G +G G+
Sbjct 463 GQSGDPGVPGFKGEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAP 522
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G GS G G G+ G G VGS
Sbjct 523 GNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGS 548
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G +G G G G G G+VG G +G G+ G+
Sbjct 466 GDPGVPGFKGEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNR 525
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G GS G G G+ G G VGS G
Sbjct 526 GFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGP 551
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VGS G G G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G
Sbjct 541 GERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPP 600
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GS+G G GS+G G GS G +G ++
Sbjct 601 GSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDLGKPGEA 630
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G G G G G+VG G +G G+ G+ G GS G G G+ G
Sbjct 484 GPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGER 543
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VGS G G G G G G G+
Sbjct 544 GPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGA 569
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/90 (36%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+VG G +G G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G G G G G
Sbjct 505 GDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEP 564
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G+ G G G +G +G+ +
Sbjct 565 GLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGED 594
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G+VG G +G G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G
Sbjct 493 GPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPK 552
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G+ G G+ G
Sbjct 553 GGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPG 577
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G VGS G G G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G
Sbjct 538 GAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRP 597
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS+G G GS+G G GS G +
Sbjct 598 GPPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDL 624
Score = 48.9 bits (115), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+VG G +G G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G G G G
Sbjct 502 GPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRP 561
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G+ G G+ G G G +G +
Sbjct 562 GEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPL 588
Score = 48.5 bits (114), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/85 (37%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G
Sbjct 550 GPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQP 609
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS+G G GS G +G G G+ G
Sbjct 610 GSMGLPGPKGSSGDLGKPGEAGNAG 634
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G G+ G G VGS G G G G G G G+ G G+ G G G +G +
Sbjct 529 GSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPL 588
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G+ G G G GS+G G GS+G
Sbjct 589 GAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMG 613
Score = 48.1 bits (113), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/87 (36%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G GS+G
Sbjct 556 GDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLP 615
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS G +G G G+ G G G+
Sbjct 616 GPKGSSGDLGKPGEAGNAGVPGQRGAP 642
Score = 48.1 bits (113), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G GS+G G
Sbjct 559 GRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPK 618
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G +G G G+ G G G+ G
Sbjct 619 GSSGDLGKPGEAGNAGVPGQRGAPGK 644
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+VG G +G G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G G G
Sbjct 499 GKRGPRGDPGTVGPPGPMGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDP 558
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G+ G G+ G G G +
Sbjct 559 GRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKL 585
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G GS+G G GS
Sbjct 562 GEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSS 621
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G G+ G G G+ G G
Sbjct 622 GDLGKPGEAGNAGVPGQRGAPGKDGE 647
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G G+ G G VGS G G G G G G G+ G G+ G G G +
Sbjct 526 GFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKL 585
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G +G+ G G G GS+G G GS+
Sbjct 586 GPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSM 612
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/105 (34%), Positives = 44/105 (41%), Gaps = 18/105 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 42
G G G G+ G VG G+ VG G G G+ G+ G G+V
Sbjct 1003 GMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPEGPAGNDGTPGRDGAV 1062
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G V
Sbjct 1063 GERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEPGSRGPV 1107
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/84 (38%), Positives = 40/84 (47%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G+ G G VGS G G G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G
Sbjct 534 PGPKGAQGERGPVGSSGPKGGQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGE 593
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G GS+G G GS+G G
Sbjct 594 DGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGP 617
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/104 (33%), Positives = 43/104 (41%), Gaps = 18/104 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSV 42
G G G G G+ G VG G+ VG G G G+ G+ G
Sbjct 1000 GERGMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPEGPAGNDGTPGRD 1059
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS
Sbjct 1060 GAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEPGS 1103
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/108 (33%), Positives = 45/108 (41%), Gaps = 18/108 (16%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSV 42
G G VG G G G G G G+ G VG G+ VG G
Sbjct 988 GQRGIVGMPGQRGERGMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPE 1047
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ D+
Sbjct 1048 GPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDA 1095
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 42/105 (40%), Gaps = 18/105 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSVGSVGSVGSV 42
G G G G G G+ G VG G+ VG G G G+ G+
Sbjct 997 GQRGERGMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPEGPAGNDGTP 1056
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G
Sbjct 1057 GRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGEP 1101
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G+ G G G GS+G G GS+G G GS G +G G G+ G G G+ G
Sbjct 586 GPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDLGKPGEAGNAGVPGQRGAPGKD 645
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VG G VG G G G G G
Sbjct 646 GEVGPSGPVGPPGLAGERGEQGPPGPT 672
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.46, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/121 (27%), Positives = 41/121 (33%), Gaps = 36/121 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------V 48
GS+G G GS+G G GS G +G G G+ G G G+ G G
Sbjct 601 GSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDLGKPGEAGNAGVPGQRGAPGKDGEVGPSGPVGPPGLA 660
Query 49 GSVGSVGSVGSV------------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G G G G G+VG +G G G+ G G
Sbjct 661 GERGEQGPPGPTGFQGLPGPPGPPGEGGKAGDQGVPGEPGAVGPLGPRGERGNPGERGEP 720
Query 85 G 85
G
Sbjct 721 G 721
Score = 31.2 bits (69), Expect = 0.88, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/131 (25%), Positives = 44/131 (33%), Gaps = 45/131 (34%)
Query 1 GSVGSVGSV---------------------------------------------GSVGSV 15
GSVG VG G G
Sbjct 211 GSVGPVGPRGPQGLQGQQGGVGPAGPPGEPGEPGPMGPIGSRGPEGPPGKPGEDGEPGRN 270
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
G+ G VG GS G+ G G+ G G G G G G G +G+ G+ G G G +G++
Sbjct 271 GNTGEVGFSGSPGARGFPGAPGLPGLKGHRGHKGLEGPKGEIGAPGAKGEAGPTGPMGAM 330
Query 76 GSVGSVGSVGS 86
G +G G G
Sbjct 331 GPLGPRGMPGE 341
Score = 29.3 bits (64), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/126 (25%), Positives = 42/126 (33%), Gaps = 45/126 (35%)
Query 6 VGSVGSVGSV---------------------------------------------GSVGS 20
GSVG VG G G
Sbjct 210 PGSVGPVGPRGPQGLQGQQGGVGPAGPPGEPGEPGPMGPIGSRGPEGPPGKPGEDGEPGR 269
Query 21 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 80
G+ G VG GS G+ G G+ G G G G G G G +G+ G+ G G G +G+
Sbjct 270 NGNTGEVGFSGSPGARGFPGAPGLPGLKGHRGHKGLEGPKGEIGAPGAKGEAGPTGPMGA 329
Query 81 VGSVGS 86
+G +G
Sbjct 330 MGPLGP 335
> dre:100004431 si:dkey-61l1.4
Length=1808
Score = 57.8 bits (138), Expect = 9e-09, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/86 (45%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G GS+G GS G G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G
Sbjct 1072 GKQGPPGSLGPQGSKGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQ 1131
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G VG G GS G VGS G G
Sbjct 1132 GHPGRVGLEGPTGSKGDVGSPGPKGK 1157
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/86 (45%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS+G GS G G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G G
Sbjct 1075 GPPGSLGPQGSKGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHP 1134
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG G GS G VGS G G G
Sbjct 1135 GRVGLEGPTGSKGDVGSPGPKGKPGP 1160
Score = 57.0 bits (136), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/85 (45%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS+G GS G G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G G G V
Sbjct 1078 GSLGPQGSKGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRV 1137
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G GS G VGS G G G G
Sbjct 1138 GLEGPTGSKGDVGSPGPKGKPGPNG 1162
Score = 56.2 bits (134), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/84 (45%), Positives = 41/84 (48%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G GS+G GS G G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G
Sbjct 1071 TGKQGPPGSLGPQGSKGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGP 1130
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G VG G GS G VGS G
Sbjct 1131 QGHPGRVGLEGPTGSKGDVGSPGP 1154
Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/86 (45%), Positives = 43/86 (50%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G GS+G GS G G +G GS GS G +G G G G G G GSV
Sbjct 1066 GAEGVTGKQGPPGSLGPQGSKGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSV 1125
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G VG G GS G VGS
Sbjct 1126 GLYGPQGHPGRVGLEGPTGSKGDVGS 1151
Score = 54.3 bits (129), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/86 (44%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G G G VG
Sbjct 1081 GPQGSKGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLE 1140
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G GS G VGS G G G G G
Sbjct 1141 GPTGSKGDVGSPGPKGKPGPNGFQGE 1166
Score = 54.3 bits (129), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/86 (44%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G G G VG G
Sbjct 1084 GSKGKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPT 1143
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G VGS G G G G G G
Sbjct 1144 GSKGDVGSPGPKGKPGPNGFQGEQGP 1169
Score = 54.3 bits (129), Expect = 9e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/86 (44%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G G G VG G GS
Sbjct 1087 GKQGPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGSK 1146
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VGS G G G G G G GS
Sbjct 1147 GDVGSPGPKGKPGPNGFQGEQGPQGS 1172
Score = 53.9 bits (128), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/85 (44%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G GS GS G +G G G G G G GSVG G G G VG G GS G V
Sbjct 1090 GPIGLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGSKGDV 1149
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G G G G G G GS G
Sbjct 1150 GSPGPKGKPGPNGFQGEQGPQGSQG 1174
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/86 (44%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS GS G +G G G G G G GSVG G G G VG G GS G VGS G
Sbjct 1096 GSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGSKGDVGSPGPK 1155
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G GS G +G+ G
Sbjct 1156 GKPGPNGFQGEQGPQGSQGVLGAPGP 1181
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/86 (43%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G +G G G G G G GSVG G G G VG G GS G VGS G G
Sbjct 1099 GSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGSKGDVGSPGPKGKP 1158
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G GS G +G+ G G
Sbjct 1159 GPNGFQGEQGPQGSQGVLGAPGPRGK 1184
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/86 (44%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS GS G +G G G G G G GSVG G G G VG G GS G VGS
Sbjct 1093 GLPGSPGSSGMIGQTGEKGEQGVPGPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGSKGDVGSP 1152
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G GS G +G+
Sbjct 1153 GPKGKPGPNGFQGEQGPQGSQGVLGA 1178
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G+ G G G G G VG G G G G G G G G G+VG+
Sbjct 661 GEKGEEGFLGAPGPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHDGKRGPAGTVGAP 720
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G VG+ G GS G G G +G
Sbjct 721 GATGLVGAQGVNGSEGDAGPAGPIGR 746
Score = 47.8 bits (112), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G+ G G G G G VG G G G G G G G G G+VG+ G+
Sbjct 664 GEEGFLGAPGPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHDGKRGPAGTVGAPGAT 723
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG+ G GS G G G +G G
Sbjct 724 GLVGAQGVNGSEGDAGPAGPIGRKGP 749
Score = 47.8 bits (112), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G G VG G G G G G G G G G+VG+ G+ G VG+
Sbjct 670 GAPGPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHDGKRGPAGTVGAPGATGLVGAQ 729
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G GS G G G +G G G G+
Sbjct 730 GVNGSEGDAGPAGPIGRKGPQGPRGT 755
Score = 47.8 bits (112), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G+ G G G G G VG G G G G G G G G G+VG+ G+ G V
Sbjct 667 GFLGAPGPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHDGKRGPAGTVGAPGATGLV 726
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G GS G G G +G G G
Sbjct 727 GAQGVNGSEGDAGPAGPIGRKGPQGP 752
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G VG G G G G G G G G G+VG+ G+ G VG+ G
Sbjct 673 GPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHDGKRGPAGTVGAPGATGLVGAQGVN 732
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G G G +G G G G+ G
Sbjct 733 GSEGDAGPAGPIGRKGPQGPRGTDG 757
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
G G G +G+ G G G G G VG G G G G G G G G G+VG
Sbjct 659 PPGEKGEEGFLGAPGPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHDGKRGPAGTVG 718
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
+ G+ G VG+ G GS G G G +
Sbjct 719 APGATGLVGAQGVNGSEGDAGPAGPI 744
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/90 (36%), Positives = 40/90 (44%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G +G+ G G G G G VG G G G G G G
Sbjct 649 GPRGYKGDTAPPGEKGEEGFLGAPGPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHD 708
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G+VG+ G+ G VG+ G GS D+
Sbjct 709 GKRGPAGTVGAPGATGLVGAQGVNGSEGDA 738
Score = 45.1 bits (105), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/87 (36%), Positives = 38/87 (43%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G+ G G G G G VG G G G G G G G G
Sbjct 655 GDTAPPGEKGEEGFLGAPGPRGDKGQTGQKGFVGLQGVEGIPGQPGPKGDPGHDGKRGPA 714
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+VG+ G+ G VG+ G GS G G
Sbjct 715 GTVGAPGATGLVGAQGVNGSEGDAGPA 741
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/90 (41%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G GSVG G G G VG G GS G VGS G G G G G G GS G +
Sbjct 1117 GPAGDPGSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGSKGDVGSPGPKGKPGPNGFQGEQGPQGSQGVL 1176
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G+ G G G +G G G+ G G D
Sbjct 1177 GAPGPRGKEGGIGPPGITGNQGPKGQKGDP 1206
Score = 43.1 bits (100), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/75 (40%), Positives = 35/75 (46%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
S+G GSVG+ G G G G +G G G GS G G G GS G G G G++G
Sbjct 941 SLGVSGSVGNPGDKGPHGLRGVIGEPGKQGPSGSQGPPGRPGQDGSQGPPGEKGYPGAIG 1000
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVG 76
G G G G G
Sbjct 1001 LRGPPGHTGERGEPG 1015
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/86 (41%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GSVG G G G VG G GS G VGS G G G G G G GS G +G+ G
Sbjct 1123 GSVGLYGPQGHPGRVGLEGPTGSKGDVGSPGPKGKPGPNGFQGEQGPQGSQGVLGAPGPR 1182
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G +G G G+ G G G G
Sbjct 1183 GKEGGIGPPGITGNQGPKGQKGDPGH 1208
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/111 (30%), Positives = 43/111 (38%), Gaps = 21/111 (18%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G+VG+ G+ G VG+ G GS G G G +G G G G+
Sbjct 697 GQPGPKGDPGHDGKRGPAGTVGAPGATGLVGAQGVNGSEGDAGPAGPIGRKGPQGPRGTD 756
Query 61 G---------------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G +G G VG+ G G G +G D
Sbjct 757 GIRGPPGQPGLQGLPGQGGPQGLKGDIGKEGPVGNRGLQGIEGPMGMTGDP 807
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 42/107 (39%), Gaps = 21/107 (19%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----- 55
G G G G G+VG+ G+ G VG+ G GS G G G +G G G G+ G
Sbjct 703 GDPGHDGKRGPAGTVGAPGATGLVGAQGVNGSEGDAGPAGPIGRKGPQGPRGTDGIRGPP 762
Query 56 ----------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G VG+ G G G +G G G
Sbjct 763 GQPGLQGLPGQGGPQGLKGDIGKEGPVGNRGLQGIEGPMGMTGDPGP 809
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/68 (39%), Positives = 32/68 (47%), Gaps = 0/68 (0%)
Query 20 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 79
S+G GSVG+ G G G G +G G G GS G G G GS G G G G++G
Sbjct 941 SLGVSGSVGNPGDKGPHGLRGVIGEPGKQGPSGSQGPPGRPGQDGSQGPPGEKGYPGAIG 1000
Query 80 SVGSVGSV 87
G G
Sbjct 1001 LRGPPGHT 1008
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.018, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 21/107 (19%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-------------- 46
G G+VG+ G+ G VG+ G GS G G G +G G G G+ G
Sbjct 712 GPAGTVGAPGATGLVGAQGVNGSEGDAGPAGPIGRKGPQGPRGTDGIRGPPGQPGLQGLP 771
Query 47 -------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G VG+ G G G +G G G G G G+
Sbjct 772 GQGGPQGLKGDIGKEGPVGNRGLQGIEGPMGMTGDPGPKGFPGVTGN 818
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.026, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 21/107 (19%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----------------- 43
G+VG+ G+ G VG+ G GS G G G +G G G G+ G
Sbjct 715 GTVGAPGATGLVGAQGVNGSEGDAGPAGPIGRKGPQGPRGTDGIRGPPGQPGLQGLPGQG 774
Query 44 ----SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G VG+ G G G +G G G G G G+ G
Sbjct 775 GPQGLKGDIGKEGPVGNRGLQGIEGPMGMTGDPGPKGFPGVTGNRGP 821
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/107 (33%), Positives = 41/107 (38%), Gaps = 21/107 (19%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-- 58
G G+ G G G VG G +G G GS G G G GS GS G G G G G
Sbjct 862 GQPGAAGIQGIDGEVGPQGMLGKEGQKGSRGEPGGNGRTGSKGSRGRAGQHGPPGIPGIV 921
Query 59 -------------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
S+G GSVG+ G G G G +G G
Sbjct 922 VREFNWDYEVQLVLRDQKESLGVSGSVGNPGDKGPHGLRGVIGEPGK 968
> hsa:1290 COL5A2, MGC105115; collagen, type V, alpha 2; K06236
collagen, type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1499
Score = 57.4 bits (137), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G
Sbjct 1044 GEPGPEGPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDP 1103
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GS G +G G G G G G G D
Sbjct 1104 GSRGPIGPPGRAGKRGLPGPQGPRGDKGDH 1133
Score = 57.0 bits (136), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/88 (38%), Positives = 41/88 (46%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VG G G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G
Sbjct 1043 VGEPGPEGPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGD 1102
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GS G +G G G G G G D
Sbjct 1103 PGSRGPIGPPGRAGKRGLPGPQGPRGDK 1130
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G +
Sbjct 1050 GPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDPGSRGPI 1109
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G D
Sbjct 1110 GPPGRAGKRGLPGPQGPRGDKGDHGDRGDR 1139
Score = 56.6 bits (135), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS
Sbjct 1047 GPEGPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDPGSR 1106
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G +G G G G G G G G D
Sbjct 1107 GPIGPPGRAGKRGLPGPQGPRGDKGDHGDR 1136
Score = 54.3 bits (129), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/92 (39%), Positives = 42/92 (45%), Gaps = 0/92 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G +G G G G G G+VG G VG G+ G+ G GS G
Sbjct 477 GEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLP 536
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLL 92
G G+ G G VGS G GS G G + L
Sbjct 537 GPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGL 568
Score = 54.3 bits (129), Expect = 8e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G +G G
Sbjct 1056 GTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDPGSRGPIGPPGRA 1115
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G
Sbjct 1116 GKRGLPGPQGPRGDKGDHGDRGDRGQ 1141
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 38/85 (44%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G +G G G G
Sbjct 1062 GAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDPGSRGPIGPPGRAGKRGLP 1121
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G G G
Sbjct 1122 GPQGPRGDKGDHGDRGDRGQKGHRG 1146
Score = 53.9 bits (128), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G +G G G
Sbjct 1059 GRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDPGSRGPIGPPGRAGKR 1118
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G
Sbjct 1119 GLPGPQGPRGDKGDHGDRGDRGQKGH 1144
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/88 (39%), Positives = 40/88 (45%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G G G G G G +G G G G G G+VG G VG G+ G+ G GS
Sbjct 473 PGFKGEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGS 532
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G+ G G VGS G GS D
Sbjct 533 DGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDP 560
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G G G G G+VG G VG G+ G+ G GS G G G+ G G VGS
Sbjct 492 GPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSS 551
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS G G G G G+ G G+
Sbjct 552 GPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNP 578
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/90 (40%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G VGS G GS G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G
Sbjct 537 GPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGED 596
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G GS+G G GS+G G GS D
Sbjct 597 GRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDP 626
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/86 (40%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G G G G G+VG G VG G+ G+ G GS G G G+ G
Sbjct 486 GPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGER 545
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VGS G GS G G G G G+
Sbjct 546 GPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGLPGA 571
Score = 52.0 bits (123), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 45/90 (50%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+VG G VG G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G GS G G G
Sbjct 507 GDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDPGRPGEP 566
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G+ G G G +G +G+ +
Sbjct 567 GLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGED 596
Score = 51.6 bits (122), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/85 (41%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G+VG G VG G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G
Sbjct 495 GPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPK 554
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G G G G G+ G G+ G
Sbjct 555 GSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPG 579
Score = 51.2 bits (121), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G G +G G G G G G+VG G VG G+
Sbjct 465 GQPGDPGVPGFKGEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAP 524
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G GS G G G+ G G VGS
Sbjct 525 GNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGS 550
Score = 51.2 bits (121), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+VG G VG G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G GS G G
Sbjct 504 GPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDPGRP 563
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G+ G G+ G G G +G +
Sbjct 564 GEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPL 590
Score = 51.2 bits (121), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VGS G GS G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+
Sbjct 546 GPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSI 605
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G GS+G G GS G G G
Sbjct 606 GIRGQPGSMGLPGPKGSSGDPGKPGEA 632
Score = 50.8 bits (120), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VGS G GS G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G
Sbjct 543 GERGPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPP 602
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GS+G G GS+G G GS G G ++
Sbjct 603 GSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDPGKPGEA 632
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+VG G VG G+ G+ G GS G G G+ G G VGS G GS G
Sbjct 501 GKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNRGFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDP 560
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G+ G G+ G G G +
Sbjct 561 GRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKL 587
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/85 (41%), Positives = 43/85 (50%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G G+ G G VGS G GS G G G G G+ G G+ G G G +G +
Sbjct 531 GSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPL 590
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G+ G G G GS+G G GS+G
Sbjct 591 GAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMG 615
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G +G G G G G G+VG G VG G+ G+
Sbjct 468 GDPGVPGFKGEAGPKGEPGPHGIQGPIGPPGEEGKRGPRGDPGTVGPPGPVGERGAPGNR 527
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G GS G G G+ G G VGS G
Sbjct 528 GFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGP 553
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G
Sbjct 552 GPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQP 611
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS+G G GS G G G G+ G
Sbjct 612 GSMGLPGPKGSSGDPGKPGEAGNAG 636
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G G+ G G VGS G GS G G G G G+ G G+ G G G +
Sbjct 528 GFPGSDGLPGPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKL 587
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G +G+ G G G GS+G G GS+
Sbjct 588 GPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSM 614
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/84 (39%), Positives = 41/84 (48%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G+ G G VGS G GS G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G
Sbjct 536 PGPKGAQGERGPVGSSGPKGSQGDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGE 595
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G GS+G G GS+G G
Sbjct 596 DGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGP 619
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/87 (36%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G GS+G
Sbjct 558 GDPGRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLP 617
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS G G G G+ G G G+
Sbjct 618 GPKGSSGDPGKPGEAGNAGVPGQRGAP 644
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G GS+G G
Sbjct 561 GRPGEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPK 620
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G G G G+ G G G+ G
Sbjct 621 GSSGDPGKPGEAGNAGVPGQRGAPGK 646
Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/105 (33%), Positives = 44/105 (41%), Gaps = 18/105 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 42
G G G G+ G VG G+ VG G G G+ G+ G G+V
Sbjct 1005 GMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPEGPAGNDGTPGRDGAV 1064
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS G +
Sbjct 1065 GERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDPGSRGPI 1109
Score = 47.0 bits (110), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G G+ G G G +G +G+ G G G GS+G G GS+G G GS
Sbjct 564 GEPGLPGARGLTGNPGVQGPEGKLGPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSS 623
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G+ G G G+ G G
Sbjct 624 GDPGKPGEAGNAGVPGQRGAPGKDGE 649
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/104 (33%), Positives = 43/104 (41%), Gaps = 18/104 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSV 42
G G G G G+ G VG G+ VG G G G+ G+ G
Sbjct 1002 GERGMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPEGPAGNDGTPGRD 1061
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ G G G GS
Sbjct 1062 GAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDAGQRGDPGS 1105
Score = 45.1 bits (105), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/108 (33%), Positives = 45/108 (41%), Gaps = 18/108 (16%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSV 42
G G VG G G G G G G+ G VG G+ VG G
Sbjct 990 GQRGIVGMPGQRGERGMPGLPGPAGTPGKVGPTGATGDKGPPGPVGPPGSNGPVGEPGPE 1049
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G+ G G+VG G G G G GS G+ G+ G VG+ D+
Sbjct 1050 GPAGNDGTPGRDGAVGERGDRGDPGPAGLPGSQGAPGTPGPVGAPGDA 1097
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G+ G G G GS+G G GS+G G GS G G G G+ G G G+ G
Sbjct 588 GPLGAPGEDGRPGPPGSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDPGKPGEAGNAGVPGQRGAPGKD 647
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VG G VG G G G G G
Sbjct 648 GEVGPSGPVGPPGLAGERGEQGPPGPT 674
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.25, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/131 (27%), Positives = 44/131 (33%), Gaps = 45/131 (34%)
Query 1 GSVGSVGSV---------------------------------------------GSVGSV 15
GSVG VG G G
Sbjct 213 GSVGPVGPRGPQGLQGQQGGAGPTGPPGEPGDPGPMGPIGSRGPEGPPGKPGEDGEPGRN 272
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
G+ G VG GS G+ G G+ G G G G G G G VG+ GS G G G +G++
Sbjct 273 GNPGEVGFAGSPGARGFPGAPGLPGLKGHRGHKGLEGPKGEVGAPGSKGEAGPTGPMGAM 332
Query 76 GSVGSVGSVGS 86
G +G G G
Sbjct 333 GPLGPRGMPGE 343
Score = 31.2 bits (69), Expect = 0.81, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/121 (27%), Positives = 40/121 (33%), Gaps = 36/121 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------V 48
GS+G G GS+G G GS G G G G+ G G G+ G G
Sbjct 603 GSIGIRGQPGSMGLPGPKGSSGDPGKPGEAGNAGVPGQRGAPGKDGEVGPSGPVGPPGLA 662
Query 49 GSVGSVGSVGSV------------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G G G G G+VG +G G G+ G G
Sbjct 663 GERGEQGPPGPTGFQGLPGPPGPPGEGGKPGDQGVPGDPGAVGPLGPRGERGNPGERGEP 722
Query 85 G 85
G
Sbjct 723 G 723
Score = 30.8 bits (68), Expect = 0.99, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/126 (26%), Positives = 42/126 (33%), Gaps = 45/126 (35%)
Query 6 VGSVGSVGSV---------------------------------------------GSVGS 20
GSVG VG G G
Sbjct 212 PGSVGPVGPRGPQGLQGQQGGAGPTGPPGEPGDPGPMGPIGSRGPEGPPGKPGEDGEPGR 271
Query 21 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 80
G+ G VG GS G+ G G+ G G G G G G G VG+ GS G G G +G+
Sbjct 272 NGNPGEVGFAGSPGARGFPGAPGLPGLKGHRGHKGLEGPKGEVGAPGSKGEAGPTGPMGA 331
Query 81 VGSVGS 86
+G +G
Sbjct 332 MGPLGP 337
> dre:100330523 col5a3a; collagen type V alpha-3a
Length=1887
Score = 57.0 bits (136), Expect = 1e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/89 (41%), Positives = 43/89 (48%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G VGS+G G G G G++G G G G+VG G VG
Sbjct 1256 GPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPRGPQGAIGGEGPQGMPGAVGQPGVVGEK 1315
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G G+ G+VG G VG G VG D
Sbjct 1316 GEDGEAGNPGNVGETGLVGEKGEVGEKGD 1344
Score = 55.8 bits (133), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/87 (41%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G G G G VGS+G G G G G++G G G G+VG G V
Sbjct 1253 GATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPRGPQGAIGGEGPQGMPGAVGQPGVV 1312
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G+ G+VG G VG G V
Sbjct 1313 GEKGEDGEAGNPGNVGETGLVGEKGEV 1339
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/86 (40%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G G G G G VGS+G G G G G++G G G G+VG
Sbjct 1250 GFKGATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPRGPQGAIGGEGPQGMPGAVGQP 1309
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG G G G+ G+VG G VG
Sbjct 1310 GVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLVGE 1335
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G G G G G G G VGS+G G G G G++G G G G+V
Sbjct 1247 GERGFKGATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPRGPQGAIGGEGPQGMPGAV 1306
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G VG G G G+ G+VG G V
Sbjct 1307 GQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLV 1333
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/105 (37%), Positives = 47/105 (44%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VGS+G G G G G++G G G G+VG G VG G G G+ G+VG G V
Sbjct 1274 GHVGSMGPPGQHGPRGPQGAIGGEGPQGMPGAVGQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLV 1333
Query 61 GSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G VG G GS G G+ G +G DS
Sbjct 1334 GEKGEVGEKGDAGPPGAAGPPGIRGIPGSDGPKGNPGPLGFPGDS 1378
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 43/90 (47%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G+ G G G G G G G VGS+G G G G G++G G
Sbjct 1241 GPKGDEGERGFKGATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPRGPQGAIGGEGPQ 1300
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+VG G VG G G G+ G+V ++
Sbjct 1301 GMPGAVGQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGET 1330
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G+ G G G G G G G VGS+G G G G G++G
Sbjct 1238 GMYGPKGDEGERGFKGATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPRGPQGAIGGE 1297
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G+VG G VG G G G+
Sbjct 1298 GPQGMPGAVGQPGVVGEKGEDGEAGN 1323
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 38/87 (43%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G+ G G G G G G G VGS+G G G G G++
Sbjct 1235 GQQGMYGPKGDEGERGFKGATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPRGPQGAI 1294
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G+VG G VG G G
Sbjct 1295 GGEGPQGMPGAVGQPGVVGEKGEDGEA 1321
Score = 48.1 bits (113), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G+ G G G G G G G VGS+G G G
Sbjct 1229 GEPGLRGQQGMYGPKGDEGERGFKGATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPR 1288
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G++G G G G+VG G VG
Sbjct 1289 GPQGAIGGEGPQGMPGAVGQPGVVGE 1314
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/100 (35%), Positives = 42/100 (42%), Gaps = 15/100 (15%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS- 59
G G G++G G G G+VG G VG G G G+ G+VG G VG G VG G
Sbjct 1286 GPRGPQGAIGGEGPQGMPGAVGQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLVGEKGEVGEKGDA 1345
Query 60 --------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G G+ G +G G G G G
Sbjct 1346 GPPGAAGPPGIRGIPGSDGPKGNPGPLGFPGDSGPSGEPG 1385
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/78 (37%), Positives = 34/78 (43%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
G G G G G G G G G+ G G G G G G G VGS+G G G
Sbjct 1229 GEPGLRGQQGMYGPKGDEGERGFKGATGPPGLQGMPGPPGEKGESGHVGSMGPPGQHGPR 1288
Query 70 GSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G++G G G G+V
Sbjct 1289 GPQGAIGGEGPQGMPGAV 1306
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/102 (35%), Positives = 43/102 (42%), Gaps = 12/102 (11%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------ 48
G G G+VG G VG G G G+ G+VG G VG G VG G
Sbjct 1298 GPQGMPGAVGQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLVGEKGEVGEKGDAGPPGAAGPPGIR 1357
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G GS G G+ G +G G G G G G G G+ D+
Sbjct 1358 GIPGSDGPKGNPGPLGFPGDSGPSGEPGVNGIDGGPGAKGDN 1399
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/101 (34%), Positives = 41/101 (40%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------VGSV 45
G+VG G VG G G G+ G+VG G VG G VG G GS
Sbjct 1304 GAVGQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLVGEKGEVGEKGDAGPPGAAGPPGIRGIPGSD 1363
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G +G G G G G G G G+ G G G
Sbjct 1364 GPKGNPGPLGFPGDSGPSGEPGVNGIDGGPGAKGDNGEPGK 1404
Score = 32.7 bits (73), Expect = 0.27, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/114 (28%), Positives = 40/114 (35%), Gaps = 27/114 (23%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G G G G VG G G G G G+ G G+ G G G
Sbjct 1019 GKTGPPGPAGVVGPQGKTGETGPTGDRGHPGAPGPPGEQGLPGAAGKEGTKGDPGPAGQP 1078
Query 46 GSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G +GS G G G +G G +G+ G GS G G++
Sbjct 1079 GKSGPAGRRGFRGERGLPGILGSSGLKGGEGPLGVAGPIGATGERGSSGPAGAI 1132
> hsa:1278 COL1A2, OI4; collagen, type I, alpha 2; K06236 collagen,
type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1366
Score = 56.2 bits (134), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 43/90 (47%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G+ G+ G G G G G G G++G VG+ G+ G G VG G G+
Sbjct 919 GAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNR 978
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G VG G+VG G G G D
Sbjct 979 GETGPSGPVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDK 1008
Score = 56.2 bits (134), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/91 (39%), Positives = 45/91 (49%), Gaps = 0/91 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VGS G G+ G G G+ G+ G G G G G G G++G VG+ G+ G G VG
Sbjct 912 VGSPGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGP 971
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G G+ G G G VG G+VG S Q
Sbjct 972 AGKHGNRGETGPSGPVGPAGAVGPRGPSGPQ 1002
Score = 55.5 bits (132), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 43/86 (50%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G+ G G G+ G+ G G G G G G G++G VG+ G+ G G VG
Sbjct 913 GSPGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGPA 972
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G G G VG G+VG G
Sbjct 973 GKHGNRGETGPSGPVGPAGAVGPRGP 998
Score = 54.3 bits (129), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/101 (36%), Positives = 45/101 (44%), Gaps = 5/101 (4%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G+ G G G G G G G++G VG+ G+ G G VG G G+ G G G V
Sbjct 928 GNPGNDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSGPV 987
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLL-----QNGL 96
G G+VG G G G G G G L NGL
Sbjct 988 GPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGEKGPRGLPGLKGHNGL 1028
Score = 53.5 bits (127), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/90 (36%), Positives = 42/90 (46%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G+ G G G G G G G++G VG+ G+ G G VG G G+ G G
Sbjct 925 GRDGNPGNDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPS 984
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G VG G+VG G G G G G +
Sbjct 985 GPVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGEK 1014
Score = 52.8 bits (125), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/93 (37%), Positives = 42/93 (45%), Gaps = 0/93 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G++G VG+ G+ G G VG G G+ G G G VG G+VG
Sbjct 937 GRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSGPVGPAGAVGPR 996
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G G G G G G G G G + LQ
Sbjct 997 GPSGPQGIRGDKGEPGEKGPRGLPGLKGHNGLQ 1029
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/97 (38%), Positives = 47/97 (48%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G+ G G+ G G+ G G G VG+ G G+ GS GSVG VG G +
Sbjct 190 GQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQTGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPI 249
Query 61 GSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G +G+VG+ G G G G VG
Sbjct 250 GSAGPPGFPGAPGPKGEIGAVGNAGPAGPAGPRGEVG 286
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/87 (42%), Positives = 47/87 (54%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G+ G G+ G G G VG+ G G+ GS GSVG VG G +GS G G
Sbjct 199 GEPGAPGENGTPGQTGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPIGSAGPPGFP 258
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G +G+VG+ G G G G V
Sbjct 259 GAPGPKGEIGAVGNAGPAGPAGPRGEV 285
Score = 47.8 bits (112), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 40/90 (44%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G++G VG+ G+ G G VG G G+ G G G VG G+VG G G G G G
Sbjct 952 GNIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGKHGNRGETGPSGPVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEP 1011
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G D
Sbjct 1012 GEKGPRGLPGLKGHNGLQGLPGIAGHHGDQ 1041
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G G G V
Sbjct 166 GFPGTPGLPGFKGIRGHNGLDGLKGQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQTGARGLPGERGRV 225
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G+ GS GSVG VG G +GS
Sbjct 226 GAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPIGSA 252
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/101 (35%), Positives = 46/101 (45%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G G G VG+ G G+ GS GSV
Sbjct 181 GHNGLDGLKGQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQTGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSV 240
Query 61 GSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG G +GS +G+VG+ G G G
Sbjct 241 GPVGPAGPIGSAGPPGFPGAPGPKGEIGAVGNAGPAGPAGP 281
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/98 (35%), Positives = 45/98 (45%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
GS G G G G+VG G +G +VGS G G+ G G G+ G+ G
Sbjct 877 GSRGERGLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPP 936
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G++G VG+ G+ G G VG G
Sbjct 937 GRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGPAGK 974
Score = 44.3 bits (103), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G G
Sbjct 163 GARGFPGTPGLPGFKGIRGHNGLDGLKGQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQTGARGLPGER 222
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VG+ G G+ GS GSVG VG G +
Sbjct 223 GRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPAGPI 249
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/99 (35%), Positives = 45/99 (45%), Gaps = 15/99 (15%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G G G VG+ G G+ GS GSV
Sbjct 181 GHNGLDGLKGQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQTGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSV 240
Query 64 GSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSV 87
G VG G +GS +G+VG+ G G
Sbjct 241 GPVGPAGPIGSAGPPGFPGAPGPKGEIGAVGNAGPAGPA 279
Score = 43.1 bits (100), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/97 (35%), Positives = 44/97 (45%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 50
GS G G G G+VG G +G +VGS G G+ G G G+ G+ G
Sbjct 876 PGSRGERGLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGNDGP 935
Query 51 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G++G VG+ G+ G G VG
Sbjct 936 PGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPVGPA 972
Score = 42.7 bits (99), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/94 (36%), Positives = 37/94 (39%), Gaps = 9/94 (9%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------VGSVGSVGSV 51
G VG G+VG G G G G G G G G G G G G G+
Sbjct 985 GPVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGEKGPRGLPGLKGHNGLQGLPGIAGHHGDQGAP 1044
Query 52 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GSVG G G G G G G G G+VG G
Sbjct 1045 GSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDGRTGHPGTVGPAG 1078
Score = 42.7 bits (99), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G
Sbjct 160 GPQGARGFPGTPGLPGFKGIRGHNGLDGLKGQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQTGARGLP 219
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G VG+ G G+ GS GSVG VG
Sbjct 220 GERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPVGPA 246
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VG G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G G+ G
Sbjct 159 VGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRGHNGLDGLKGQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQTGARGL 218
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G VG+ G G+ GS GSVG V
Sbjct 219 PGERGRVGAPGPAGARGSDGSVGPV 243
Score = 41.6 bits (96), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/97 (35%), Positives = 45/97 (46%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 50
+G GS G G G G+VG G +G +VGS G G+ G G G+ G+
Sbjct 873 LGLPGSRGERGLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGN 932
Query 51 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G++G VG+ G+ G G V
Sbjct 933 DGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGPHGPV 969
Score = 41.2 bits (95), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/100 (33%), Positives = 36/100 (36%), Gaps = 18/100 (18%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSV 42
G G G VG G+VG G G G G G G G G
Sbjct 979 GETGPSGPVGPAGAVGPRGPSGPQGIRGDKGEPGEKGPRGLPGLKGHNGLQGLPGIAGHH 1038
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 82
G G+ GSVG G G G G G G G G+VG G
Sbjct 1039 GDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKDGRTGHPGTVGPAG 1078
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/98 (34%), Positives = 46/98 (46%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G+ G +G GS G G G G+VG G +G +VGS G G+ G G
Sbjct 868 GAPGILGLPGSRGERGLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRD 927
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G+ G G G G G G G++G VG+ G+ G
Sbjct 928 GNPGNDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAPGP 965
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VG G+ G G+ G G G G G G G G+ G G G+ G G+ G
Sbjct 154 GERGVVGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRGHNGLDGLKGQPGAPGVKGEPGAPGENGTPGQT 213
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G G VG+ G G+ GS GSV
Sbjct 214 GARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSV 240
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/97 (34%), Positives = 46/97 (47%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGS 50
+G+ G +G GS G G G G+VG G +G +VGS G G+ G G
Sbjct 867 LGAPGILGLPGSRGERGLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGR 926
Query 51 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G+ G G G G G G G++G VG+ G+
Sbjct 927 DGNPGNDGPPGRDGQPGHKGERGYPGNIGPVGAAGAP 963
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/80 (37%), Positives = 32/80 (40%), Gaps = 0/80 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G G G G G+ GSVG G G G G G
Sbjct 1006 GDKGEPGEKGPRGLPGLKGHNGLQGLPGIAGHHGDQGAPGSVGPAGPRGPAGPSGPAGKD 1065
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 80
G G G+VG G G G
Sbjct 1066 GRTGHPGTVGPAGIRGPQGH 1085
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VG G G G G G G G G G G+ G G +GS G G G G+
Sbjct 562 GPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNK 621
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G VG+VG+ G G G G G+
Sbjct 622 GEPGVVGAVGTAGPSGPSGLPGERGAA 648
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VG G G G G G G G G G G+ G G +GS G G G G+ G
Sbjct 565 GEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEP 624
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G VG+VG+ G G G G G+ G
Sbjct 625 GVVGAVGTAGPSGPSGLPGERGAAG 649
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/117 (28%), Positives = 46/117 (39%), Gaps = 27/117 (23%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G G G G G G G+ G G + G+ G G VG+VG+ G
Sbjct 577 GEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGVVGAVGTAGPS 636
Query 49 GSVGSVGSVGSV---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G+ G +G+ G G+ G+ G+VG+ G G+ D
Sbjct 637 GPSGLPGERGAAGIPGGKGEKGEPGLRGEIGNPGRDGARGAPGAVGAPGPAGATGDR 693
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/88 (32%), Positives = 35/88 (39%), Gaps = 12/88 (13%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSV 51
G G VG G G G G G G G G G G+ G G + G+
Sbjct 562 GPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNK 621
Query 52 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 79
G G VG+VG+ G G G G G+ G
Sbjct 622 GEPGVVGAVGTAGPSGPSGLPGERGAAG 649
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.053, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/88 (32%), Positives = 35/88 (39%), Gaps = 12/88 (13%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSV 54
G G VG G G G G G G G G G G+ G G + G+
Sbjct 562 GPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNK 621
Query 55 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 82
G G VG+VG+ G G G G G+ G
Sbjct 622 GEPGVVGAVGTAGPSGPSGLPGERGAAG 649
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.36, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/75 (38%), Positives = 34/75 (45%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
G G VG G G G G G G G G G G+ G G +GS G G G G+
Sbjct 562 GPAGEVGKPGERGLHGEFGLPGPAGPRGERGPPGESGAAGPTGPIGSRGPSGPPGPDGNK 621
Query 76 GSVGSVGSVGSVSDS 90
G G VG+VG+ S
Sbjct 622 GEPGVVGAVGTAGPS 636
Score = 31.6 bits (70), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/99 (37%), Positives = 46/99 (46%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----- 55
GS GSVG VG G +GS G G G+ G G +G+VG+ G G G G VG G
Sbjct 235 GSDGSVGPVGPAGPIGSAGPPGFPGAPGPKGEIGAVGNAGPAGPAGPRGEVGLPGLSGPV 294
Query 56 -------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
+ G G+ G+ G G G+ G G G G V
Sbjct 295 GPPGNPGANGLTGAKGAAGLPGVAGAPGLPGPRGIPGPV 333
Score = 31.6 bits (70), Expect = 0.64, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/113 (31%), Positives = 46/113 (40%), Gaps = 27/113 (23%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G VG G VG+VG G G G G +G+ G +G GS G G
Sbjct 826 GPVGRTGEVGAVGPPGFAGEKGPSGEAGTAGPPGTPGPQGLLGAPGILGLPGSRGERGLP 885
Query 46 GSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+VG G +G +VGS G G+ G G G+ G+ G G
Sbjct 886 GVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGR 938
Score = 30.4 bits (67), Expect = 1.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/110 (32%), Positives = 46/110 (41%), Gaps = 24/110 (21%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSVGSV 45
G G VG G VG+VG G G G G +G+ G +G GS G
Sbjct 823 GDQGPVGRTGEVGAVGPPGFAGEKGPSGEAGTAGPPGTPGPQGLLGAPGILGLPGSRGER 882
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVG---------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G+VG G +G G+VGS G G+ G G G+ G+
Sbjct 883 GLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGN 932
Score = 30.4 bits (67), Expect = 1.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/101 (33%), Positives = 45/101 (44%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G G VG+VG+ G G G G G+ G +G+ G G+ G+ G+V
Sbjct 622 GEPGVVGAVGTAGPSGPSGLPGERGAAGIPGGKGEKGEPGLRGEIGNPGRDGARGAPGAV 681
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G G+ G G G+ G G G GS G G VG G
Sbjct 682 GAPGPAGATGDRGEAGAAGPAGPAGPRGSPGERGEVGPAGP 722
Score = 30.0 bits (66), Expect = 1.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/114 (31%), Positives = 46/114 (40%), Gaps = 24/114 (21%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSVGSV 45
G G G VG G VG+VG G G G G +G+ G +G GS
Sbjct 820 GPRGDQGPVGRTGEVGAVGPPGFAGEKGPSGEAGTAGPPGTPGPQGLLGAPGILGLPGSR 879
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G+VG G +G G+VGS G G+ G G G+ +
Sbjct 880 GERGLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGRDGNPGND 933
Score = 28.9 bits (63), Expect = 4.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/82 (36%), Positives = 41/82 (50%), Gaps = 0/82 (0%)
Query 9 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 68
+G+ G +G GS G G G G+VG G +G G G+ G G+VGS G G+ G G
Sbjct 867 LGAPGILGLPGSRGERGLPGVAGAVGEPGPLGIAGPPGARGPPGAVGSPGVNGAPGEAGR 926
Query 69 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G+ G+ G G G G +
Sbjct 927 DGNPGNDGPPGRDGQPGHKGER 948
> mmu:239126 C1qtnf9, 9130217G22Rik, CTRP9, Ciqtnf9; C1q and tumor
necrosis factor related protein 9
Length=333
Score = 56.2 bits (134), Expect = 2e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS GS G G GS+G G G G G G G G VG G G +GS G +G
Sbjct 89 GDPGSRGSPGKHGPKGSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEVGPTGPEGLMGSTGPLGPK 148
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G +G +G G G G +G G
Sbjct 149 GLPGPMGPIGKPGPRGEAGPMGPQGE 174
Score = 55.8 bits (133), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS GS G G GS+G G G G G G G G VG G G +GS G +G G
Sbjct 92 GSRGSPGKHGPKGSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEVGPTGPEGLMGSTGPLGPKGLP 151
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G +G +G G G G +G G G
Sbjct 152 GPMGPIGKPGPRGEAGPMGPQGEPG 176
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G V + G G GS GS G G GS+G G G G G G G G VG G G +
Sbjct 80 GRVEAKGIKGDPGSRGSPGKHGPKGSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEVGPTGPEGLM 139
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
GS G +G G G +G +G G G
Sbjct 140 GSTGPLGPKGLPGPMGPIGKPGPRGEA 166
Score = 52.4 bits (124), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G V + G G GS GS G G GS+G G G G G G G G VG
Sbjct 74 GEPGADGRVEAKGIKGDPGSRGSPGKHGPKGSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEVGPT 133
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G +GS G +G G G +G +G
Sbjct 134 GPEGLMGSTGPLGPKGLPGPMGPIGK 159
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/90 (36%), Positives = 39/90 (43%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G GS+G G G G G G G G VG G G +GS G +G G G +G +
Sbjct 98 GKHGPKGSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEVGPTGPEGLMGSTGPLGPKGLPGPMGPI 157
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G +G G G G G D
Sbjct 158 GKPGPRGEAGPMGPQGEPGVRGMRGWKGDR 187
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G V + G G GS GS G G GS+G G G G G G G G VG G
Sbjct 77 GADGRVEAKGIKGDPGSRGSPGKHGPKGSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEVGPTGPE 136
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +GS G +G G G +G +G G
Sbjct 137 GLMGSTGPLGPKGLPGPMGPIGKPGP 162
Score = 52.0 bits (123), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G V + G G GS GS G G GS+G G G G G G G G V
Sbjct 71 GEKGEPGADGRVEAKGIKGDPGSRGSPGKHGPKGSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEV 130
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G +GS G +G G G +G +
Sbjct 131 GPTGPEGLMGSTGPLGPKGLPGPMGPI 157
Score = 50.8 bits (120), Expect = 9e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS+G G G G G G G G VG G G +GS G +G G G +G +G G
Sbjct 104 GSIGPTGEQGLPGETGPQGQKGDKGEVGPTGPEGLMGSTGPLGPKGLPGPMGPIGKPGPR 163
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G +G G G G G G G
Sbjct 164 GEAGPMGPQGEPGVRGMRGWKGDRGE 189
> mmu:12815 Col11a2; collagen, type XI, alpha 2; K06236 collagen,
type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1650
Score = 55.8 bits (133), Expect = 3e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G G G +G G G+ G G G G+ G G+VG+ G G VG G
Sbjct 1214 GQPGSPGPTGENGPPGPLGKRGPAGTPGPEGRQGEKGAKGDPGAVGAPGKTGPVGPAGLA 1273
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G GSVG G G+ G
Sbjct 1274 GKPGPDGLRGLPGSVGQQGRPGATGQA 1300
Score = 55.5 bits (132), Expect = 4e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G GS G G G G +G G G+ G G G G+ G G+VG+ G G VG
Sbjct 1211 GEPGQPGSPGPTGENGPPGPLGKRGPAGTPGPEGRQGEKGAKGDPGAVGAPGKTGPVGPA 1270
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G GSVG G G+
Sbjct 1271 GLAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRPGAT 1297
Score = 55.1 bits (131), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G GS G G G G +G G G+ G G G G+ G G+VG+ G
Sbjct 1205 GDRGEDGEPGQPGSPGPTGENGPPGPLGKRGPAGTPGPEGRQGEKGAKGDPGAVGAPGKT 1264
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG G G G G G GSVG
Sbjct 1265 GPVGPAGLAGKPGPDGLRGLPGSVGQ 1290
Score = 54.7 bits (130), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G GS G G G G +G G G+ G G G G+ G G+VG+
Sbjct 1202 GAKGDRGEDGEPGQPGSPGPTGENGPPGPLGKRGPAGTPGPEGRQGEKGAKGDPGAVGAP 1261
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G VG G G G G G GSV
Sbjct 1262 GKTGPVGPAGLAGKPGPDGLRGLPGSV 1288
Score = 54.7 bits (130), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G GS G G G G +G G G+ G G G G+ G G+VG+ G G V
Sbjct 1208 GEDGEPGQPGSPGPTGENGPPGPLGKRGPAGTPGPEGRQGEKGAKGDPGAVGAPGKTGPV 1267
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G GSVG G
Sbjct 1268 GPAGLAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRP 1294
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 41/105 (39%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G G+VG+ G G VG G G G G G GSVG G G+ G
Sbjct 1241 GPEGRQGEKGAKGDPGAVGAPGKTGPVGPAGLAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRPGATGQA 1300
Query 61 ---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G G +G +G G G D
Sbjct 1301 GPPGPVGPPGLPGLRGDAGAKGEKGHPGLIGLIGPTGEQGEKGDR 1345
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/105 (31%), Positives = 42/105 (40%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G G+ G G+VG+ G G VG G G G G G GSVG G
Sbjct 1235 GPAGTPGPEGRQGEKGAKGDPGAVGAPGKTGPVGPAGLAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRP 1294
Query 61 GSVGSV---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G+ G G G+ G G G +G +G +
Sbjct 1295 GATGQAGPPGPVGPPGLPGLRGDAGAKGEKGHPGLIGLIGPTGEQ 1339
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/100 (33%), Positives = 40/100 (40%), Gaps = 15/100 (15%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------ 54
G G+ G G+VG+ G G VG G G G G G GSVG G G+ G
Sbjct 1247 GEKGAKGDPGAVGAPGKTGPVGPAGLAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRPGATGQAGPPGPV 1306
Query 55 ---------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G+ G G G +G +G G G G G
Sbjct 1307 GPPGLPGLRGDAGAKGEKGHPGLIGLIGPTGEQGEKGDRG 1346
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 42/105 (40%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------------- 45
G+VG+ G G VG G G G G G GSVG G G+ G
Sbjct 1256 GAVGAPGKTGPVGPAGLAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRPGATGQAGPPGPVGPPGLPGLR 1315
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G G +G +G G G G G G GS G ++
Sbjct 1316 GDAGAKGEKGHPGLIGLIGPTGEQGEKGDRGLPGPQGSPGQKGET 1360
Score = 42.4 bits (98), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/101 (32%), Positives = 40/101 (39%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------- 51
G+ G G+VG+ G G VG G G G G G GSVG G G+ G
Sbjct 1250 GAKGDPGAVGAPGKTGPVGPAGLAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRPGATGQAGPPGPVGPP 1309
Query 52 ------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G G G +G +G G G G G G
Sbjct 1310 GLPGLRGDAGAKGEKGHPGLIGLIGPTGEQGEKGDRGLPGP 1350
> dre:336471 col1a2, alpha2(I), hm:zehn2357, wu:fa98d05, wu:fa99g10,
wu:fb04c08, wu:fb11d06, zehn2357; collagen, type I, alpha
2; K06236 collagen, type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1352
Score = 55.1 bits (131), Expect = 6e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/93 (37%), Positives = 46/93 (49%), Gaps = 0/93 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G+VG G+ G G G
Sbjct 918 GSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRPGNRGESGPSGPT 977
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G+VG G+ G+ G G G G G D ++
Sbjct 978 GAVGPAGARGAPGPAGPRGEKGVAGEKGDRGMK 1010
Score = 53.9 bits (128), Expect = 1e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G+VG G+
Sbjct 909 GPQGEAGREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRPGNR 968
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G+VG G+ G+ G G +
Sbjct 969 GESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEK 998
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 43/85 (50%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G+VG G+ G G
Sbjct 915 GREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRPGNRGESGPS 974
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G+VG G+ G+ G G G G
Sbjct 975 GPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEKG 999
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G+VG
Sbjct 906 GMTGPQGEAGREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRP 965
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G G G+VG G+ G+ G
Sbjct 966 GNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPA 992
Score = 52.0 bits (123), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 43/85 (50%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
++G G G G G GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G
Sbjct 901 NIGMPGMTGPQGEAGREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSG 960
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
+VG G+ G G G G+VG G+
Sbjct 961 AVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGA 985
Score = 51.6 bits (122), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 43/87 (49%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G+V
Sbjct 903 GMPGMTGPQGEAGREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAV 962
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G G G G+VG G+ G+
Sbjct 963 GRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAP 989
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/83 (38%), Positives = 41/83 (49%), Gaps = 0/83 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
++G G G G G GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G
Sbjct 901 NIGMPGMTGPQGEAGREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSG 960
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
+VG G+ G G G G+VG
Sbjct 961 AVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPA 983
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/93 (37%), Positives = 43/93 (46%), Gaps = 0/93 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G+VG G+ G G G G+VG G+
Sbjct 927 GRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGAR 986
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G+ G G G G G G G G LQ
Sbjct 987 GAPGPAGPRGEKGVAGEKGDRGMKGLRGHPGLQ 1019
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 42/90 (46%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G+ G VG+ G G G+VG G+ G G G G+VG G+ G+ G G G G
Sbjct 942 GSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEKGVA 1001
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G DS
Sbjct 1002 GEKGDRGMKGLRGHPGLQGMPGPNGPSGDS 1031
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G+ G VG+ G G G+VG G+ G G G G+VG G+ G+ G G G
Sbjct 939 GEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEK 998
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G
Sbjct 999 GVAGEKGDRGMKGLRGHPGLQGMPGP 1024
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/105 (35%), Positives = 46/105 (43%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
GS G G G GSVG G ++G G G G G GS G+ G
Sbjct 867 GSRGDRGLPGIPGSVGEPGRVGPAGAPGARGPGGNIGMPGMTGPQGEAGREGSPGNDGPP 926
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G G GS G+ G VG+ G G G+VG G+ +S
Sbjct 927 GRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAPGPNGPSGAVGRPGNRGES 971
Score = 43.1 bits (100), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/87 (36%), Positives = 38/87 (43%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VG+ G G G+VG G+ G G G G+VG G+ G+ G G G G G G
Sbjct 948 GPVGAPGPNGPSGAVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEKGVAGEKGDR 1007
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G G G
Sbjct 1008 GMKGLRGHPGLQGMPGPNGPSGDSGPA 1034
Score = 41.2 bits (95), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/85 (36%), Positives = 37/85 (43%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G+VG G+ G G G G+VG G+ G+ G G G G G G G
Sbjct 951 GAPGPNGPSGAVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEKGVAGEKGDRGMK 1010
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G G G
Sbjct 1011 GLRGHPGLQGMPGPNGPSGDSGPAG 1035
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/75 (37%), Positives = 35/75 (46%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
G GS G G G +G G G+ G+ G G G G +G G G VG+ G+ G G
Sbjct 367 EEGKRGSTGEQGPTGPLGLRGPRGAAGTRGLPGLAGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPG 426
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVG 76
G G G VG+ G
Sbjct 427 DAGRAGEAGLVGARG 441
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/75 (37%), Positives = 35/75 (46%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
G GS G G G +G G G+ G+ G G G G +G G G VG+ G+ G G
Sbjct 367 EEGKRGSTGEQGPTGPLGLRGPRGAAGTRGLPGLAGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPG 426
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVG 79
G G G VG+ G
Sbjct 427 DAGRAGEAGLVGARG 441
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/75 (37%), Positives = 35/75 (46%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 8 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 67
G GS G G G +G G G+ G+ G G G G +G G G VG+ G+ G G
Sbjct 367 EEGKRGSTGEQGPTGPLGLRGPRGAAGTRGLPGLAGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPG 426
Query 68 SVGSVGSVGSVGSVG 82
G G G VG+ G
Sbjct 427 DAGRAGEAGLVGARG 441
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/75 (37%), Positives = 35/75 (46%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 11 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 70
G GS G G G +G G G+ G+ G G G G +G G G VG+ G+ G G
Sbjct 367 EEGKRGSTGEQGPTGPLGLRGPRGAAGTRGLPGLAGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPG 426
Query 71 SVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G VG+ G
Sbjct 427 DAGRAGEAGLVGARG 441
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/73 (38%), Positives = 35/73 (47%), Gaps = 0/73 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G G +G G G+ G+ G G G G +G G G VG+ G+ G G
Sbjct 369 GKRGSTGEQGPTGPLGLRGPRGAAGTRGLPGLAGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPGDA 428
Query 61 GSVGSVGSVGSVG 73
G G G VG+ G
Sbjct 429 GRAGEAGLVGARG 441
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/99 (37%), Positives = 44/99 (44%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSV 48
G +GS G G GS G G G GSVG G V G++G G G G
Sbjct 855 GQLGSQGFNGLPGSRGDRGLPGIPGSVGEPGRVGPAGAPGARGPGGNIGMPGMTGPQGEA 914
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS G+ G G G+ G G G GS G+ G VG+
Sbjct 915 GREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGDRGEPGSPGTAGPVGAP 953
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/87 (35%), Positives = 36/87 (41%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+VG G+ G G G G+VG G+ G+ G G G G G G G G G G
Sbjct 960 GAVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEKGVAGEKGDRGMKGLRGHPGLQ 1019
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G G G
Sbjct 1020 GMPGPNGPSGDSGPAGIAGPSGPRGPA 1046
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/73 (36%), Positives = 34/73 (46%), Gaps = 0/73 (0%)
Query 14 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 73
G GS G G G +G G G+ G+ G G G G +G G G VG+ G+ G G
Sbjct 367 EEGKRGSTGEQGPTGPLGLRGPRGAAGTRGLPGLAGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPG 426
Query 74 SVGSVGSVGSVGS 86
G G G VG+
Sbjct 427 DAGRAGEAGLVGA 439
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 36/86 (41%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+VG G+ G G G G+VG G+ G+ G G G G G G G G G
Sbjct 957 GPSGAVGRPGNRGESGPSGPTGAVGPAGARGAPGPAGPRGEKGVAGEKGDRGMKGLRGHP 1016
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G
Sbjct 1017 GLQGMPGPNGPSGDSGPAGIAGPSGP 1042
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/105 (35%), Positives = 40/105 (38%), Gaps = 18/105 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------ 54
G VG G G VG G G G G G G VG G G G +G +G G
Sbjct 783 GRVGPPGPAGIVGPAGLTGPAGKDGPRGPRGDVGPAGPPGENGMIGPLGLAGEKGPPGEA 842
Query 55 ------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G +GS G G GS G G G GSVG G V
Sbjct 843 GAPGAPGPAGPQGQLGSQGFNGLPGSRGDRGLPGIPGSVGEPGRV 887
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.020, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/108 (33%), Positives = 41/108 (37%), Gaps = 18/108 (16%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G VG G G VG G G G G G G VG G G G +G +G G
Sbjct 777 GFPGAPGRVGPPGPAGIVGPAGLTGPAGKDGPRGPRGDVGPAGPPGENGMIGPLGLAGEK 836
Query 61 ------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G +GS G G GS G G G GSV +
Sbjct 837 GPPGEAGAPGAPGPAGPQGQLGSQGFNGLPGSRGDRGLPGIPGSVGEP 884
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.14, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/132 (26%), Positives = 44/132 (33%), Gaps = 39/132 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----------------------- 37
G +G G G VG+ G+ G G G G G VG+ G
Sbjct 405 GPMGMPGPRGGVGAPGARGPPGDAGRAGEAGLVGARGLPGSPGSSGPPGKEGPSGAAGQD 464
Query 38 ----------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
++G G G G G G G VG G GS G G+ G G V
Sbjct 465 GRTGPPGPTGPRGQPGNIGFPGPKGPSGEAGKPGEKGPVGPTGLRGSPGPDGNNGPAGPV 524
Query 82 GSVGSVSDSLLQ 93
G G+ + Q
Sbjct 525 GLAGAPGEKGEQ 536
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/125 (27%), Positives = 41/125 (32%), Gaps = 39/125 (31%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-------------------------------- 28
G VG+ G+ G G G G G VG+ G
Sbjct 414 GGVGAPGARGPPGDAGRAGEAGLVGARGLPGSPGSSGPPGKEGPSGAAGQDGRTGPPGPT 473
Query 29 -------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
++G G G G G G G VG G GS G G+ G G VG G+ G
Sbjct 474 GPRGQPGNIGFPGPKGPSGEAGKPGEKGPVGPTGLRGSPGPDGNNGPAGPVGLAGAPGEK 533
Query 82 GSVGS 86
G G
Sbjct 534 GEQGP 538
Score = 32.7 bits (73), Expect = 0.30, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/124 (27%), Positives = 41/124 (33%), Gaps = 39/124 (31%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-------------------- 40
G G +G G G VG+ G+ G G G G G VG+ G
Sbjct 402 GRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPGDAGRAGEAGLVGARGLPGSPGSSGPPGKEGPSGAA 461
Query 41 -------------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
++G G G G G G G VG G GS G G+ G
Sbjct 462 GQDGRTGPPGPTGPRGQPGNIGFPGPKGPSGEAGKPGEKGPVGPTGLRGSPGPDGNNGPA 521
Query 82 GSVG 85
G VG
Sbjct 522 GPVG 525
Score = 31.6 bits (70), Expect = 0.58, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/124 (26%), Positives = 40/124 (32%), Gaps = 39/124 (31%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------------- 43
G G +G G G VG+ G+ G G G G G VG+ G
Sbjct 401 AGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPGDAGRAGEAGLVGARGLPGSPGSSGPPGKEGPSGA 460
Query 44 --------------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 83
++G G G G G G G VG G GS G G+ G
Sbjct 461 AGQDGRTGPPGPTGPRGQPGNIGFPGPKGPSGEAGKPGEKGPVGPTGLRGSPGPDGNNGP 520
Query 84 VGSV 87
G V
Sbjct 521 AGPV 524
Score = 30.0 bits (66), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/83 (36%), Positives = 35/83 (42%), Gaps = 12/83 (14%)
Query 19 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSV 66
G +GS G G GS G G G GSVG G V G++G G G G
Sbjct 855 GQLGSQGFNGLPGSRGDRGLPGIPGSVGEPGRVGPAGAPGARGPGGNIGMPGMTGPQGEA 914
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G GS G+ G G G+ G D
Sbjct 915 GREGSPGNDGPPGRPGAAGIKGD 937
Score = 28.9 bits (63), Expect = 4.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/120 (29%), Positives = 42/120 (35%), Gaps = 33/120 (27%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSV 42
G VG G G G +G +G G G +GS G G GS G
Sbjct 813 GDVGPAGPPGENGMIGPLGLAGEKGPPGEAGAPGAPGPAGPQGQLGSQGFNGLPGSRGDR 872
Query 43 GSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G GSVG G ++G G G G G GS G+ G G G+
Sbjct 873 GLPGIPGSVGEPGRVGPAGAPGARGPGGNIGMPGMTGPQGEAGREGSPGNDGPPGRPGAA 932
Score = 28.5 bits (62), Expect = 5.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/116 (31%), Positives = 42/116 (36%), Gaps = 30/116 (25%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------GSVGSVGSVGSV 42
G G G VG G G G +G +G G G +GS G G
Sbjct 807 GPRGPRGDVGPAGPPGENGMIGPLGLAGEKGPPGEAGAPGAPGPAGPQGQLGSQGFNGLP 866
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G G G GSVG G V G++G G G G G GS G+
Sbjct 867 GSRGDRGLPGIPGSVGEPGRVGPAGAPGARGPGGNIGMPGMTGPQGEAGREGSPGN 922
Score = 28.5 bits (62), Expect = 5.7, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/125 (26%), Positives = 41/125 (32%), Gaps = 39/125 (31%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----------- 49
G+ G G G G +G G G VG+ G+ G G G G G VG+ G
Sbjct 393 GTRGLPGLAGRSGPMGMPGPRGGVGAPGARGPPGDAGRAGEAGLVGARGLPGSPGSSGPP 452
Query 50 ----------------------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
++G G G G G G G VG G GS
Sbjct 453 GKEGPSGAAGQDGRTGPPGPTGPRGQPGNIGFPGPKGPSGEAGKPGEKGPVGPTGLRGSP 512
Query 82 GSVGS 86
G G+
Sbjct 513 GPDGN 517
Score = 28.5 bits (62), Expect = 5.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/117 (30%), Positives = 42/117 (35%), Gaps = 30/117 (25%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------GSVGSVGSVGSVGSV 42
G G VG G G G +G +G G G +GS G G GS
Sbjct 810 GPRGDVGPAGPPGENGMIGPLGLAGEKGPPGEAGAPGAPGPAGPQGQLGSQGFNGLPGSR 869
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G GSVG G V G++G G G G G GS G+ G
Sbjct 870 GDRGLPGIPGSVGEPGRVGPAGAPGARGPGGNIGMPGMTGPQGEAGREGSPGNDGPP 926
> dre:100006366 procollagen, type V, alpha 2-like
Length=1432
Score = 54.7 bits (130), Expect = 7e-08, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/87 (43%), Positives = 47/87 (54%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS GS G G G G GS G +G G G G+VGS G GS G++G VG G +G
Sbjct 242 GSPGSRGFPGLPGQPGLKGSKGQLGLQGMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVGPPGPIGMT 301
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G +G G+VG G G+VG G +
Sbjct 302 GERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPL 328
Score = 53.5 bits (127), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/86 (44%), Positives = 46/86 (53%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS GS G G G G GS G +G G G G+VGS G GS G++G VG G +
Sbjct 239 GYPGSPGSRGFPGLPGQPGLKGSKGQLGLQGMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVGPPGPI 298
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G +G G+VG G G+VG
Sbjct 299 GMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGK 324
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/87 (43%), Positives = 46/87 (52%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G GS GS G G G G GS G +G G G G+VGS G GS G++G VG
Sbjct 236 GEKGYPGSPGSRGFPGLPGQPGLKGSKGQLGLQGMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVGPP 295
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G +G G G +G G+VG G G+V
Sbjct 296 GPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNV 322
Score = 52.8 bits (125), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/84 (42%), Positives = 44/84 (52%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
+ G G GS GS G G G G GS G +G G G G+VGS G GS G++G VG
Sbjct 234 NAGEKGYPGSPGSRGFPGLPGQPGLKGSKGQLGLQGMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVG 293
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G +G G G +G G+VG G
Sbjct 294 PPGPIGMTGERGRIGPTGTVGKRG 317
Score = 52.8 bits (125), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/79 (43%), Positives = 44/79 (55%), Gaps = 0/79 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G GS G +G G G G+VGS G GS G++G VG G +G G G +G G+V
Sbjct 254 GQPGLKGSKGQLGLQGMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVGPPGPIGMTGERGRIGPTGTV 313
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVG 79
G G G+VG G +G +G
Sbjct 314 GKRGLSGNVGKPGPLGPMG 332
Score = 52.0 bits (123), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/82 (42%), Positives = 43/82 (52%), Gaps = 0/82 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
+ G G GS GS G G G G GS G +G G G G+VGS G GS G++G VG
Sbjct 234 NAGEKGYPGSPGSRGFPGLPGQPGLKGSKGQLGLQGMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVG 293
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G G +G G+VG
Sbjct 294 PPGPIGMTGERGRIGPTGTVGK 315
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/80 (42%), Positives = 42/80 (52%), Gaps = 0/80 (0%)
Query 8 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 67
+ G G GS GS G G G G GS G +G G G G+VGS G GS G++G VG
Sbjct 234 NAGEKGYPGSPGSRGFPGLPGQPGLKGSKGQLGLQGMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVG 293
Query 68 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G +G G G +G G+V
Sbjct 294 PPGPIGMTGERGRIGPTGTV 313
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/116 (33%), Positives = 52/116 (44%), Gaps = 0/116 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G GS G G+ GS G G+ G G G G G VG +G G G
Sbjct 356 GPSGLQGPRGESGRQGSPGKQGTQGSAGPDGTPGVKGPAGIPGVQGPVGLIGQPGLPGPQ 415
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQNGLLLSASVLTIEPRPRCETRAL 116
GS G G+ G +G +GS G G G+ + + ++ +EPR + E L
Sbjct 416 GSPGLTGAKGQLGDLGSPGFKGEPGAKGEVEKKENVVQEEMEGLLEPRVQMEKEEL 471
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/93 (41%), Positives = 49/93 (52%), Gaps = 0/93 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+VGS G GS G++G VG G +G G G +G G+VG G G+VG G +
Sbjct 269 GMKGEPGAVGSKGESGSPGTMGLVGPPGPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPL 328
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G +G G G GS G G G+ G S LQ
Sbjct 329 GPMGISGGPGFPGSPGMKGQAGATGPRGPSGLQ 361
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/99 (35%), Positives = 45/99 (45%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----------- 49
GS G++G VG G +G G G +G G+VG G G+VG G +G +G
Sbjct 284 GSPGTMGLVGPPGPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGPGFPGSP 343
Query 50 -SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G G G G G G GS G G+ GS
Sbjct 344 GMKGQAGATGPRGPSGLQGPRGESGRQGSPGKQGTQGSA 382
Score = 44.7 bits (104), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/98 (34%), Positives = 44/98 (44%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SV 48
G++G VG G +G G G +G G+VG G G+VG G +G +G
Sbjct 287 GTMGLVGPPGPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGPGFPGSPGMK 346
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G G G G G G GS G G+ GS G
Sbjct 347 GQAGATGPRGPSGLQGPRGESGRQGSPGKQGTQGSAGP 384
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/98 (35%), Positives = 44/98 (44%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----- 55
GS G GS G++G VG G +G G G +G G+VG G G+VG G +G +G
Sbjct 278 GSKGESGSPGTMGLVGPPGPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGP 337
Query 56 -------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G G G G G G GS G
Sbjct 338 GFPGSPGMKGQAGATGPRGPSGLQGPRGESGRQGSPGK 375
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/98 (34%), Positives = 43/98 (43%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSV 48
G VG G +G G G +G G+VG G G+VG G +G +G G
Sbjct 290 GLVGPPGPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGPGFPGSPGMKGQA 349
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G G G G G G GS G G+ GS G G+
Sbjct 350 GATGPRGPSGLQGPRGESGRQGSPGKQGTQGSAGPDGT 387
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/97 (34%), Positives = 42/97 (43%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSV 48
G G +G G G +G G+VG G G+VG G +G +G G G+
Sbjct 293 GPPGPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGPGFPGSPGMKGQAGAT 352
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G GS G G+ GS G G+ G
Sbjct 353 GPRGPSGLQGPRGESGRQGSPGKQGTQGSAGPDGTPG 389
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/99 (33%), Positives = 42/99 (42%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSV 48
G +G G G +G G+VG G G+VG G +G +G G G+ G
Sbjct 296 GPIGMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGPGFPGSPGMKGQAGATGPR 355
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G GS G G+ GS G G+ G G
Sbjct 356 GPSGLQGPRGESGRQGSPGKQGTQGSAGPDGTPGVKGPA 394
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/97 (34%), Positives = 41/97 (42%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSV 48
G G G +G G+VG G G+VG G +G +G G G+ G G
Sbjct 299 GMTGERGRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGPGFPGSPGMKGQAGATGPRGPS 358
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G GS G G+ GS G G+ G G G
Sbjct 359 GLQGPRGESGRQGSPGKQGTQGSAGPDGTPGVKGPAG 395
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/99 (34%), Positives = 42/99 (42%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G +G G+VG G G+VG G +G +G G G+ G G G G
Sbjct 305 GRIGPTGTVGKRGLSGNVGKPGPLGPMGISGGPGFPGSPGMKGQAGATGPRGPSGLQGPR 364
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G GS G G+ GS G G+ G G G G G V
Sbjct 365 GESGRQGSPGKQGTQGSAGPDGTPGVKGPAGIPGVQGPV 403
> dre:554269 col4a1, col4a5, fj65e07, im:7157877, si:ch211-174g17.1,
wu:fj65e07; collagen, type IV, alpha 1; K06237 collagen,
type IV, alpha
Length=1638
Score = 53.1 bits (126), Expect = 2e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/90 (38%), Positives = 43/90 (47%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G G G G GS G G G G +G GS+G G G+ G +G
Sbjct 929 GPTGEKGFPGTSGDPGMPGKDGMPGSPGQPGDKGDPGIIGKPGSIGEPGDTGARGDMGYP 988
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
GS+G G+ G GS G G G+ GS D
Sbjct 989 GSMGPKGAKGVGGSPGHPGFKGTDGSKGDK 1018
Score = 52.8 bits (125), Expect = 3e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/82 (37%), Positives = 39/82 (47%), Gaps = 0/82 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G G G G G+ G G G G GS G G G G +G GS+G
Sbjct 917 GDKGDIGDRGDPGPTGEKGFPGTSGDPGMPGKDGMPGSPGQPGDKGDPGIIGKPGSIGEP 976
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 82
G G+ G +G GS+G G+ G
Sbjct 977 GDTGARGDMGYPGSMGPKGAKG 998
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/89 (39%), Positives = 43/89 (48%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G G G G GS G G G G +G GS+G G G+ G +G GS+
Sbjct 932 GEKGFPGTSGDPGMPGKDGMPGSPGQPGDKGDPGIIGKPGSIGEPGDTGARGDMGYPGSM 991
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G+ G GS G G G+ GS G D
Sbjct 992 GPKGAKGVGGSPGHPGFKGTDGSKGDKGD 1020
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G G G G G+ G G G G GS G G G G +G GS+G G
Sbjct 920 GDIGDRGDPGPTGEKGFPGTSGDPGMPGKDGMPGSPGQPGDKGDPGIIGKPGSIGEPGDT 979
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G +G GS+G G+ G GS G
Sbjct 980 GARGDMGYPGSMGPKGAKGVGGSPGHP 1006
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G+ G G G G GS G G G G +G GS+G G G+
Sbjct 923 GDRGDPGPTGEKGFPGTSGDPGMPGKDGMPGSPGQPGDKGDPGIIGKPGSIGEPGDTGAR 982
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G +G GS+G G+ G GS G G
Sbjct 983 GDMGYPGSMGPKGAKGVGGSPGHPG 1007
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/89 (37%), Positives = 42/89 (47%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
+ G++GS G G G G G++G G+ G+ G G GS+G GS G G G G G
Sbjct 1034 TKGNIGSPGFPGEPGEKGQKGTMGMTGTPGTQGHKGDQGSIGYPGSPGKPGEKGVGGLPG 1093
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
S G G+ G G G G G G S
Sbjct 1094 SPGEPGTPGRPGEPGLQGPPGPHGEKGQS 1122
Score = 48.1 bits (113), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/75 (37%), Positives = 35/75 (46%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 13 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
G G +G G G G G G+ G G G G GS G G G G +G GS+G
Sbjct 917 GDKGDIGDRGDPGPTGEKGFPGTSGDPGMPGKDGMPGSPGQPGDKGDPGIIGKPGSIGEP 976
Query 73 GSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G +G GS+
Sbjct 977 GDTGARGDMGYPGSM 991
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/77 (37%), Positives = 39/77 (50%), Gaps = 0/77 (0%)
Query 17 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 76
+ G++GS G G G G G++G G+ G+ G G GS+G GS G G G G G
Sbjct 1034 TKGNIGSPGFPGEPGEKGQKGTMGMTGTPGTQGHKGDQGSIGYPGSPGKPGEKGVGGLPG 1093
Query 77 SVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
S G G+ G + LQ
Sbjct 1094 SPGEPGTPGRPGEPGLQ 1110
> pfa:PFD0260c sequestrin
Length=1964
Score = 52.4 bits (124), Expect = 4e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 19/89 (21%), Positives = 47/89 (52%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
+ +V + +VG + SVG + SV + +V + +V + +V + +V + +VG + + G
Sbjct 894 DIKNVDDIKNVGDIKSVGDIKSVDDINNVDGIKNVDGIKNVDGIKNVDGINNVGDINNAG 953
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
+ G + +VG + + + +V + ++
Sbjct 954 DTNNAGDINNVGDINNSVDIYNVEHIDEA 982
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/86 (19%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G + SVG + SV + +V + +V + +V + +V + +VG + + G + G + +V
Sbjct 905 GDIKSVGDIKSVDDINNVDGIKNVDGIKNVDGIKNVDGINNVGDINNAGDTNNAGDINNV 964
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G + + + +V + ++ +
Sbjct 965 GDINNSVDIYNVEHIDEAEKKPNLDN 990
> hsa:255631 COL24A1, MGC142214; collagen, type XXIV, alpha 1
Length=1714
Score = 52.0 bits (123), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 43/86 (50%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G +G +G G G G G VG G G G G G +G G VGS G
Sbjct 1077 GEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPP 1136
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G G+ G+ G+VG +G +G
Sbjct 1137 GKIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGP 1162
Score = 51.6 bits (122), Expect = 5e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G +G +G G G G G VG G G G G G +G G VGS
Sbjct 1074 GEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSR 1133
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G +G G G+ G+ G+VG +G
Sbjct 1134 GPPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHLG 1158
Score = 51.6 bits (122), Expect = 7e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 43/86 (50%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G +G +G G G G G VG G G G G G +G G VGS G G +
Sbjct 1080 GEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKI 1139
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G+ G+ G+VG +G +G G
Sbjct 1140 GKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGE 1165
Score = 50.8 bits (120), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/88 (37%), Positives = 40/88 (45%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G +G G VGS G G +G G G+ G+ G+VG +G +G G G
Sbjct 1110 GQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGEPGIP 1169
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVS 88
G G G G G G G G G S
Sbjct 1170 GYRGHQGQPGPSGLPGPKGEKGYPGEDS 1197
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G G +G +G G G G G VG G G G G G +G G V
Sbjct 1071 GLPGEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEV 1130
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
GS G G +G G G+ G+ G+VG +
Sbjct 1131 GSRGPPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHL 1157
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G +G G G G G VG G G G G G +G G VGS G G +G
Sbjct 1083 GLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKS 1142
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G+ G+ G+VG +G +G G G
Sbjct 1143 GPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGEPG 1167
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G G G G VG G G G G G +G G VGS G G +G G G+
Sbjct 1089 GPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGAR 1148
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G+VG +G +G G G G G
Sbjct 1149 GTRGAVGHLGLMGPDGEPGIPGYRGH 1174
Score = 48.9 bits (115), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G VG G G G G G +G G VGS G G +G G G+ G+
Sbjct 1092 GRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGTR 1151
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+VG +G +G G G G G G
Sbjct 1152 GAVGHLGLMGPDGEPGIPGYRGHQGQ 1177
Score = 48.9 bits (115), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/84 (38%), Positives = 39/84 (46%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
VG G G G G G +G G VGS G G +G G G+ G+ G+VG +G +G G
Sbjct 1106 VGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLMGPDGE 1165
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G
Sbjct 1166 PGIPGYRGHQGQPGPSGLPGPKGE 1189
Score = 48.9 bits (115), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/90 (36%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VG G G G G G +G G VGS G G +G G G+ G+ G+VG +G +
Sbjct 1101 GPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHLGLM 1160
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G +
Sbjct 1161 GPDGEPGIPGYRGHQGQPGPSGLPGPKGEK 1190
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G VG G G G G G +G G VGS G G +G G G+ G+ G+VG +
Sbjct 1098 GLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGTRGAVGHL 1157
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G +G G G G G G G G
Sbjct 1158 GLMGPDGEPGIPGYRGHQGQPGPSG 1182
Score = 48.1 bits (113), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G +G G +G +G G G G G VG G G G G G +G
Sbjct 1068 GGRGLPGEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPT 1127
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VGS G G +G G G+ G+ G+V
Sbjct 1128 GEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGTRGAV 1154
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G+ G G G G G GS G G G G G G VG G +G G
Sbjct 954 GPHGLIGKTGNPGERGFQGKPGLQGLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPP 1013
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G+ G G G G+ G VG+ GSVG
Sbjct 1014 GTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVG 1038
Score = 46.2 bits (108), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/93 (38%), Positives = 42/93 (45%), Gaps = 0/93 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G GS G G G G G G VG G +G G G+ G G G
Sbjct 966 GERGFQGKPGLQGLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEP 1025
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G+ G VG+ GSVG G G G G+ + LQ
Sbjct 1026 GAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQ 1058
Score = 46.2 bits (108), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G+ G G G G G GS G G G G G G VG G +G
Sbjct 951 GKRGPHGLIGKTGNPGERGFQGKPGLQGLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGME 1010
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G G G G+ G VG+ GSV
Sbjct 1011 GPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSV 1037
Score = 46.2 bits (108), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G+ G G G G G GS G G G G G G VG G +G G G+
Sbjct 957 GLIGKTGNPGERGFQGKPGLQGLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPPGTE 1016
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G+ G VG+ GSVG G
Sbjct 1017 GESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGE 1042
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G G G GS G G G G G G VG G +G G G+ G
Sbjct 960 GKTGNPGERGFQGKPGLQGLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPPGTEGES 1019
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G+ G VG+ GSVG G G
Sbjct 1020 GLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPG 1044
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/84 (38%), Positives = 38/84 (45%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS G G +G G G G G G
Sbjct 588 GFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGERGIPGIRGKKGFK 647
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G G G G G GS G V
Sbjct 648 GRQGFPGDFGDRGPAGLDGSPGLV 671
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/84 (38%), Positives = 38/84 (45%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS G G +G G G G G G
Sbjct 588 GFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGERGIPGIRGKKGFK 647
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G GS G V
Sbjct 648 GRQGFPGDFGDRGPAGLDGSPGLV 671
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS G G +G G G G
Sbjct 582 GEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGERGIPGIR 641
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G GS
Sbjct 642 GKKGFKGRQGFPGDFGDRGPAGLDGS 667
Score = 44.3 bits (103), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G G G G G VG G +G G G+ G G G G+ G VG+ GSV
Sbjct 978 GLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSV 1037
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G+ G G G G
Sbjct 1038 GGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKDG 1062
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G G GS G G G G G G VG G +G G G+ G G
Sbjct 963 GNPGERGFQGKPGLQGLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQ 1022
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G VG+ GSVG G G G
Sbjct 1023 GEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGE 1048
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/85 (36%), Positives = 37/85 (43%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS G G +G G G
Sbjct 579 GLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGERGIP 638
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G G G
Sbjct 639 GIRGKKGFKGRQGFPGDFGDRGPAG 663
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VG G +G G G+ G G G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G
Sbjct 999 GDVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQ 1058
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G G +G
Sbjct 1059 GKDGLKGVPGGRGLPGEDGEKGEMG 1083
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/83 (39%), Positives = 38/83 (45%), Gaps = 0/83 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G GS G G G G G G VG G +G G G+ G G G G+ G VG+ GSV
Sbjct 978 GLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSV 1037
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G+ G G G
Sbjct 1038 GGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGK 1060
Score = 42.7 bits (99), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/87 (35%), Positives = 37/87 (42%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G G G G G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS G G +G
Sbjct 573 GHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPE 632
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G D
Sbjct 633 GERGIPGIRGKKGFKGRQGFPGDFGDR 659
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/87 (35%), Positives = 37/87 (42%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS G G +G G
Sbjct 576 GLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGER 635
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G G G
Sbjct 636 GIPGIRGKKGFKGRQGFPGDFGDRGPA 662
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G G G G G G G G G G G++GS G G G G
Sbjct 549 GEKGDQGLSGLMGPPGMQGDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPE 608
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G G+ G +GS G G +G G
Sbjct 609 GNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGE 634
Score = 42.0 bits (97), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/84 (38%), Positives = 38/84 (45%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G VG G +G G G+ G G G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G
Sbjct 999 GDVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQ 1058
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G G +
Sbjct 1059 GKDGLKGVPGGRGLPGEDGEKGEM 1082
Score = 42.0 bits (97), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/89 (35%), Positives = 38/89 (42%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS G
Sbjct 567 GDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEA 626
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G +G G G G G G G G D
Sbjct 627 GQLGPEGERGIPGIRGKKGFKGRQGFPGD 655
Score = 41.6 bits (96), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/85 (36%), Positives = 38/85 (44%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G G G G G G G G G G++GS G G G G G+
Sbjct 552 GDQGLSGLMGPPGMQGDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNP 611
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G+ G +GS G G +G G G
Sbjct 612 GPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGERG 636
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/87 (36%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G G+ G G G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G G G
Sbjct 1005 GEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKDGLK 1064
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G +G G +G +
Sbjct 1065 GVPGGRGLPGEDGEKGEMGLPGIIGPL 1091
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/85 (36%), Positives = 37/85 (43%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G G G++GS G G G G G+ G G+ G +
Sbjct 561 GPPGMQGDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFI 620
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G G +G G G G G G
Sbjct 621 GSPGEAGQLGPEGERGIPGIRGKKG 645
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G G G G G G G G G +
Sbjct 1023 GEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKDGLKGVPGGRGLPGEDGEKGEM 1082
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G +G +G G G G G VG
Sbjct 1083 GLPGIIGPLGRSGQTGLPGPEGIVG 1107
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/104 (33%), Positives = 41/104 (39%), Gaps = 18/104 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------VGSVGSVGSVGSVGSV 42
G VG+ GSVG G G G G+ G G G G +G G +
Sbjct 1029 GDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKDGLKGVPGGRGLPGEDGEKGEMGLPGII 1088
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G G G G VG G G G G G +G G VGS
Sbjct 1089 GPLGRSGQTGLPGPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGS 1132
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/87 (36%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G G G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G G G G G
Sbjct 1011 GPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKDGLKGVPGGR 1070
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G +G G +G +G G
Sbjct 1071 GLPGEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQT 1097
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/85 (37%), Positives = 38/85 (44%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G G+ G G G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G G
Sbjct 1002 GPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKD 1061
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G +G G
Sbjct 1062 GLKGVPGGRGLPGEDGEKGEMGLPG 1086
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/85 (37%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G G G G G G
Sbjct 1014 GTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKDGLKGVPGGRGLP 1073
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G +G G +G +G G G
Sbjct 1074 GEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTG 1098
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 37/86 (43%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G G G++GS G G G G G+ G G+ G +GS
Sbjct 564 GMQGDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSP 623
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G +G G G G G G G
Sbjct 624 GEAGQLGPEGERGIPGIRGKKGFKGR 649
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G VG G +G G G+ G G G G+ G VG+ GSVG G G G
Sbjct 990 GEPGLRGLQGDVGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEP 1049
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G G G G G G G G
Sbjct 1050 GAPGEEGLQGKDGLKGVPGGRGLPGE 1075
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 38/86 (44%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G VG+ GSVG G G G G+ G G G G G G G G
Sbjct 1017 GESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPGAPGEEGLQGKDGLKGVPGGRGLPGED 1076
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G +G G +G +G G G G
Sbjct 1077 GEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLPGP 1102
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/81 (35%), Positives = 36/81 (44%), Gaps = 0/81 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G G +G G G G G G G G G G G++GS G G G G
Sbjct 549 GEKGDQGLSGLMGPPGMQGDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPE 608
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G+ G +GS G G +
Sbjct 609 GNPGPKGAQGFIGSPGEAGQL 629
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.058, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/78 (34%), Positives = 35/78 (44%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 13 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
G G G G +G G G G G G G G G G G++GS G G G G
Sbjct 549 GEKGDQGLSGLMGPPGMQGDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPGRQGLAGPE 608
Query 73 GSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G+ G G+ G +GS ++
Sbjct 609 GNPGPKGAQGFIGSPGEA 626
> mmu:12840 Col9a2, AI427499, Col9a-2; collagen, type IX, alpha
2; K08131 collagen, type IX, alpha
Length=688
Score = 51.6 bits (122), Expect = 6e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/87 (41%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G G G+ G
Sbjct 243 GEMGPRGYKGMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTTGPP 302
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G+ G G GS G VG GS
Sbjct 303 GIDGKDGTPGIPGMKGSAGQVGRPGSP 329
Score = 50.8 bits (120), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/86 (41%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G G G+ G G
Sbjct 246 GPRGYKGMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTTGPPGID 305
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G+ G G GS G VG GS G
Sbjct 306 GKDGTPGIPGMKGSAGQVGRPGSPGH 331
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/85 (42%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G G G+ G G G
Sbjct 249 GYKGMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTTGPPGIDGKD 308
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G+ G G GS G VG GS G G
Sbjct 309 GTPGIPGMKGSAGQVGRPGSPGHQG 333
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G G G+
Sbjct 240 GPKGEMGPRGYKGMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTT 299
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G+ G G GS G VG
Sbjct 300 GPPGIDGKDGTPGIPGMKGSAGQVGRP 326
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/85 (42%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G G G+ G G G G+
Sbjct 252 GMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTTGPPGIDGKDGTP 311
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G GS G VG GS G G G
Sbjct 312 GIPGMKGSAGQVGRPGSPGHQGLAG 336
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 41/87 (47%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G G
Sbjct 237 GMAGPKGEMGPRGYKGMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPK 296
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G G G+ G G GS G V
Sbjct 297 GTTGPPGIDGKDGTPGIPGMKGSAGQV 323
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G G G+ G G G G+ G
Sbjct 255 GSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTTGPPGIDGKDGTPGIP 314
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS G VG GS G G G G
Sbjct 315 GMKGSAGQVGRPGSPGHQGLAGVPGQP 341
Score = 47.8 bits (112), Expect = 9e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G G G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G
Sbjct 234 GYPGMAGPKGEMGPRGYKGMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGIT 293
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G G G G+ G G GS
Sbjct 294 GPKGTTGPPGIDGKDGTPGIPGMKGSA 320
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/99 (34%), Positives = 40/99 (40%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G G G G VG+ G G G G G +G G G VGS+G+
Sbjct 201 GDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGEMGPRGYKGMVGSIGAA 260
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G VGS G+ G G G G+
Sbjct 261 GPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTT 299
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/98 (34%), Positives = 40/98 (40%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G G +G G G G G VG+ G G G G G +G G
Sbjct 192 GHPGKRGILGDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGEMGPRGYK 251
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VGS+G+ G G G G G G G VGS G+ G
Sbjct 252 GMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGP 289
Score = 43.5 bits (101), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/99 (34%), Positives = 40/99 (40%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G G G VG+ G G G G G +G G G VGS+G+ G
Sbjct 204 GRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGEMGPRGYKGMVGSIGAAGPP 263
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G VGS G+ G G G G+ G
Sbjct 264 GEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGPKGTTGPP 302
Score = 43.1 bits (100), Expect = 2e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/97 (35%), Positives = 40/97 (41%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G +G G G G G VG+ G G G G G +G G G V
Sbjct 195 GKRGILGDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGEMGPRGYKGMV 254
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS+G+ G G G G G G G VGS G+ G G
Sbjct 255 GSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQG 291
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/96 (34%), Positives = 39/96 (40%), Gaps = 12/96 (12%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 50
+G G G G G VG+ G G G G G +G G G VGS+G+
Sbjct 200 LGDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGEMGPRGYKGMVGSIGA 259
Query 51 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G VGS G+ G G G
Sbjct 260 AGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDVGSQGARGPQGITGP 295
Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.070, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/81 (37%), Positives = 35/81 (43%), Gaps = 0/81 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G G G +G G
Sbjct 192 GHPGKRGILGDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGEMGPRGYK 251
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VGS+G+ G G G G
Sbjct 252 GMVGSIGAAGPPGEEGPRGPP 272
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.12, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/86 (37%), Positives = 37/86 (43%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G G
Sbjct 183 GPQGLQGVKGHPGKRGILGDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPK 242
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G G VGS+G+ G G G
Sbjct 243 GEMGPRGYKGMVGSIGAAGPPGEEGP 268
Score = 32.7 bits (73), Expect = 0.31, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/103 (29%), Positives = 35/103 (33%), Gaps = 21/103 (20%)
Query 8 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS-------------------- 47
G G G G G G G +G G G G G VG+
Sbjct 178 PAGVKGPQGLQGVKGHPGKRGILGDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPG 237
Query 48 -VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G +G G G VGS+G+ G G G G G G D
Sbjct 238 MAGPKGEMGPRGYKGMVGSIGAAGPPGEEGPRGPPGRAGEKGD 280
Score = 29.3 bits (64), Expect = 2.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/83 (36%), Positives = 35/83 (42%), Gaps = 0/83 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
G G G G G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G
Sbjct 178 PAGVKGPQGLQGVKGHPGKRGILGDPGRQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPG 237
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G +G G G VGS+G+
Sbjct 238 MAGPKGEMGPRGYKGMVGSIGAA 260
> mmu:229389 Otol1, Gm414; otolin 1 homolog (zebrafish)
Length=482
Score = 51.2 bits (121), Expect = 8e-07, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/85 (42%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G G G G G GS G VGS G GS G G G G G G +GS G
Sbjct 250 GDLGERGEKGQKGEKGMEGEKGSRGDVGSEGKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFT 309
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G +GS G G G GS G
Sbjct 310 GPAGPKGELGSKGVRGPTGKKGSRG 334
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/92 (41%), Positives = 40/92 (43%), Gaps = 0/92 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G GS G VGS G GS G G G G G G +GS G G G G +
Sbjct 259 GQKGEKGMEGEKGSRGDVGSEGKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFTGPAGPKGEL 318
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLL 92
GS G G G GS G GS G V S
Sbjct 319 GSKGVRGPTGKKGSRGVKGSKGEATQVPQSAF 350
Score = 50.4 bits (119), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/88 (42%), Positives = 40/88 (45%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G GS G VGS G GS G G G G G G +GS G G G
Sbjct 256 GEKGQKGEKGMEGEKGSRGDVGSEGKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFTGPAGPK 315
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVS 88
G +GS G G G GS G GS G +
Sbjct 316 GELGSKGVRGPTGKKGSRGVKGSKGEAT 343
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/83 (42%), Positives = 38/83 (45%), Gaps = 0/83 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G +G G G G G G GS G VGS G GS G G G G G G +GS G
Sbjct 250 GDLGERGEKGQKGEKGMEGEKGSRGDVGSEGKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFT 309
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G +GS G G G GS
Sbjct 310 GPAGPKGELGSKGVRGPTGKKGS 332
Score = 49.7 bits (117), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/86 (43%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G GS G VGS G GS G G G G G G +GS G G
Sbjct 253 GERGEKGQKGEKGMEGEKGSRGDVGSEGKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFTGPA 312
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G +GS G G G GS G GS
Sbjct 313 GPKGELGSKGVRGPTGKKGSRGVKGS 338
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/99 (34%), Positives = 41/99 (41%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G+ G+ G +G G+ G +G G G G G G GS G VGS
Sbjct 220 GDPGASGAHGFIGEPGAKGEKGGVGEKGYRGDLGERGEKGQKGEKGMEGEKGSRGDVGSE 279
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS G G G G G G +GS G G G G +
Sbjct 280 GKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFTGPAGPKGEL 318
Score = 41.6 bits (96), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/99 (34%), Positives = 41/99 (41%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G+ G G G+ G+ G +G G+ G +G G G G G G GS
Sbjct 214 GTKGEKGDPGASGAHGFIGEPGAKGEKGGVGEKGYRGDLGERGEKGQKGEKGMEGEKGSR 273
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VGS G GS G G G G G G +GS G G
Sbjct 274 GDVGSEGKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFTGPA 312
Score = 41.6 bits (96), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/98 (34%), Positives = 40/98 (40%), Gaps = 12/98 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G G+ G+ G +G G+ G +G G G G G G GS G V
Sbjct 217 GEKGDPGASGAHGFIGEPGAKGEKGGVGEKGYRGDLGERGEKGQKGEKGMEGEKGSRGDV 276
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G GS G G G G G G +GS G G G
Sbjct 277 GSEGKRGSDGLPGLRGDSGPKGEKGEIGSPGFTGPAGP 314
> hsa:50509 COL5A3; collagen, type V, alpha 3; K06236 collagen,
type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1745
Score = 50.8 bits (120), Expect = 1e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/86 (41%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G VG +G G G G G G VG VGS+G G+ G G
Sbjct 1121 GRRGPPGLFGQKGDDGVRGFVGVIGPPGLQGLPGPPGEKGEVGDVGSMGPHGAPGPRGPQ 1180
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G GS G+ G G VG G+VG G
Sbjct 1181 GPTGSEGTPGLPGGVGQPGAVGEKGE 1206
Score = 49.3 bits (116), Expect = 3e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G+ G G G G G G G VG +G G G G G G VG VGS+G G+ G
Sbjct 1118 GAQGRRGPPGLFGQKGDDGVRGFVGVIGPPGLQGLPGPPGEKGEVGDVGSMGPHGAPGPR 1177
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G GS G+ G G VG G+V +
Sbjct 1178 GPQGPTGSEGTPGLPGGVGQPGAVGEK 1204
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/118 (31%), Positives = 44/118 (37%), Gaps = 33/118 (27%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------- 50
G G VG VGS+G G+ G G G GS G+ G G VG G+VG G
Sbjct 1157 GEKGEVGDVGSMGPHGAPGPRGPQGPTGSEGTPGLPGGVGQPGAVGEKGERGDAGDPGPP 1216
Query 51 --------VGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G +G G G G+ GSVG G G +G G G
Sbjct 1217 GAPGIPGPKGDIGEKGDSGPSGAAGPPGKKGPPGEDGAKGSVGPTGLPGDLGPPGDPG 1274
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/108 (33%), Positives = 44/108 (40%), Gaps = 18/108 (16%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------V 42
GS+G G+ G G G GS G+ G G VG G+VG G
Sbjct 1166 GSMGPHGAPGPRGPQGPTGSEGTPGLPGGVGQPGAVGEKGERGDAGDPGPPGAPGIPGPK 1225
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G +G G G G+ G G G G G+ GSVG G G +G D
Sbjct 1226 GDIGEKGDSGPSGAAGPPGKKGPPGEDGAKGSVGPTGLPGDLGPPGDP 1273
Score = 31.6 bits (70), Expect = 0.70, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/84 (38%), Positives = 40/84 (47%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G G +G +G +G G G G G G G G G G G +GS+G G
Sbjct 1394 GDTGPKGEKGHIGLIGLIGPPGEAGEKGDQGLPGVQGPPGPKGDPGPPGPIGSLGHPGPP 1453
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G +G GS GS GS+G D+
Sbjct 1454 GVAGPLGQKGSKGSPGSMGPRGDT 1477
Score = 31.2 bits (69), Expect = 0.94, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/84 (38%), Positives = 39/84 (46%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G +G +G G G G G G G G G G G +GS+G G
Sbjct 1394 GDTGPKGEKGHIGLIGLIGPPGEAGEKGDQGLPGVQGPPGPKGDPGPPGPIGSLGHPGPP 1453
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G +G GS GS GS+G G
Sbjct 1454 GVAGPLGQKGSKGSPGSMGPRGDT 1477
> xla:380419 col1a2, MGC52958; collagen, type 1, alpha 2; K06236
collagen, type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1346
Score = 50.1 bits (118), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/95 (37%), Positives = 48/95 (50%), Gaps = 0/95 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +GS G G G G G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+V
Sbjct 893 GPMGSPGPNGVPGEAGRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAV 952
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQNG 95
G G G+ G G VG G VG G + +Q G
Sbjct 953 GPAGKSGNRGEPGPVGPAGVVGPAGPRGPAGIQGG 987
Score = 48.1 bits (113), Expect = 7e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 44/87 (50%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +GS G G G G G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+
Sbjct 890 GPSGPMGSPGPNGVPGEAGRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAP 949
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+VG G G+ G G VG G VG
Sbjct 950 GAVGPAGKSGNRGEPGPVGPAGVVGPA 976
Score = 47.8 bits (112), Expect = 8e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/93 (37%), Positives = 44/93 (47%), Gaps = 0/93 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G G VG G VG G
Sbjct 920 GRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEPGPVGPAGVVGPAGPR 979
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G G G G G G G+ G G + LQ
Sbjct 980 GPAGIQGGRGDKGEAGEKGARGLDGRKGHNGLQ 1012
Score = 47.8 bits (112), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/88 (37%), Positives = 42/88 (47%), Gaps = 0/88 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G
Sbjct 904 PGEAGRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGE 963
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G VG G VG G G G G D
Sbjct 964 PGPVGPAGVVGPAGPRGPAGIQGGRGDK 991
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G G VG
Sbjct 911 GNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEPGPVGPA 970
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG G G G G G G G
Sbjct 971 GVVGPAGPRGPAGIQGGRGDKGEAGE 996
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/90 (36%), Positives = 44/90 (48%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G
Sbjct 905 GEAGRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEP 964
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G VG G VG G G G G G ++
Sbjct 965 GPVGPAGVVGPAGPRGPAGIQGGRGDKGEA 994
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/90 (36%), Positives = 43/90 (47%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G G V
Sbjct 908 GRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEPGPV 967
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G VG G G G G G G +
Sbjct 968 GPAGVVGPAGPRGPAGIQGGRGDKGEAGEK 997
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G G VG G V
Sbjct 914 GNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEPGPVGPAGVV 973
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G+
Sbjct 974 GPAGPRGPAGIQGGRGDKGEAGEKGA 999
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/96 (37%), Positives = 45/96 (46%), Gaps = 1/96 (1%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G G VG G VG
Sbjct 917 GPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEPGPVGPAGVVGPA 976
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQNGL 96
G G G G G G G G+ G + NGL
Sbjct 977 GPRGPAGIQGGRGDKGEAGEKGARG-LDGRKGHNGL 1011
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/87 (39%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS+G+ G+ G+VG G G+ G G VG G VG G G G G G G G G+
Sbjct 941 GSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEPGPVGPAGVVGPAGPRGPAGIQGGRGDKGEAGEKGAR 1000
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G GS G G
Sbjct 1001 GLDGRKGHNGLQGLPGPAGSPGETGPA 1027
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/90 (37%), Positives = 43/90 (47%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G GS+G+ G+ G+VG G G+ G G VG G VG G G G G G G
Sbjct 935 GNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKSGNRGEPGPVGPAGVVGPAGPRGPAGIQGGRGDKGEA 994
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G G G G G GS ++
Sbjct 995 GEKGARGLDGRKGHNGLQGLPGPAGSPGET 1024
Score = 41.2 bits (95), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/84 (36%), Positives = 37/84 (44%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
+ G G G G G G VGS G G G G G G G G G+VG+ G+ G G
Sbjct 93 AQGFQGHAGEPGEPGQPGPVGSKGPTGPPGKSGEDGHPGKSGRPGERGTVGTQGARGFPG 152
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
+ G G G G G G G+ G
Sbjct 153 TPGLPGFKGIRGHNGLDGQKGAPG 176
Score = 41.2 bits (95), Expect = 9e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/82 (37%), Positives = 36/82 (43%), Gaps = 0/82 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G VGS G G G G G G G G G+VG+ G+ G G+
Sbjct 95 GFQGHAGEPGEPGQPGPVGSKGPTGPPGKSGEDGHPGKSGRPGERGTVGTQGARGFPGTP 154
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 82
G G G G G G G+ G
Sbjct 155 GLPGFKGIRGHNGLDGQKGAPG 176
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G VGS G G G G G G G G G+VG+ G+ G G+ G G G G G
Sbjct 110 GPVGSKGPTGPPGKSGEDGHPGKSGRPGERGTVGTQGARGFPGTPGLPGFKGIRGHNGLD 169
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G+ G G G G+ G GS G
Sbjct 170 GQKGAPGVAGVKGETGANGENGSPGQA 196
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/90 (35%), Positives = 40/90 (44%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G VGS G G G G G G G G G+VG+ G+ G G+ G G
Sbjct 101 GEPGEPGQPGPVGSKGPTGPPGKSGEDGHPGKSGRPGERGTVGTQGARGFPGTPGLPGFK 160
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G+ G G G G+ ++
Sbjct 161 GIRGHNGLDGQKGAPGVAGVKGETGANGEN 190
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VGS G G G G G G G G G+VG+ G+ G G+ G G G G
Sbjct 107 GQPGPVGSKGPTGPPGKSGEDGHPGKSGRPGERGTVGTQGARGFPGTPGLPGFKGIRGHN 166
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G+ G G G G+ G GS
Sbjct 167 GLDGQKGAPGVAGVKGETGANGENGSP 193
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/83 (36%), Positives = 36/83 (43%), Gaps = 0/83 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
+ G G G G G G VGS G G G G G G G G G+VG+ G+ G G
Sbjct 93 AQGFQGHAGEPGEPGQPGPVGSKGPTGPPGKSGEDGHPGKSGRPGERGTVGTQGARGFPG 152
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
+ G G G G G G G+
Sbjct 153 TPGLPGFKGIRGHNGLDGQKGAP 175
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/75 (36%), Positives = 38/75 (50%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
G G +GS G G G G G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+
Sbjct 890 GPSGPMGSPGPNGVPGEAGRDGNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAP 949
Query 76 GSVGSVGSVGSVSDS 90
G+VG G G+ +
Sbjct 950 GAVGPAGKSGNRGEP 964
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/81 (38%), Positives = 44/81 (54%), Gaps = 0/81 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
G G +GS G+ G G+ G+ G +GS G+ G G+ G G G GS+G VG G+ G
Sbjct 225 PTGPAGPIGSAGAPGLPGAPGAKGEIGSAGNSGPTGAAGPRGEPGPPGSLGPVGPAGNPG 284
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 82
+ G G+ G+ G G G+ G
Sbjct 285 ANGVNGAKGAAGLPGVAGAPG 305
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/81 (38%), Positives = 44/81 (54%), Gaps = 0/81 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
G G +GS G+ G G+ G+ G +GS G+ G G+ G G G GS+G VG G+ G
Sbjct 225 PTGPAGPIGSAGAPGLPGAPGAKGEIGSAGNSGPTGAAGPRGEPGPPGSLGPVGPAGNPG 284
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
+ G G+ G+ G G G+ G
Sbjct 285 ANGVNGAKGAAGLPGVAGAPG 305
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/79 (39%), Positives = 44/79 (55%), Gaps = 0/79 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +GS G+ G G+ G+ G +GS G+ G G+ G G G GS+G VG G+ G+
Sbjct 227 GPAGPIGSAGAPGLPGAPGAKGEIGSAGNSGPTGAAGPRGEPGPPGSLGPVGPAGNPGAN 286
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVG 79
G G+ G+ G G G+ G
Sbjct 287 GVNGAKGAAGLPGVAGAPG 305
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/100 (34%), Positives = 44/100 (44%), Gaps = 12/100 (12%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGS------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 50
GS G G+ G GS G G G +GS G G G G G+ G+ G
Sbjct 859 PGSRGERGTPGGSGSNGEPGPSGPPGAAGARGPSGPMGSPGPNGVPGEAGRDGNPGNDGP 918
Query 51 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+VG S
Sbjct 919 SGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAVGPAGKS 958
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.035, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/71 (38%), Positives = 39/71 (54%), Gaps = 0/71 (0%)
Query 17 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 76
G G +GS G+ G G+ G+ G +GS G+ G G+ G G G GS+G VG G+ G
Sbjct 225 PTGPAGPIGSAGAPGLPGAPGAKGEIGSAGNSGPTGAAGPRGEPGPPGSLGPVGPAGNPG 284
Query 77 SVGSVGSVGSV 87
+ G G+ G+
Sbjct 285 ANGVNGAKGAA 295
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.052, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/102 (34%), Positives = 46/102 (45%), Gaps = 15/102 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
GS+G G GS G G+ G GS G G +GS G G G G
Sbjct 851 GSLGFSGLPGSRGERGTPGGSGSNGEPGPSGPPGAAGARGPSGPMGSPGPNGVPGEAGRD 910
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G+ G G G G+ G G G+ G GS+G+ G+ G+V
Sbjct 911 GNPGNDGPSGRDGLPGNKGERGYPGNSGPAGSLGASGAPGAV 952
Score = 31.2 bits (69), Expect = 0.95, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/117 (29%), Positives = 47/117 (40%), Gaps = 27/117 (23%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS- 59
G+VG+ G+ G G+ G G G G G G G+ G G G G+ G GS G G+
Sbjct 140 GTVGTQGARGFPGTPGLPGFKGIRGHNGLDGQKGAPGVAGVKGETGANGENGSPGQAGAR 199
Query 60 --------------------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G +GS G+ G G+ G+ G +GS +S
Sbjct 200 GLPGERGRGGPPGPAGSRGSDGSGGPTGPAGPIGSAGAPGLPGAPGAKGEIGSAGNS 256
Score = 30.4 bits (67), Expect = 1.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/111 (28%), Positives = 43/111 (38%), Gaps = 24/111 (21%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----------- 49
G+ G G G G G G G+ G G G G+ G GS G G+ G
Sbjct 152 GTPGLPGFKGIRGHNGLDGQKGAPGVAGVKGETGANGENGSPGQAGARGLPGERGRGGPP 211
Query 50 -------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G +GS G+ G G+ G+ G +GS G+ G G+
Sbjct 212 GPAGSRGSDGSGGPTGPAGPIGSAGAPGLPGAPGAKGEIGSAGNSGPTGAA 262
Score = 29.3 bits (64), Expect = 3.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/111 (28%), Positives = 42/111 (37%), Gaps = 24/111 (21%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-------- 52
G G+ G G G G G G G+ G G G G+ G GS G G+ G
Sbjct 149 GFPGTPGLPGFKGIRGHNGLDGQKGAPGVAGVKGETGANGENGSPGQAGARGLPGERGRG 208
Query 53 ----------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G +GS G+ G G+ G+ G +GS G+ G
Sbjct 209 GPPGPAGSRGSDGSGGPTGPAGPIGSAGAPGLPGAPGAKGEIGSAGNSGPT 259
> hsa:1284 COL4A2, DKFZp686I14213, FLJ22259; collagen, type IV,
alpha 2; K06237 collagen, type IV, alpha
Length=1712
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/95 (35%), Positives = 45/95 (47%), Gaps = 0/95 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G+ G+ G+ G+ G G G G G G G G G G +G+ G G+VG
Sbjct 1308 GSKGDTGNPGAPGTPGTKGWAGDSGPQGRPGVFGLPGEKGPRGEQGFMGNTGPTGAVGDR 1367
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQNG 95
G G G G G+ G+VG+ G G +Q G
Sbjct 1368 GPKGPKGDPGFPGAPGTVGAPGIAGIPQKIAVQPG 1402
Score = 48.5 bits (114), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/82 (36%), Positives = 40/82 (48%), Gaps = 0/82 (0%)
Query 6 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 65
GS G G+ G+ G+ G+ G G G G G G G G G G +G+ G G+VG
Sbjct 1307 PGSKGDTGNPGAPGTPGTKGWAGDSGPQGRPGVFGLPGEKGPRGEQGFMGNTGPTGAVGD 1366
Query 66 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G+ G+VG+
Sbjct 1367 RGPKGPKGDPGFPGAPGTVGAP 1388
> hsa:84570 COL25A1, CLAC, CLACP; collagen, type XXV, alpha 1
Length=642
Score = 49.7 bits (117), Expect = 2e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/84 (36%), Positives = 36/84 (42%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G G G +G +G G GS+G+ G G G G G G+VG G G G G
Sbjct 224 PGEPGKPGEQGLMGPLGPPGQKGSIGAPGIPGMNGQKGEPGLPGAVGQNGIPGPKGEPGE 283
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G GS
Sbjct 284 QGEKGDAGENGPKGDTGEKGDPGS 307
Score = 48.9 bits (115), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/90 (35%), Positives = 37/90 (41%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G +G +G G GS+G+ G G G G G G+VG G
Sbjct 216 GPRGMPGVPGEPGKPGEQGLMGPLGPPGQKGSIGAPGIPGMNGQKGEPGLPGAVGQNGIP 275
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G D
Sbjct 276 GPKGEPGEQGEKGDAGENGPKGDTGEKGDP 305
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/89 (34%), Positives = 37/89 (41%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
G G G G G G G G +G +G G GS+G+ G G G G G G+VG
Sbjct 211 DTGKDGPRGMPGVPGEPGKPGEQGLMGPLGPPGQKGSIGAPGIPGMNGQKGEPGLPGAVG 270
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G D+
Sbjct 271 QNGIPGPKGEPGEQGEKGDAGENGPKGDT 299
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/90 (34%), Positives = 37/90 (41%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G G +G +G G GS+G+ G G G G G G+VG
Sbjct 213 GKDGPRGMPGVPGEPGKPGEQGLMGPLGPPGQKGSIGAPGIPGMNGQKGEPGLPGAVGQN 272
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G G G G +
Sbjct 273 GIPGPKGEPGEQGEKGDAGENGPKGDTGEK 302
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 24/68 (35%), Positives = 30/68 (44%), Gaps = 4/68 (5%)
Query 29 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVS 88
G G G G G G G G +G +G G GS+G+ G G G G G G+V
Sbjct 211 DTGKDGPRGMPGVPGEPGKPGEQGLMGPLGPPGQKGSIGAPGIPGMNGQKGEPGLPGAVG 270
Query 89 DSLLQNGL 96
QNG+
Sbjct 271 ----QNGI 274
> tpv:TP01_0933 hypothetical protein
Length=1342
Score = 48.9 bits (115), Expect = 4e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 25/86 (29%), Positives = 42/86 (48%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 9 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 68
G V + +VG + +V V +V V +VG++ +VG + VG + +V + ++G G
Sbjct 793 FGEVVFWSPIYTVGKINTVPKVNTVSKVNTVGNMNTVGKIDKVGKIDAVDRLDTIGKKGL 852
Query 69 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQN 94
G VG S+ + V SL N
Sbjct 853 TGEVGKKISLREFINEREVDKSLYFN 878
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/66 (30%), Positives = 35/66 (53%), Gaps = 0/66 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G V + +VG + +V V +V V +VG++ +VG + VG + +V + ++G G
Sbjct 793 FGEVVFWSPIYTVGKINTVPKVNTVSKVNTVGNMNTVGKIDKVGKIDAVDRLDTIGKKGL 852
Query 63 VGSVGS 68
G VG
Sbjct 853 TGEVGK 858
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/66 (30%), Positives = 35/66 (53%), Gaps = 0/66 (0%)
Query 6 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 65
G V + +VG + +V V +V V +VG++ +VG + VG + +V + ++G G
Sbjct 793 FGEVVFWSPIYTVGKINTVPKVNTVSKVNTVGNMNTVGKIDKVGKIDAVDRLDTIGKKGL 852
Query 66 VGSVGS 71
G VG
Sbjct 853 TGEVGK 858
Score = 45.8 bits (107), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/65 (30%), Positives = 35/65 (53%), Gaps = 0/65 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G V + +VG + +V V +V V +VG++ +VG + VG + +V + ++G G
Sbjct 794 GEVVFWSPIYTVGKINTVPKVNTVSKVNTVGNMNTVGKIDKVGKIDAVDRLDTIGKKGLT 853
Query 61 GSVGS 65
G VG
Sbjct 854 GEVGK 858
> mmu:12827 Col4a2, Col4a-2, MGC7371; collagen, type IV, alpha
2; K06237 collagen, type IV, alpha
Length=1707
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/94 (38%), Positives = 44/94 (46%), Gaps = 0/94 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G GS G+ G G G VG G G G +G G G G G +G+ G G+VG G
Sbjct 1306 GDEGSSGAAGFPGQKGWVGDPGPQGQPGVLGLPGEKGPKGEQGFMGNTGPSGAVGDRGPK 1365
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQNGLL 97
G G G G+ GS+GS G G +Q G L
Sbjct 1366 GPKGDQGFPGAPGSMGSPGIPGIPQKIAVQPGTL 1399
> mmu:12839 Col9a1, Col9a-1; collagen, type IX, alpha 1; K08131
collagen, type IX, alpha
Length=921
Score = 48.5 bits (114), Expect = 5e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/84 (42%), Positives = 41/84 (48%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G VG G G G G+ G G G+ G+ G G +GS G G G G VG G
Sbjct 562 GPPGDVGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGNTGAPGKPGQLGSSGKPGQQGPPGEVGPRGPR 621
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G GS G VG GS G G +GSV
Sbjct 622 GLPGSRGPVGPEGSPGIPGKLGSV 645
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/111 (34%), Positives = 46/111 (41%), Gaps = 18/111 (16%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------ 42
G G G G VG G G GS G VG GS G G +GSV
Sbjct 604 GKPGQQGPPGEVGPRGPRGLPGSRGPVGPEGSPGIPGKLGSVGSPGLPGLPGPPGLPGMK 663
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQ 93
G G G G G G+ G G G+ G +G +G G GSVG+ + L+
Sbjct 664 GDRGVFGEPGPKGEQGASGEEGEAGARGDLGDMGQPGPKGSVGNPGEPGLR 714
Score = 46.2 bits (108), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/107 (34%), Positives = 44/107 (41%), Gaps = 18/107 (16%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--- 57
G+ G+ G G +GS G G G G VG G G GS G VG GS G G +GSV
Sbjct 589 GNTGAPGKPGQLGSSGKPGQQGPPGEVGPRGPRGLPGSRGPVGPEGSPGIPGKLGSVGSP 648
Query 58 ---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G G G G G+ G G G+ G + D
Sbjct 649 GLPGLPGPPGLPGMKGDRGVFGEPGPKGEQGASGEEGEAGARGDLGD 695
Score = 46.2 bits (108), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/111 (34%), Positives = 44/111 (39%), Gaps = 24/111 (21%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--------- 51
G G +GS G G G G VG G G GS G VG GS G G +GSV
Sbjct 595 GKPGQLGSSGKPGQQGPPGEVGPRGPRGLPGSRGPVGPEGSPGIPGKLGSVGSPGLPGLP 654
Query 52 ---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G+ G G G+ G +G +G G GSV
Sbjct 655 GPPGLPGMKGDRGVFGEPGPKGEQGASGEEGEAGARGDLGDMGQPGPKGSV 705
Score = 45.4 bits (106), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/107 (34%), Positives = 43/107 (40%), Gaps = 18/107 (16%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G+ G+ G G +GS G G G G VG G G GS G VG GS G G +GSV
Sbjct 586 GEKGNTGAPGKPGQLGSSGKPGQQGPPGEVGPRGPRGLPGSRGPVGPEGSPGIPGKLGSV 645
Query 61 ------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G G G G G+ G G G+ D
Sbjct 646 GSPGLPGLPGPPGLPGMKGDRGVFGEPGPKGEQGASGEEGEAGARGD 692
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/104 (35%), Positives = 43/104 (41%), Gaps = 18/104 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------GSVGSVGSV 42
G VG G G GS G VG GS G G +GSV G G G
Sbjct 613 GEVGPRGPRGLPGSRGPVGPEGSPGIPGKLGSVGSPGLPGLPGPPGLPGMKGDRGVFGEP 672
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G+ G G G+ G +G +G G GSVG+ G G G
Sbjct 673 GPKGEQGASGEEGEAGARGDLGDMGQPGPKGSVGNPGEPGLRGP 716
Score = 42.7 bits (99), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/103 (34%), Positives = 42/103 (40%), Gaps = 18/103 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------GSVGSVGSVGSV 42
G G G GS G VG GS G G +GSV G G G G
Sbjct 616 GPRGPRGLPGSRGPVGPEGSPGIPGKLGSVGSPGLPGLPGPPGLPGMKGDRGVFGEPGPK 675
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G+ G G G+ G +G +G G GSVG+ G G G G
Sbjct 676 GEQGASGEEGEAGARGDLGDMGQPGPKGSVGNPGEPGLRGPEG 718
> mmu:53867 Col5a3; collagen, type V, alpha 3; K06236 collagen,
type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1739
Score = 48.1 bits (113), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/78 (41%), Positives = 38/78 (48%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G +G +G G G G G G G G G G G VGS+G G
Sbjct 1393 GDAGPKGEKGHIGLIGLIGPPGEAGEKGDQGLPGVQGPPGLQGDPGLPGPVGSLGHPGPP 1452
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSV 78
G VG +G GS GS GS+
Sbjct 1453 GVVGPLGQKGSKGSPGSL 1470
Score = 48.1 bits (113), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/78 (41%), Positives = 38/78 (48%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G G +G +G +G G G G G G G G G G G VGS+G G
Sbjct 1393 GDAGPKGEKGHIGLIGLIGPPGEAGEKGDQGLPGVQGPPGLQGDPGLPGPVGSLGHPGPP 1452
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G VG +G GS GS GS+
Sbjct 1453 GVVGPLGQKGSKGSPGSL 1470
Score = 48.1 bits (113), Expect = 6e-06, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/78 (41%), Positives = 38/78 (48%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
G G G G +G +G +G G G G G G G G G G G VGS+G G
Sbjct 1393 GDAGPKGEKGHIGLIGLIGPPGEAGEKGDQGLPGVQGPPGLQGDPGLPGPVGSLGHPGPP 1452
Query 70 GSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VG +G GS GS GS+
Sbjct 1453 GVVGPLGQKGSKGSPGSL 1470
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/101 (34%), Positives = 44/101 (43%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G G+ G +G +GSVG + G G +G G G G VG+ GS G
Sbjct 952 GREGAKGELGPLGSVGKEGPPGPRGFPGPQGAPGDPGPIGLKGDKGPPGPVGANGSPGER 1011
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G VG G +G G G G +G G GS G G+ G G
Sbjct 1012 GPVGPSGGIGLPGQSGGQGPIGPAGEKGSPGERGTPGPTGK 1052
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/100 (35%), Positives = 44/100 (44%), Gaps = 15/100 (15%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G+ G +G +GSVG + G G +G G G G VG+ GS G G V
Sbjct 955 GAKGELGPLGSVGKEGPPGPRGFPGPQGAPGDPGPIGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPV 1014
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G +G G G G +G G GS G G+ G G G
Sbjct 1015 GPSGGIGLPGQSGGQGPIGPAGEKGSPGERGTPGPTGKDG 1054
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/99 (34%), Positives = 43/99 (43%), Gaps = 15/99 (15%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G+ G +G +GSVG + G G +G G G G VG+ GS G
Sbjct 952 GREGAKGELGPLGSVGKEGPPGPRGFPGPQGAPGDPGPIGLKGDKGPPGPVGANGSPGER 1011
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VG G +G G G G +G G GS G G+ G
Sbjct 1012 GPVGPSGGIGLPGQSGGQGPIGPAGEKGSPGERGTPGPT 1050
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/100 (35%), Positives = 42/100 (42%), Gaps = 15/100 (15%)
Query 1 GSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G +GSVG + G G +G G G G VG+ GS G G VG G +
Sbjct 961 GPLGSVGKEGPPGPRGFPGPQGAPGDPGPIGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPVGPSGGI 1020
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G +G G GS G G+ G G G G G
Sbjct 1021 GLPGQSGGQGPIGPAGEKGSPGERGTPGPTGKDGIPGPPG 1060
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.032, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/87 (32%), Positives = 37/87 (42%), Gaps = 15/87 (17%)
Query 19 GSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G+ G +G +GSVG + G G +G G G G VG+ GS G
Sbjct 952 GREGAKGELGPLGSVGKEGPPGPRGFPGPQGAPGDPGPIGLKGDKGPPGPVGANGSPGER 1011
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G VG G +G G G G +G +
Sbjct 1012 GPVGPSGGIGLPGQSGGQGPIGPAGEK 1038
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.087, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/126 (28%), Positives = 45/126 (35%), Gaps = 39/126 (30%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------------GSV 36
G G G +G G G G G +G G VG V G
Sbjct 895 GHPGQRGELGFQGLTGPPGPAGVLGPQGKVGDVGPLGERGPPGPPGPPGEQGLPGIEGRE 954
Query 37 GSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
G+ G +G +GSVG + G G +G G G G VG+ GS G G V
Sbjct 955 GAKGELGPLGSVGKEGPPGPRGFPGPQGAPGDPGPIGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPV 1014
Query 82 GSVGSV 87
G G +
Sbjct 1015 GPSGGI 1020
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/124 (29%), Positives = 45/124 (36%), Gaps = 39/124 (31%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------------------GSVGSV 36
G G +G G G G G +G G VG V G G+
Sbjct 898 GQRGELGFQGLTGPPGPAGVLGPQGKVGDVGPLGERGPPGPPGPPGEQGLPGIEGREGAK 957
Query 37 GSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
G +G +GSVG + G G +G G G G VG+ GS G G VG
Sbjct 958 GELGPLGSVGKEGPPGPRGFPGPQGAPGDPGPIGLKGDKGPPGPVGANGSPGERGPVGPS 1017
Query 82 GSVG 85
G +G
Sbjct 1018 GGIG 1021
Score = 30.8 bits (68), Expect = 1.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (48%), Gaps = 0/54 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 54
G+ G+ G G G G G G G VG +G G G G G G VG VGS+
Sbjct 1114 GADGAQGRRGPPGLFGQKGDDGVRGFVGVIGPPGLQGLPGPPGEKGEVGDVGSM 1167
> mmu:68553 Col6a4, 1110001D15Rik, AI413310, AU023415, Dvwa, EG235580;
collagen, type VI, alpha 4; K06238 collagen, type VI,
alpha
Length=2309
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/86 (39%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G GS G G +G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G
Sbjct 1541 GPKGEKGRRGHQGSPGFHGPLGEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHP 1600
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G+ G+
Sbjct 1601 GPQGPRGRQGPPGFFGQKGDPGTQGN 1626
Score = 47.4 bits (111), Expect = 1e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G GS G G +G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G G
Sbjct 1544 GEKGRRGHQGSPGFHGPLGEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQ 1603
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G G G+ G+ G
Sbjct 1604 GPRGRQGPPGFFGQKGDPGTQGNPG 1628
Score = 46.2 bits (108), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/86 (40%), Positives = 41/86 (47%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G +G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G G G G
Sbjct 1550 GHQGSPGFHGPLGEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQGPRGRQ 1609
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G+ G+ G G GS
Sbjct 1610 GPPGFFGQKGDPGTQGNPGLPGPSGS 1635
Score = 45.8 bits (107), Expect = 3e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/85 (41%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G +G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G G G G G
Sbjct 1553 GSPGFHGPLGEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQGPRGRQGPP 1612
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G+ G+ G G GS G
Sbjct 1613 GFFGQKGDPGTQGNPGLPGPSGSKG 1637
Score = 45.1 bits (105), Expect = 6e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G G G G G G G
Sbjct 1559 GPLGEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQGPRGRQGPPGFFGQK 1618
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G+ G+ G G GS G G G
Sbjct 1619 GDPGTQGNPGLPGPSGSKGPDGPRG 1643
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G G G G G G
Sbjct 1556 GFHGPLGEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQGPRGRQGPPGFF 1615
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G+ G+ G G GS G G
Sbjct 1616 GQKGDPGTQGNPGLPGPSGSKGPDG 1640
Score = 44.3 bits (103), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/87 (40%), Positives = 40/87 (45%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G G G G G G G G
Sbjct 1562 GEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQGPRGRQGPPGFFGQKGDP 1621
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G+ G G GS G G G G V
Sbjct 1622 GTQGNPGLPGPSGSKGPDGPRGLKGEV 1648
Score = 44.3 bits (103), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/85 (41%), Positives = 40/85 (47%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GSVG GS+G G G G +G G +GS G G G G G G G G G G+
Sbjct 1565 GSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQGPRGRQGPPGFFGQKGDPGTQ 1624
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G+ G G GS G G G G VG
Sbjct 1625 GNPGLPGPSGSKGPDGPRGLKGEVG 1649
Score = 43.5 bits (101), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/80 (40%), Positives = 36/80 (45%), Gaps = 0/80 (0%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
G G G G GS G G +G GSVG GS+G G G G +G G +GS G G
Sbjct 1541 GPKGEKGRRGHQGSPGFHGPLGEAGSVGPRGSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHP 1600
Query 70 GSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G G G G G D
Sbjct 1601 GPQGPRGRQGPPGFFGQKGD 1620
Score = 41.6 bits (96), Expect = 6e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/85 (38%), Positives = 38/85 (44%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS+G G G G +G G +GS G G G G G G G G G G+ G+ G
Sbjct 1571 GSLGRHGLPGLKGVLGETGELGSRGEPGHPGPQGPRGRQGPPGFFGQKGDPGTQGNPGLP 1630
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G GS G G G G VG G G
Sbjct 1631 GPSGSKGPDGPRGLKGEVGPAGERG 1655
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.062, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/86 (38%), Positives = 36/86 (41%), Gaps = 7/86 (8%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS-------VGSVGSVGSVGS 53
G G+ G G GS GS G G G G G G G G G G G G
Sbjct 1492 GDRGAAGPSGEKGSSGSRGLTGLPGPAGPRGEPGLRGDPGDPGIDNLIQGPKGEKGRRGH 1551
Query 54 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 79
GS G G +G GSVG GS+G G
Sbjct 1552 QGSPGFHGPLGEAGSVGPRGSLGRHG 1577
> dre:555428 col28a1, col28a1c, si:ch211-174d12.1, si:ch211-174d12.4;
collagen, type XXVIII, alpha 1
Length=1170
Score = 47.0 bits (110), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/87 (41%), Positives = 42/87 (48%), Gaps = 2/87 (2%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS--VGSVGSVGSVG 58
G G G G VG+ G G G GSVG G +G G G GS G G G G G
Sbjct 502 GEPGPKGEPGPVGAPGIPGIPGEDGSVGPKGEMGLSGERGQEGSPGKGIPGEKGDRGDRG 561
Query 59 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
S G GS G+ G G+ G GS+G +G
Sbjct 562 SRGPPGSSGAAGPPGAKGEPGSLGMMG 588
Score = 46.6 bits (109), Expect = 2e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/85 (41%), Positives = 41/85 (48%), Gaps = 2/85 (2%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS--VGSVGSVGSV 60
+G G G G VG+ G G G GSVG G +G G G GS G G G G
Sbjct 501 IGEPGPKGEPGPVGAPGIPGIPGEDGSVGPKGEMGLSGERGQEGSPGKGIPGEKGDRGDR 560
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G GS G+ G G+ G GS+G
Sbjct 561 GSRGPPGSSGAAGPPGAKGEPGSLG 585
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.10, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/66 (40%), Positives = 30/66 (45%), Gaps = 1/66 (1%)
Query 21 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 80
VG G G G G G G +G G G G VG+ G G G GSVG G +G G
Sbjct 481 VGPKGDQGFPGESGPQGERG-IGEPGPKGEPGPVGAPGIPGIPGEDGSVGPKGEMGLSGE 539
Query 81 VGSVGS 86
G GS
Sbjct 540 RGQEGS 545
Score = 29.6 bits (65), Expect = 2.6, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/55 (40%), Positives = 25/55 (45%), Gaps = 1/55 (1%)
Query 33 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
VG G G G G G G +G G G G VG+ G G G GSVG G +
Sbjct 481 VGPKGDQGFPGESGPQGERG-IGEPGPKGEPGPVGAPGIPGIPGEDGSVGPKGEM 534
> hsa:1282 COL4A1, arresten; collagen, type IV, alpha 1; K06237
collagen, type IV, alpha
Length=1669
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/92 (42%), Positives = 42/92 (45%), Gaps = 1/92 (1%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G G+ G G G G +G G G G G G GS G G GS+G
Sbjct 1032 GPQGSPGLPGDKGAKGEKGQAGPPG-IGIPGLRGEKGDQGIAGFPGSPGEKGEKGSIGIP 1090
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLL 92
G GS G GS GSVG GS G G D L
Sbjct 1091 GMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGEKGDKGL 1122
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 38/90 (42%), Positives = 41/90 (45%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G GS+G G GS G GS GSVG GS G G G G G G G G
Sbjct 1076 GSPGEKGEKGSIGIPGMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGEKGDKGLPGLDGIPGVKGEA 1135
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G G G G GS G GS +
Sbjct 1136 GLPGTPGPTGPAGQKGEPGSDGIPGSAGEK 1165
Score = 44.3 bits (103), Expect = 9e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/85 (43%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G GS+G G GS G GS GSVG GS G G G G G G G
Sbjct 1073 GFPGSPGEKGEKGSIGIPGMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGEKGDKGLPGLDGIPGVK 1132
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G+ G G G G GS G
Sbjct 1133 GEAGLPGTPGPTGPAGQKGEPGSDG 1157
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/87 (42%), Positives = 39/87 (44%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS+G G GS G GS GSVG GS G G G G G G G G G G+
Sbjct 1082 GEKGSIGIPGMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGEKGDKGLPGLDGIPGVKGEAGLPGTP 1141
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G GS G GS G G
Sbjct 1142 GPTGPAGQKGEPGSDGIPGSAGEKGEP 1168
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/85 (43%), Positives = 39/85 (45%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS+G G GS G GS GSVG GS G G G G G G G G G G+ G
Sbjct 1085 GSIGIPGMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGEKGDKGLPGLDGIPGVKGEAGLPGTPGPT 1144
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G GS G GS G G G
Sbjct 1145 GPAGQKGEPGSDGIPGSAGEKGEPG 1169
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/84 (42%), Positives = 38/84 (45%), Gaps = 0/84 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G GS G G GS+G G GS G GS GSVG GS G G G G G G G
Sbjct 1072 AGFPGSPGEKGEKGSIGIPGMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGEKGDKGLPGLDGIPGV 1131
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G+ G G G G GS
Sbjct 1132 KGEAGLPGTPGPTGPAGQKGEPGS 1155
Score = 42.7 bits (99), Expect = 3e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/90 (40%), Positives = 39/90 (43%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G GS G G GS+G G GS G GS GSVG GS G G G G
Sbjct 1064 GEKGDQGIAGFPGSPGEKGEKGSIGIPGMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGEKGDKGLP 1123
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G G G+ G G G +
Sbjct 1124 GLDGIPGVKGEAGLPGTPGPTGPAGQKGEP 1153
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/85 (41%), Positives = 38/85 (44%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
+G G G G G G GS G G GS+G G GS G GS GSVG GS G G
Sbjct 1057 IGIPGLRGEKGDQGIAGFPGSPGEKGEKGSIGIPGMPGSPGLKGSPGSVGYPGSPGLPGE 1116
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G G+
Sbjct 1117 KGDKGLPGLDGIPGVKGEAGLPGTP 1141
> pfa:PFE0970w cytochrome c oxidase assembly protein (heme A:
farnesyltransferase), putative (EC:2.5.1.-); K02257 protoheme
IX farnesyltransferase [EC:2.5.1.-]
Length=648
Score = 45.4 bits (106), Expect = 4e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/63 (44%), Positives = 43/63 (68%), Gaps = 0/63 (0%)
Query 28 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 88 SDS 90
+
Sbjct 126 KNE 128
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 61 GS 62
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 64 GS 65
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 67 GS 68
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 70 GS 71
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 13 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 73 GS 74
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 76 GS 77
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 19 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 78
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 79 GS 80
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 22 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 82 GS 83
+
Sbjct 126 KN 127
Score = 45.1 bits (105), Expect = 5e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/62 (45%), Positives = 43/62 (69%), Gaps = 0/62 (0%)
Query 25 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
+VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +VG V +V +V +VG+V +VG+V +V +V
Sbjct 66 KNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVGIVKNVENVKNVGNVKNVGNVENVRNV 125
Query 85 GS 86
+
Sbjct 126 KN 127
> dre:564099 novel collagen protein-like
Length=1733
Score = 44.7 bits (104), Expect = 7e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/82 (37%), Positives = 36/82 (43%), Gaps = 0/82 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G+ G +G +G G G VG G G GS+G G G G
Sbjct 1360 GPDGREGMKGEKGDQGKNGAPGKLGHIGRRGEKGDVGEKGLPGWGGSMGIQGPRGEPGDE 1419
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 82
G G+ G G G GS G G
Sbjct 1420 GVKGAEGEKGDQGPFGSPGRDG 1441
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 19 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 22 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 25 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 28 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 31 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 78
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 34 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 37 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 18/48 (37%), Positives = 20/48 (41%), Gaps = 0/48 (0%)
Query 40 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G VG G G+VG G G G G G G G +G
Sbjct 964 GKTGMKGPQGPVGMYGFPGTVGMRGRPGHTGDRGEPGPRGPTGPIGKT 1011
Score = 31.6 bits (70), Expect = 0.56, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 21/59 (35%), Positives = 26/59 (44%), Gaps = 0/59 (0%)
Query 31 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G G +GS G G +G G G G G G+ G G G G +G+ G G D
Sbjct 1078 GEKGEKGMMGSPGDDGPLGLEGQQGLTGPAGLDGAPGRKGDKGDRGPIGTSGLQGPKGD 1136
> pfa:PF10_0026 Tryptophan-rich antigen 3, putative
Length=979
Score = 44.7 bits (104), Expect = 8e-05, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/112 (25%), Positives = 49/112 (43%), Gaps = 16/112 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-------- 52
GS+ + GS S S+ GS+ + GS S S+ GS+ + GS S S+
Sbjct 590 GSMAAEGSYSSYDSIYPEGSMDTEGSYSSYESIYPDGSMAAEGSYTSYDSINPEESVTPE 649
Query 53 -------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQNGLL 97
++ ++ S + S GS S ++ + + D ++QNGL+
Sbjct 650 GNNSTSETIKEEDNMTSQNNYSSNGSYNSEEDKDNMDKIK-MYDEIIQNGLI 700
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/75 (36%), Positives = 38/75 (50%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
GS+ S GS S S+ GS+ + GS S S+ GS+ + GS S S+ GS+ +
Sbjct 572 GSMASEGSYSSYESIYPYGSMAAEGSYSSYDSIYPEGSMDTEGSYSSYESIYPDGSMAAE 631
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSV 78
GS S S+ SV
Sbjct 632 GSYTSYDSINPEESV 646
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 27/75 (36%), Positives = 38/75 (50%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
GS+ S GS S S+ GS+ + GS S S+ GS+ + GS S S+ GS+ +
Sbjct 572 GSMASEGSYSSYESIYPYGSMAAEGSYSSYDSIYPEGSMDTEGSYSSYESIYPDGSMAAE 631
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSV 81
GS S S+ SV
Sbjct 632 GSYTSYDSINPEESV 646
> hsa:1308 COL17A1, BA16H23.2, BP180, BPAG2, FLJ60881, KIAA0204,
LAD-1; collagen, type XVII, alpha 1; K07603 collagen, type
XVII, alpha 1
Length=1497
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/74 (40%), Positives = 35/74 (47%), Gaps = 0/74 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
GS G G +GS G G G G+ G G +G G G G GSVG G G +G G
Sbjct 567 GSPGPKGDMGSPGPKGDRGFPGTPGIPGPLGHPGPQGPKGQKGSVGDPGMEGPMGQRGRE 626
Query 61 GSVGSVGSVGSVGS 74
G +G G G GS
Sbjct 627 GPMGPRGEAGPPGS 640
Score = 43.9 bits (102), Expect = 1e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/74 (40%), Positives = 35/74 (47%), Gaps = 0/74 (0%)
Query 13 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
GS G G +GS G G G G+ G G +G G G G GSVG G G +G G
Sbjct 567 GSPGPKGDMGSPGPKGDRGFPGTPGIPGPLGHPGPQGPKGQKGSVGDPGMEGPMGQRGRE 626
Query 73 GSVGSVGSVGSVGS 86
G +G G G GS
Sbjct 627 GPMGPRGEAGPPGS 640
Score = 30.0 bits (66), Expect = 1.9, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 20/47 (42%), Positives = 23/47 (48%), Gaps = 0/47 (0%)
Query 43 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
GS G G +GS G G G G+ G G +G G G G GSV D
Sbjct 567 GSPGPKGDMGSPGPKGDRGFPGTPGIPGPLGHPGPQGPKGQKGSVGD 613
> cel:K03H9.2 col-75; COLlagen family member (col-75)
Length=285
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/78 (41%), Positives = 40/78 (51%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G GS G G+ G GS G G G GS+G G G +G VG G+ G G G G
Sbjct 163 GERGSTGLDGAPGEPGSPGLPGFAGLPGSIGITGIKGVMGEVGEPGAPGIPGEEGLSGPT 222
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSV 78
G GS GS+G++G G+
Sbjct 223 GQPGSPGSIGAMGYEGAY 240
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/78 (41%), Positives = 40/78 (51%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G GS G G+ G GS G G G GS+G G G +G VG G+ G G G G
Sbjct 163 GERGSTGLDGAPGEPGSPGLPGFAGLPGSIGITGIKGVMGEVGEPGAPGIPGEEGLSGPT 222
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
G GS GS+G++G G+
Sbjct 223 GQPGSPGSIGAMGYEGAY 240
Score = 42.4 bits (98), Expect = 4e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/78 (41%), Positives = 40/78 (51%), Gaps = 0/78 (0%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
G GS G G+ G GS G G G GS+G G G +G VG G+ G G G G
Sbjct 163 GERGSTGLDGAPGEPGSPGLPGFAGLPGSIGITGIKGVMGEVGEPGAPGIPGEEGLSGPT 222
Query 70 GSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G GS GS+G++G G+
Sbjct 223 GQPGSPGSIGAMGYEGAY 240
> hsa:78989 COLEC11, CL-K1-I, CL-K1-II, CL-K1-IIa, CL-K1-IIb,
CLK1, DKFZp686N1868, MGC3279; collectin sub-family member 11;
K10066 collectin sub-family member 11
Length=271
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/57 (40%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G G +
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGDI 100
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/57 (40%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G G +
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGDI 100
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/57 (40%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G G +
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGDI 100
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/57 (40%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 13 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G G +
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGDI 100
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/57 (40%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G G +
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGDI 100
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/57 (40%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 19 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G G +
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGDI 100
Score = 42.0 bits (97), Expect = 5e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/57 (40%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 0/57 (0%)
Query 31 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G G +
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGDI 100
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/54 (42%), Positives = 27/54 (50%), Gaps = 0/54 (0%)
Query 37 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G DS
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDS 97
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 27/56 (48%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 34 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G G G+ G G VG G G +G G GSVG G +G +GS G G D
Sbjct 44 GDAGEKGDKGAPGRPGRVGPTGEKGDMGDKGQKGSVGRHGKIGPIGSKGEKGDSGD 99
> dre:567110 col9a3, cb367, sb:cb367, si:ch73-162j3.1, wu:fa04f01;
collagen, type IX, alpha 3; K08131 collagen, type IX, alpha
Length=679
Score = 41.6 bits (96), Expect = 7e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/80 (40%), Positives = 36/80 (45%), Gaps = 0/80 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
GS G G G VG+VG G GS G G G +G G VG G G G G +G +G
Sbjct 226 GSRGLRGLQGPVGAVGDRGIPGSRGKPGIAGIIGKTGDVGEKGPQGFKGPKGEIGKIGPK 285
Query 67 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G
Sbjct 286 GVPGGAGPKGEPGIPGRDGK 305
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/72 (40%), Positives = 33/72 (45%), Gaps = 0/72 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
GS G G G VG+VG G GS G G G +G G VG G G G G +G +G
Sbjct 226 GSRGLRGLQGPVGAVGDRGIPGSRGKPGIAGIIGKTGDVGEKGPQGFKGPKGEIGKIGPK 285
Query 76 GSVGSVGSVGSV 87
G G G G
Sbjct 286 GVPGGAGPKGEP 297
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.006, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/105 (33%), Positives = 41/105 (39%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSV---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G GS G +G G G GS G G G VG+VG G GS G
Sbjct 193 GHKGSKGELGKDGEKGDQGPPGPPGVPGTVGLQGSRGLRGLQGPVGAVGDRGIPGSRGKP 252
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G +G G VG G G G G +G +G G G G +
Sbjct 253 GIAGIIGKTGDVGEKGPQGFKGPKGEIGKIGPKGVPGGAGPKGEP 297
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/93 (34%), Positives = 37/93 (39%), Gaps = 15/93 (16%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV---------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 54
G G GS G +G G G GS G G G VG+VG G GS
Sbjct 190 GHTGHKGSKGELGKDGEKGDQGPPGPPGVPGTVGLQGSRGLRGLQGPVGAVGDRGIPGSR 249
Query 55 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G +G G VG G G G G +G +
Sbjct 250 GKPGIAGIIGKTGDVGEKGPQGFKGPKGEIGKI 282
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.049, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 22/56 (39%), Positives = 26/56 (46%), Gaps = 2/56 (3%)
Query 17 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV--GSVGSVGSVG 70
VGS+G GS+G G G G +G G G VG G G +G G G G G
Sbjct 564 EVGSIGHPGSLGPPGYRGLPGDLGDPGPRGDVGEAGDKGPIGKAVEGPTGDQGDHG 619
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.39, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/86 (41%), Positives = 40/86 (46%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G GS G +G G G G G G G+VG GS G G G VG+VG G GS
Sbjct 190 GHTGHKGSKGELGKDGEKGDQGPPGPPGVPGTVGLQGSRGLRGLQGPVGAVGDRGIPGSR 249
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G +G G VG G G G
Sbjct 250 GKPGIAGIIGKTGDVGEKGPQGFKGP 275
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.41, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/41 (41%), Positives = 21/41 (51%), Gaps = 0/41 (0%)
Query 47 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
VGS+G GS+G G G G +G G G VG G G +
Sbjct 564 EVGSIGHPGSLGPPGYRGLPGDLGDPGPRGDVGEAGDKGPI 604
> hsa:1297 COL9A1, DJ149L1.1.2, EDM6, FLJ40263, MED; collagen,
type IX, alpha 1; K08131 collagen, type IX, alpha
Length=921
Score = 41.2 bits (95), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/76 (39%), Positives = 35/76 (46%), Gaps = 0/76 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 61
G G G G G+ G G GS G+ G G +G+ G G G G VG G G G
Sbjct 566 DAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPG 625
Query 62 SVGSVGSVGSVGSVGS 77
S G +G VGS G G
Sbjct 626 SRGELGPVGSPGLPGK 641
Score = 41.2 bits (95), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/76 (39%), Positives = 35/76 (46%), Gaps = 0/76 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
G G G G G+ G G GS G+ G G +G+ G G G G VG G G G
Sbjct 566 DAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPG 625
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVGS 80
S G +G VGS G G
Sbjct 626 SRGELGPVGSPGLPGK 641
Score = 41.2 bits (95), Expect = 8e-04, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/76 (39%), Positives = 35/76 (46%), Gaps = 0/76 (0%)
Query 8 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 67
G G G G G+ G G GS G+ G G +G+ G G G G VG G G G
Sbjct 566 DAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPG 625
Query 68 SVGSVGSVGSVGSVGS 83
S G +G VGS G G
Sbjct 626 SRGELGPVGSPGLPGK 641
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/53 (43%), Positives = 27/53 (50%), Gaps = 0/53 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 53
GS G+ G G +G+ G G G G VG G G GS G +G VGS G G
Sbjct 589 GSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGELGPVGSPGLPGK 641
Score = 31.6 bits (70), Expect = 0.61, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 37/134 (27%), Positives = 44/134 (32%), Gaps = 48/134 (35%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------- 50
G GS G+ G G +G+ G G G G VG G G GS G +G VGS
Sbjct 586 GEKGSTGAPGKPGQMGNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGELGPVGSPGLPGKLGSL 645
Query 51 -----------------------VGSVGSVGSVGS---------------VGSVGSVGSV 72
VG G G G+ +G G GS
Sbjct 646 GSPGLPGLPGPPGLPGMKGDRGVVGEPGPKGEQGASGEEGEAGERGELGDIGLPGPKGSA 705
Query 73 GSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G G G GS
Sbjct 706 GNPGEPGLRGPEGS 719
Score = 30.0 bits (66), Expect = 2.1, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/121 (29%), Positives = 40/121 (33%), Gaps = 36/121 (29%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------- 41
G+ G G G G VG G G GS G +G VGS G G
Sbjct 601 GNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGELGPVGSPGLPGKLGSLGSPGLPGLPGPPGLP 660
Query 42 --VGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 84
G G VG G G G +G G GS G+ G G G GS
Sbjct 661 GMKGDRGVVGEPGPKGEQGASGEEGEAGERGELGDIGLPGPKGSAGNPGEPGLRGPEGSR 720
Query 85 G 85
G
Sbjct 721 G 721
> tpv:TP01_0407 hypothetical protein
Length=936
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 21/67 (31%), Positives = 36/67 (53%), Gaps = 0/67 (0%)
Query 22 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 81
+V +V V SV ++ V SV +V ++ +V + S ++ S+GSV +V +V V S
Sbjct 166 NTVDTVDRVSSVSTLDRVPSVSNVNTLNPAVNVNRLESTSTLDSLGSVDTVDTVNRVESA 225
Query 82 GSVGSVS 88
+V V
Sbjct 226 NTVNRVD 232
> hsa:1310 COL19A1, COL9A1L, D6S228E; collagen, type XIX, alpha
1
Length=1142
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/97 (36%), Positives = 39/97 (40%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SV 48
G G G G GSVG G G G + G G G G +GS G +
Sbjct 459 GDKGETGLPGFPGSVGPKGQKGEPGEPFTKGEKGDRGEPGVIGSQGVKGEPGDPGPPGLI 518
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G G GS GS+G G G VG G G G G
Sbjct 519 GSPGLKGQQGSAGSMGPRGPPGDVGLPGEHGIPGKQG 555
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/95 (35%), Positives = 38/95 (40%), Gaps = 12/95 (12%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SV 51
G G G G GSVG G G G + G G G G +GS G +
Sbjct 459 GDKGETGLPGFPGSVGPKGQKGEPGEPFTKGEKGDRGEPGVIGSQGVKGEPGDPGPPGLI 518
Query 52 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G G GS GS+G G G VG G G G
Sbjct 519 GSPGLKGQQGSAGSMGPRGPPGDVGLPGEHGIPGK 553
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/86 (40%), Positives = 39/86 (45%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G GSVG G G G + G G G G +GS G G G G G +GS
Sbjct 462 GETGLPGFPGSVGPKGQKGEPGEPFTKGEKGDRGEPGVIGSQGVKGEPGDPGPPGLIGSP 521
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G GS GS+G G G VG G
Sbjct 522 GLKGQQGSAGSMGPRGPPGDVGLPGE 547
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/92 (35%), Positives = 37/92 (40%), Gaps = 12/92 (13%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSV 48
G GSVG G G G + G G G G +GS G +GS G G
Sbjct 468 GFPGSVGPKGQKGEPGEPFTKGEKGDRGEPGVIGSQGVKGEPGDPGPPGLIGSPGLKGQQ 527
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 80
GS GS+G G G VG G G G G G
Sbjct 528 GSAGSMGPRGPPGDVGLPGEHGIPGKQGIKGE 559
> dre:799425 c1qtnf9, zgc:175268; C1q and tumor necrosis factor
related protein 9
Length=336
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.001, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/105 (30%), Positives = 43/105 (40%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SV 45
G +G G G +G G G G VG VG G G +G+ G G +
Sbjct 111 GPLGLKGQKGELGIPGPQGIKGDVGPVGPEGPQGDIGNKGDKGIQGPLGPPGRPGPKGEI 170
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ GS+G G GS G +G G G + + +SDS
Sbjct 171 GQPGNKGSIGVRGERGSKGDMGEQGPKGDMPEIPKSAFSARLSDS 215
> hsa:1298 COL9A2, DJ39G22.4, EDM2, MED; collagen, type IX, alpha
2; K08131 collagen, type IX, alpha
Length=689
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/90 (35%), Positives = 37/90 (41%), Gaps = 0/90 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G G G G G
Sbjct 193 GHAGKRGILGDPGHQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGETGPHGYK 252
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G VG++G+ G G G G G G D
Sbjct 253 GMVGAIGATGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDE 282
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/94 (32%), Positives = 36/94 (38%), Gaps = 12/94 (12%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSV 51
G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G
Sbjct 193 GHAGKRGILGDPGHQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGETGPHGYK 252
Query 52 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G VG++G+ G G G G G G G GS G
Sbjct 253 GMVGAIGATGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDEGSPG 286
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/99 (32%), Positives = 37/99 (37%), Gaps = 12/99 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
G G G G G VG+ G G G G G G G G VG++G+
Sbjct 202 GDPGHQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGETGPHGYKGMVGAIGAT 261
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G GS G G G G G+
Sbjct 262 GPPGEEGPRGPPGRAGEKGDEGSPGIRGPQGITGPKGAT 300
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/85 (36%), Positives = 36/85 (42%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
+G G G G G VG+ G G G G G G G G G G G G VG++G+
Sbjct 201 LGDPGHQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPKGETGPHGYKGMVGAIGA 260
Query 63 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G G G GS
Sbjct 261 TGPPGEEGPRGPPGRAGEKGDEGSP 285
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.21, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 36/86 (41%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G G
Sbjct 184 GPPGLQGVKGHAGKRGILGDPGHQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMAGPK 243
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G VG++G+ G G G
Sbjct 244 GETGPHGYKGMVGAIGATGPPGEEGP 269
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.43, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 31/86 (36%), Positives = 36/86 (41%), Gaps = 0/86 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G
Sbjct 181 GMKGPPGLQGVKGHAGKRGILGDPGHQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPGMA 240
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G VG++G+ G G
Sbjct 241 GPKGETGPHGYKGMVGAIGATGPPGE 266
Score = 29.3 bits (64), Expect = 3.4, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 29/83 (34%), Positives = 34/83 (40%), Gaps = 0/83 (0%)
Query 5 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 64
G G G G G G G +G G G G G VG+ G G G G G G G
Sbjct 179 PPGMKGPPGLQGVKGHAGKRGILGDPGHQGKPGPKGDVGASGEQGIPGPPGPQGIRGYPG 238
Query 65 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G G VG++G+
Sbjct 239 MAGPKGETGPHGYKGMVGAIGAT 261
> xla:380029 colec11, MGC69012; collectin sub-family member 11;
K10066 collectin sub-family member 11
Length=271
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 28/56 (50%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 59
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G G VG
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGDVGQ 99
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 28/56 (50%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 7 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 62
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G G VG
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGDVGQ 99
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 28/56 (50%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 10 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 65
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G G VG
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGDVGQ 99
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 28/56 (50%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 13 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 68
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G G VG
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGDVGQ 99
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 28/56 (50%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 71
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G G VG
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGDVGQ 99
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 28/56 (50%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 19 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 74
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G G VG
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGDVGQ 99
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.002, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 23/56 (41%), Positives = 28/56 (50%), Gaps = 0/56 (0%)
Query 31 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G G VG
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGDVGQ 99
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.033, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 21/53 (39%), Positives = 26/53 (49%), Gaps = 0/53 (0%)
Query 37 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G G G+ G G VG G G +G G GS+G G +G +GS G D
Sbjct 44 GDAGEKGEKGAPGRPGRVGPPGEKGEIGDKGIKGSMGRHGKIGPIGSKGEKGD 96
> mmu:245026 Col6a6, E330019B14, E330026B02Rik; collagen, type
VI, alpha 6; K06238 collagen, type VI, alpha
Length=2265
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G +G G+ G+ G G GS G G G G VG G GS+G G G G G
Sbjct 1554 GRRGHIGPQGNPGTPGPDGLAGSPGLRGPQGPRGEVGEKGEKGSLGMKGPQGPPGPGGQA 1613
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
GS G +GS G+ G G +G G+ G
Sbjct 1614 GSQGHLGSQGNKGEPGDLGEKGAAG 1638
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.005, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/85 (40%), Positives = 42/85 (49%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G +G G+ G+ G G GS G G G G VG G GS+G G G G G GS
Sbjct 1557 GHIGPQGNPGTPGPDGLAGSPGLRGPQGPRGEVGEKGEKGSLGMKGPQGPPGPGGQAGSQ 1616
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G +GS G+ G G +G G+ G G
Sbjct 1617 GHLGSQGNKGEPGDLGEKGAAGFPG 1641
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.009, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/83 (39%), Positives = 41/83 (49%), Gaps = 0/83 (0%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
G G +G G+ G+ G G GS G G G G VG G GS+G G G G G
Sbjct 1554 GRRGHIGPQGNPGTPGPDGLAGSPGLRGPQGPRGEVGEKGEKGSLGMKGPQGPPGPGGQA 1613
Query 64 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
GS G +GS G+ G G +G G+
Sbjct 1614 GSQGHLGSQGNKGEPGDLGEKGA 1636
Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.080, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/105 (34%), Positives = 45/105 (42%), Gaps = 18/105 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 54
G +G G G GS G+ GS G G +G G+ G+ G G GS G G G
Sbjct 1527 GDLGRQGRRGWPGSPGTPGSRRKMVVHGRRGHIGPQGNPGTPGPDGLAGSPGLRGPQGPR 1586
Query 55 GSVGSVGSVGSVG------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G VG G GS+G GS G +GS G+ G G +
Sbjct 1587 GEVGEKGEKGSLGMKGPQGPPGPGGQAGSQGHLGSQGNKGEPGDL 1631
> dre:541546 zgc:113232
Length=655
Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.003, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/105 (34%), Positives = 40/105 (38%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G G+ G G G G +G G G G G GS G+ G GS G
Sbjct 264 GKQGPEGRQGQKGQTGAPGFSGDRGEQGYLGYTGVPGDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEP 323
Query 61 G---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G + G G G G G G VGSVG DS
Sbjct 324 GEDGTVGVPGVVGVPGAFGPKGMKGDRGLRGRTGRVGSVGPQGDS 368
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.010, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/105 (33%), Positives = 40/105 (38%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-- 58
G G G G G+ G G G G +G G G G G GS G+ G GS G G
Sbjct 267 GPEGRQGQKGQTGAPGFSGDRGEQGYLGYTGVPGDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGED 326
Query 59 -------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
+ G G G G G G VGSVG G D+
Sbjct 327 GTVGVPGVVGVPGAFGPKGMKGDRGLRGRTGRVGSVGPQGDSGDA 371
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/102 (34%), Positives = 39/102 (38%), Gaps = 15/102 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G G G GS G+ G GS G G + G G G G G G V
Sbjct 300 GDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGEDGTVGVPGVVGVPGAFGPKGMKGDRGLRGRTGRV 359
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
GSVG G G G G G G G G+ G G G GS+
Sbjct 360 GSVGPQGDSGDAGISGKPGPKGLPGPTGAKGETGPDGEKGSL 401
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.017, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/101 (34%), Positives = 39/101 (38%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
G G GS G+ G GS G G + G G G G G G VGSV
Sbjct 303 GRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGEDGTVGVPGVVGVPGAFGPKGMKGDRGLRGRTGRVGSV 362
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G G G G G G G G+ G G G GS+G
Sbjct 363 GPQGDSGDAGISGKPGPKGLPGPTGAKGETGPDGEKGSLGR 403
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.030, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/100 (34%), Positives = 38/100 (38%), Gaps = 15/100 (15%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-------- 52
G G G+ G G G G +G G G G G GS G+ G GS G G
Sbjct 273 GQKGQTGAPGFSGDRGEQGYLGYTGVPGDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGEDGTVGVP 332
Query 53 -------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
+ G G G G G G VGSVG G G G
Sbjct 333 GVVGVPGAFGPKGMKGDRGLRGRTGRVGSVGPQGDSGDAG 372
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.15, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/105 (32%), Positives = 40/105 (38%), Gaps = 15/105 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSV 45
G G +G G G G G GS G+ G GS G G + G G
Sbjct 288 GEQGYLGYTGVPGDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGEDGTVGVPGVVGVPGAFGPKGMK 347
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G G VGSVG G G G G G G G G+ ++
Sbjct 348 GDRGLRGRTGRVGSVGPQGDSGDAGISGKPGPKGLPGPTGAKGET 392
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.17, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/101 (33%), Positives = 37/101 (36%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSV 45
G G G G G GS G+ G GS G G + G G G G
Sbjct 294 GYTGVPGDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGEDGTVGVPGVVGVPGAFGPKGMKGDRGLR 353
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G VGSVG G G G G G G G G+ G G
Sbjct 354 GRTGRVGSVGPQGDSGDAGISGKPGPKGLPGPTGAKGETGP 394
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.20, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/97 (35%), Positives = 37/97 (38%), Gaps = 12/97 (12%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------VGSVGSV 48
G G G +G G G G G GS G+ G GS G G G+ G
Sbjct 285 GDRGEQGYLGYTGVPGDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGEDGTVGVPGVVGVPGAFGPK 344
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G G VGSVG G G G G G G
Sbjct 345 GMKGDRGLRGRTGRVGSVGPQGDSGDAGISGKPGPKG 381
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.23, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/101 (33%), Positives = 38/101 (37%), Gaps = 15/101 (14%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG-------------- 46
G+ G G G G +G G G G G GS G+ G GS G G
Sbjct 279 GAPGFSGDRGEQGYLGYTGVPGDRGRTGPKGSKGTGGLPGSDGEPGEDGTVGVPGVVGVP 338
Query 47 -SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
+ G G G G G G VGSVG G G G G G
Sbjct 339 GAFGPKGMKGDRGLRGRTGRVGSVGPQGDSGDAGISGKPGP 379
Score = 31.2 bits (69), Expect = 0.95, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 35/125 (28%), Positives = 42/125 (33%), Gaps = 32/125 (25%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG---------------SV 45
GSVG G G G G G G G G+ G G G GS+G S
Sbjct 360 GSVGPQGDSGDAGISGKPGPKGLPGPTGAKGETGPDGEKGSLGRKGGKGAKGDKGDAGSR 419
Query 46 GSVGSVGSVGSVGSVG---------------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS--VS 88
G G G G +G G G G +G G G G G +G
Sbjct 420 GDKGQHGVKGRLGRDGLAGPIGPPGLPGPRGDEGPRGDLGDKGQSGPKGEPGEIGPGLTD 479
Query 89 DSLLQ 93
+ +LQ
Sbjct 480 EQILQ 484
> dre:100330457 collagen alpha-1(V) chain-like
Length=586
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.004, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/82 (41%), Positives = 40/82 (48%), Gaps = 0/82 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+VG G VG G G G+ G+VG G VG G VG G G G+ G G G GS
Sbjct 3 GAVGQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLVGEKGEVGEKGDAGPPGAAGPPGIRGIPGSD 62
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 82
G G+ G +G G G G G
Sbjct 63 GPKGNPGPLGFPGDSGPSGEPG 84
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/75 (42%), Positives = 38/75 (50%), Gaps = 0/75 (0%)
Query 16 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 75
G+VG G VG G G G+ G+VG G VG G VG G G G+ G G G GS
Sbjct 3 GAVGQPGVVGEKGEDGEAGNPGNVGETGLVGEKGEVGEKGDAGPPGAAGPPGIRGIPGSD 62
Query 76 GSVGSVGSVGSVSDS 90
G G+ G +G DS
Sbjct 63 GPKGNPGPLGFPGDS 77
> mmu:12842 Col1a1, Col1a-1, Cola-1, Cola1, Mov-13, Mov13; collagen,
type I, alpha 1; K06236 collagen, type I/II/III/V/XI,
alpha
Length=1453
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.007, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/103 (32%), Positives = 43/103 (41%), Gaps = 18/103 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G+ G G G G GS G G+ G +G G G G G G+ G+ G+
Sbjct 255 GHRGFSGLDGAKGDAGPAGPKGEPGSPGENGAPGQMGPRGLPGERGRPGPPGTAGARGND 314
Query 61 GSV------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G+V G+VG+ G G G+ GS G G
Sbjct 315 GAVGAAGPPGPTGPTGPPGFPGAVGAKGEAGPQGARGSEGPQG 357
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.014, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/104 (31%), Positives = 43/104 (41%), Gaps = 18/104 (17%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G+ G G G G GS G G+ G +G G G G G G+ G+
Sbjct 252 GMKGHRGFSGLDGAKGDAGPAGPKGEPGSPGENGAPGQMGPRGLPGERGRPGPPGTAGAR 311
Query 61 GSVGSV------------------GSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G+V G+VG+ G G G+ GS G
Sbjct 312 GNDGAVGAAGPPGPTGPTGPPGFPGAVGAKGEAGPQGARGSEGP 355
> dre:553354 col4a3, zTumstatin; collagen, type IV, alpha 3
Length=1642
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.008, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/85 (35%), Positives = 38/85 (44%), Gaps = 0/85 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G +G +G G G G+VG +G G G G G G G G ++
Sbjct 487 GPSGPKGEMGMKYEIGEKGFKGDTGAVGLLGLSGQDGLPGIPGFKGPPGEKGKPSALAPK 546
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G G G G GS G +GS GS+G
Sbjct 547 GDQGYPGVGGEQGSTGPMGSQGSMG 571
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.013, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/87 (34%), Positives = 38/87 (43%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G +G +G G G G+VG +G G G G G G G G ++
Sbjct 484 GFPGPSGPKGEMGMKYEIGEKGFKGDTGAVGLLGLSGQDGLPGIPGFKGPPGEKGKPSAL 543
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G G G G GS G +GS GS+
Sbjct 544 APKGDQGYPGVGGEQGSTGPMGSQGSM 570
> mmu:12823 Col19a1; collagen, type XIX, alpha 1
Length=1136
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/100 (33%), Positives = 37/100 (37%), Gaps = 15/100 (15%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG----- 55
G G+ G G G G G GSVG G G G + G G G G +G G
Sbjct 444 GEHGASGPKGEKGDTGLPGFPGSVGPKGHKGEPGEPLTKGEKGDRGEPGLLGPQGIKGEP 503
Query 56 ----------SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
S G G G GS+G G G VG G G
Sbjct 504 GDPGPPGLLGSPGLKGQQGPAGSMGPRGPPGDVGLPGEHG 543
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.011, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/87 (37%), Positives = 37/87 (42%), Gaps = 0/87 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G G G G G GSVG G G G + G G G G +G G G G G
Sbjct 450 GPKGEKGDTGLPGFPGSVGPKGHKGEPGEPLTKGEKGDRGEPGLLGPQGIKGEPGDPGPP 509
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G +GS G G G GS+G G G V
Sbjct 510 GLLGSPGLKGQQGPAGSMGPRGPPGDV 536
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.016, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/89 (37%), Positives = 38/89 (42%), Gaps = 0/89 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
G+ G G G G G GSVG G G G + G G G G +G G G G
Sbjct 447 GASGPKGEKGDTGLPGFPGSVGPKGHKGEPGEPLTKGEKGDRGEPGLLGPQGIKGEPGDP 506
Query 61 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSD 89
G G +GS G G G GS+G G D
Sbjct 507 GPPGLLGSPGLKGQQGPAGSMGPRGPPGD 535
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/102 (33%), Positives = 37/102 (36%), Gaps = 12/102 (11%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG------------SV 48
G G G GSVG G G G + G G G G +G G G S
Sbjct 456 GDTGLPGFPGSVGPKGHKGEPGEPLTKGEKGDRGEPGLLGPQGIKGEPGDPGPPGLLGSP 515
Query 49 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDS 90
G G G GS+G G G VG G G G G G D
Sbjct 516 GLKGQQGPAGSMGPRGPPGDVGLPGEHGIPGKQGVKGEKGDP 557
> mmu:12814 Col11a1, C530001D20Rik, cho; collagen, type XI, alpha
1; K06236 collagen, type I/II/III/V/XI, alpha
Length=1804
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/104 (31%), Positives = 38/104 (36%), Gaps = 21/104 (20%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------- 44
G G G G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1166 GEPGPRGQQGMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGPPGPR 1225
Query 45 -----VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 83
G+ G G GS+GSVG VG G G G+ G G GS
Sbjct 1226 GPQGPNGADGPQGPPGSIGSVGVVGDKGEPGEAGNPGPPGEAGS 1269
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.022, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/104 (31%), Positives = 38/104 (36%), Gaps = 21/104 (20%)
Query 4 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------- 47
G G G G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1166 GEPGPRGQQGMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGPPGPR 1225
Query 48 -----VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G G GS+GSVG VG G G G+ G G GS
Sbjct 1226 GPQGPNGADGPQGPPGSIGSVGVVGDKGEPGEAGNPGPPGEAGS 1269
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.041, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/110 (30%), Positives = 38/110 (34%), Gaps = 24/110 (21%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------- 41
G G G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1169 GPRGQQGMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGPPGPRGPQ 1228
Query 42 -----VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G G GS+GSVG VG G G G+ G G GS G G G
Sbjct 1229 GPNGADGPQGPPGSIGSVGVVGDKGEPGEAGNPGPPGEAGSGGLKGERGE 1278
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.098, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 33/107 (30%), Positives = 37/107 (34%), Gaps = 24/107 (22%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------------V 36
G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1175 GMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGPPGPRGPQGPNGAD 1234
Query 37 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 83
G G GS+GSVG VG G G G+ G G GS G G G G
Sbjct 1235 GPQGPPGSIGSVGVVGDKGEPGEAGNPGPPGEAGSGGLKGERGEKGE 1281
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.13, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/106 (30%), Positives = 37/106 (34%), Gaps = 21/106 (19%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------ 50
G G G G G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1162 AGGDGEPGPRGQQGMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGP 1221
Query 51 ---------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G GS+GSVG VG G G G+ G G
Sbjct 1222 PGPRGPQGPNGADGPQGPPGSIGSVGVVGDKGEPGEAGNPGPPGEA 1267
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.48, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 32/106 (30%), Positives = 38/106 (35%), Gaps = 21/106 (19%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS-------- 53
+ G G G G G G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1158 APGIAGGDGEPGPRGQQGMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMG 1217
Query 54 -------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 86
G+ G G GS+GSVG VG G G G+ G
Sbjct 1218 PPGPPGPRGPQGPNGADGPQGPPGSIGSVGVVGDKGEPGEAGNPGP 1263
Score = 29.6 bits (65), Expect = 2.5, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 36/135 (26%), Positives = 40/135 (29%), Gaps = 45/135 (33%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------------VGSVGSVGSVGSV 39
GS G G G +G G GS G G G G G G
Sbjct 1118 GSPGEDGDKGEIGEPGQKGSKGDKGENGPPGPPGLQGPVGAPGIAGGDGEPGPRGQQGMF 1177
Query 40 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------------VGSV 75
G G G+ G G G +G G G G G G
Sbjct 1178 GQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGPPGPRGPQGPNGADGPQ 1237
Query 76 GSVGSVGSVGSVSDS 90
G GS+GSVG V D
Sbjct 1238 GPPGSIGSVGVVGDK 1252
Score = 28.5 bits (62), Expect = 5.8, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 30/101 (29%), Positives = 35/101 (34%), Gaps = 21/101 (20%)
Query 8 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS-------- 59
+ G G G G G G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1158 APGIAGGDGEPGPRGQQGMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMG 1217
Query 60 -------------VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
G+ G G GS+GSVG VG G G
Sbjct 1218 PPGPPGPRGPQGPNGADGPQGPPGSIGSVGVVGDKGEPGEA 1258
Score = 28.1 bits (61), Expect = 6.3, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 34/132 (25%), Positives = 38/132 (28%), Gaps = 45/132 (34%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS---------------------VGSVGSVGSV 39
G GS G G G +G G GS G G G G G
Sbjct 1115 GPAGSPGEDGDKGEIGEPGQKGSKGDKGENGPPGPPGLQGPVGAPGIAGGDGEPGPRGQQ 1174
Query 40 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS------------------------V 75
G G G G+ G G G +G G G G G
Sbjct 1175 GMFGQKGDEGARGFPGLPGPIGLQGLPGPPGEKGENGDVGPMGPPGPPGPRGPQGPNGAD 1234
Query 76 GSVGSVGSVGSV 87
G G GS+GSV
Sbjct 1235 GPQGPPGSIGSV 1246
> tpv:TP02_0420 hypothetical protein
Length=1743
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 3 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 45
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 6 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 48
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 9 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 51
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 12 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 54
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 15 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 57
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 18 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 60
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 21 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 63
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 24 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 66
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 27 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 69
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 30 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 72
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.023, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/43 (39%), Positives = 28/43 (65%), Gaps = 0/43 (0%)
Query 45 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 87
+ S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1156 IFSFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.051, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 17/41 (41%), Positives = 27/41 (65%), Gaps = 0/41 (0%)
Query 2 SVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 42
S ++ + +V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1158 SFQNITYQANDNNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.11, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 16/30 (53%), Positives = 23/30 (76%), Gaps = 0/30 (0%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV 30
+V SV SV SV SV +V +VGS+GS+G++
Sbjct 1169 NNVNSVDSVNSVDSVNNVDTVGSLGSLGNI 1198
> dre:792513 collagen, type XXI, alpha 1-like
Length=1056
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.024, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 39/117 (33%), Positives = 48/117 (41%), Gaps = 7/117 (5%)
Query 1 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSV-GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGS 59
G G G G G+ G+ G G G GS G G G G G +G +G VG G G
Sbjct 601 GPKGQQGESGFPGAQGATGLPGFKGHKRGSPGDPGLKGPDGQKGDMGHIGVVGPRGFPGQ 660
Query 60 VGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVSDSLLQN---GLLLSASVLTIEPRPRCET 113
G G G+ G G G S + +L+N LL + S EP CET
Sbjct 661 DGLPGQPGNPGFPGKPGKPPSDEYFIKLCRDVLRNQLPQLLQTMSSQRCEP---CET 714
> dre:564005 col6a6, im:7152043, si:dkey-202m9.3; collagen, type
VI, alpha 6; K06238 collagen, type VI, alpha
Length=2553
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.044, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 28/58 (48%), Positives = 32/58 (55%), Gaps = 0/58 (0%)
Query 28 GSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVGSVG 85
G VG G GS GS G G+ GS+GS G G G G GS+GS GS G G G+ G
Sbjct 1768 GFVGLPGPQGSPGSPGRPGTKGSLGSRGQKGQPGDPGEKGSLGSAGSRGLPGKDGNDG 1825
Lambda K H
0.303 0.128 0.335
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Effective search space used: 2037741960
Database: egene_temp_file_orthology_annotation_similarity_blast_database_866
Posted date: Sep 17, 2011 2:57 PM
Number of letters in database: 82,071,388
Number of sequences in database: 164,496
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Neighboring words threshold: 11
Window for multiple hits: 40